基于结构域信息的蛋白质复合物识别与疾病基因预测
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 课题研究背景及意义 | 第10-12页 |
| 1.2 主要创新点 | 第12-13页 |
| 1.3 本文的组织结构 | 第13-14页 |
| 第二章 蛋白质复合物与疾病基因预测研究进展 | 第14-23页 |
| 2.1 结构域相互作用网络的相关研究 | 第14-16页 |
| 2.1.1 蛋白质结构域 | 第14-15页 |
| 2.1.2 蛋白质结构域相互作用网络应用 | 第15-16页 |
| 2.2 蛋白质复合物识别算法的相关研究 | 第16-20页 |
| 2.2.1 蛋白质相互作用网络拓扑特征 | 第16-17页 |
| 2.2.2 蛋白质复合物识别常用算法 | 第17-20页 |
| 2.3 疾病基因预测研究 | 第20-23页 |
| 2.3.1 疾病基因 | 第20-21页 |
| 2.3.2 疾病基因预测方法 | 第21-23页 |
| 第三章 基于头脑风暴策略的蛋白质复合物识别 | 第23-46页 |
| 3.1 智能优化思想 | 第23-26页 |
| 3.1.1 群智能优化方法 | 第23-24页 |
| 3.1.2 头脑风暴策略 | 第24-26页 |
| 3.2 基于BS优化策略的算法设计与实现 | 第26-33页 |
| 3.2.1 蛋白质相互作用网络的构建 | 第26-28页 |
| 3.2.2 算法设计与实现 | 第28-33页 |
| 3.3 实验结果及分析 | 第33-45页 |
| 3.3.1 实验测试数据 | 第33-34页 |
| 3.3.2 算法评价指标 | 第34-35页 |
| 3.3.3 算法关键参数 | 第35-37页 |
| 3.3.4 IPC-BSS算法的有效性分析 | 第37-40页 |
| 3.3.5 IPC-BSS算法的功能富集性分析 | 第40-45页 |
| 3.4 本章小结 | 第45-46页 |
| 第四章 基于结构域相互作用网络的疾病基因预测 | 第46-61页 |
| 4.1 改进的随机游走策略 | 第46-48页 |
| 4.2 UThrRW算法设计与实现 | 第48-53页 |
| 4.2.1 相互作用网络的构建 | 第48-51页 |
| 4.2.2 UThrRW算法 | 第51-53页 |
| 4.3 实验分析 | 第53-60页 |
| 4.3.1 实验数据 | 第53页 |
| 4.3.2 算法参数分析 | 第53-55页 |
| 4.3.3 不同算法间比较分析 | 第55-57页 |
| 4.3.4 疾病实例分析 | 第57-60页 |
| 4.4 本章小结 | 第60-61页 |
| 第五章 总结与展望 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-70页 |
| 在校期间发表论文成果及参与的科研项目 | 第70-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
