| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-22页 |
| 1.1 线粒体 | 第10页 |
| 1.2 线粒体基因组 | 第10-13页 |
| 1.2.1 线粒体基因组的基本特征 | 第10-11页 |
| 1.2.2 动物线粒体基因组的结构特征和基因组成 | 第11-12页 |
| 1.2.2.1 核糖体RNA | 第11页 |
| 1.2.2.2 转运RNA | 第11-12页 |
| 1.2.2.3 蛋白编码基因 | 第12页 |
| 1.2.2.4 控制区 | 第12页 |
| 1.2.3 线粒体基因组的进化 | 第12-13页 |
| 1.2.4 线粒体基因组的碱基组成偏向性 | 第13页 |
| 1.3 线粒体基因组测序方法 | 第13-14页 |
| 1.3.1 物理分离法 | 第13页 |
| 1.3.2 常规PCR测序法 | 第13-14页 |
| 1.3.3 基于LA-PCR技术的方法 | 第14页 |
| 1.4 线粒体基因组中的分子标记 | 第14-15页 |
| 1.4.1 线粒体全基因组序列 | 第14页 |
| 1.4.2 线粒体基因的重排 | 第14-15页 |
| 1.4.2.1 基因重排的类型 | 第15页 |
| 1.4.2.2 基因重排的假说 | 第15页 |
| 1.5 鳞翅目系统发育研究 | 第15-17页 |
| 1.5.1 鳞翅目昆虫简介 | 第15-16页 |
| 1.5.2 鳞翅目分类 | 第16页 |
| 1.5.3 线粒体基因在鳞翅目系统发育中的应用 | 第16-17页 |
| 1.6 系统发育分析 | 第17-21页 |
| 1.6.1 基因树 | 第17页 |
| 1.6.2 内群和外群的选择 | 第17页 |
| 1.6.3 建树基因的选择 | 第17-18页 |
| 1.6.4 基因序列比对 | 第18页 |
| 1.6.5 建树方法 | 第18-20页 |
| 1.6.6 系统发育树的评估 | 第20-21页 |
| 1.7 比较基因组学 | 第21-22页 |
| 第二章 引言 | 第22-24页 |
| 2.1 研究的目的及意义 | 第22-23页 |
| 2.2 主要研究内容 | 第23页 |
| 2.2.1 引物扩增获得鳞翅目三种昆虫线粒体基因组序列 | 第23页 |
| 2.2.2 基于鳞翅目的全线粒体基因组数据对鳞翅目系统发育关系进行了重建 | 第23页 |
| 2.2.3 比较基因组学分析 | 第23页 |
| 2.3 技术路线 | 第23-24页 |
| 第三章 鳞翅目三种昆虫线粒体基因组的扩增与结构分析 | 第24-49页 |
| 3.1 实验材料 | 第24页 |
| 3.1.1 鳞翅目三种昆虫组织的收集与处理 | 第24页 |
| 3.2 仪器与试剂 | 第24-25页 |
| 3.2.1 主要实验仪器 | 第24页 |
| 3.2.2 主要生化试剂 | 第24-25页 |
| 3.2.3 常用溶液的配置 | 第25页 |
| 3.3 实验方法 | 第25-31页 |
| 3.3.1 鳞翅目三种昆虫基因组DNA的提取和检测 | 第25-26页 |
| 3.3.2 PCR引物的设计 | 第26-29页 |
| 3.3.3 PCR扩增 | 第29页 |
| 3.3.4 PCR扩增后目的产物的纯化 | 第29-30页 |
| 3.3.5 目的片段的连接和转化 | 第30页 |
| 3.3.6 菌落PCR鉴定 | 第30-31页 |
| 3.3.7 序列分析 | 第31页 |
| 3.4 结果 | 第31-49页 |
| 3.4.1 鳞翅目三种昆虫基因组DNA的检测 | 第31-32页 |
| 3.4.2 柳二尾舟蛾全线粒体基因组的组成 | 第32-37页 |
| 3.4.2.1 基因结构和碱基组成 | 第32-33页 |
| 3.4.2.2 蛋白编码基因和密码子使用情况 | 第33页 |
| 3.4.2.3 核糖体RNA和转运RNA | 第33-35页 |
| 3.4.2.4 基因间重叠与间隔 | 第35-37页 |
| 3.4.2.5 AT富集区 | 第37页 |
| 3.4.3 甘薯天蛾全线粒体基因组的组成 | 第37-43页 |
| 3.4.3.1 基因结构和碱基组成 | 第37-38页 |
| 3.4.3.2 蛋白编码基因和密码子使用情况 | 第38-39页 |
| 3.4.3.3 核糖体RNA和转运RNA | 第39-41页 |
| 3.4.3.4 基因间重叠与间隔 | 第41-42页 |
| 3.4.3.5 AT富集区 | 第42-43页 |
| 3.4.4 臭椿皮蛾全线粒体基因组的组成 | 第43-49页 |
| 3.4.4.1 基因结构和碱基组成 | 第43-44页 |
| 3.4.4.2 蛋白编码基因和密码子使用情况 | 第44-45页 |
| 3.4.4.3 核糖体RNA和转运RNA | 第45-46页 |
| 3.4.4.4 基因间重叠与间隔 | 第46-48页 |
| 3.4.4.5 AT富集区 | 第48-49页 |
| 第四章 基于线粒体蛋白质编码基因的鳞翅目系统发育分析 | 第49-54页 |
| 4.1 实验方法 | 第49-51页 |
| 4.1.1 选择蛋白质编码基因构建进化树的的原因 | 第49页 |
| 4.1.2 数据来源和外群的选择 | 第49-51页 |
| 4.1.3 数据处理 | 第51页 |
| 4.2 结果 | 第51-54页 |
| 4.2.1 基于柳二尾舟蛾线粒体蛋白编码基因数据的系统发生关系重建 | 第51-52页 |
| 4.2.2 基于臭椿皮蛾线粒体蛋白编码基因数据的系统发生关系重建 | 第52页 |
| 4.2.3 基于甘薯天蛾线粒体蛋白编码基因数据的系统发生关系重建 | 第52-54页 |
| 第五章 鳞翅目昆虫线粒体基因组的比较研究 | 第54-77页 |
| 5.1 实验方法 | 第54-55页 |
| 5.1.1 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组序列的整体比较 | 第54页 |
| 5.1.2 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组中蛋白质编码基因比较 | 第54页 |
| 5.1.3 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组中RNA的比较 | 第54页 |
| 5.1.4 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组中的基因间重叠与间隔区比较 | 第54页 |
| 5.1.5 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组中AT富集区的比较 | 第54-55页 |
| 5.2 结果 | 第55-77页 |
| 5.2.1 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组序列的整体比较 | 第55-61页 |
| 5.2.2 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组中蛋白质编码基因比较 | 第61-74页 |
| 5.2.3 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组中RNA的比较 | 第74页 |
| 5.2.4 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组中的基因间重叠与间隔区比较 | 第74-75页 |
| 5.2.5 不同鳞翅目昆虫线粒体基因组中AT富集区的比较 | 第75-77页 |
| 讨论 | 第77-80页 |
| 结论 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 个人简介 | 第96页 |
| 参与的研究课题 | 第96-97页 |
| 发表论文 | 第97-99页 |
