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基于ITS、trnL-F、rpl16序列分析火石花的亲缘关系

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 绪论第13-25页
    1.1 火石花的研究进展第13-17页
        1.1.1 火石花的生物学特征第13-14页
        1.1.2 火石花的应用价值第14-16页
        1.1.3 火石花的民俗文化第16-17页
    1.2 系统关系研究常用的DNA标记方法第17-22页
        1.2.1 核糖体DNA (rDNA)分子标记第18-19页
        1.2.2 叶绿体DNA (cpDNA)分子标记第19-22页
    1.3 系统发育树第22-23页
    1.4 问题的由来第23页
    1.5 本研究的目的意义及技术路线第23-25页
第二章 火石花的rDNA ITS序列分析第25-43页
    2.1 试验材料及设备第25-28页
        2.1.1 试验材料第25-27页
        2.1.2 试验设备及主要溶液配制第27-28页
    2.2 试验方法第28-31页
        2.2.1 DNA的提取第28-29页
        2.2.2 rDNA ITS序列PCR扩增及纯化测序第29-30页
        2.2.3 琼脂糖凝胶电泳及染色第30-31页
        2.2.4 PCR产物的回收与纯化第31页
    2.3 数据处理第31-32页
    2.4 结果与分析第32-41页
        2.4.1 rDNA ITS序列测序及碱基频率第32-34页
        2.4.2 rDNA ITS的序列变异第34-36页
        2.4.3 遗传距离与地理距离的相关性分析第36-37页
        2.4.4 火石花9个居群的系统发生树第37-38页
        2.4.5 火石花属植物的序列分析第38-40页
        2.4.6 火石花属植物的亲缘关系分析第40-41页
    2.5 讨论第41-43页
        2.5.1 ITS序列对不同居群火石花的鉴别第41页
        2.5.2 火石花群体结构形成的原因分析第41页
        2.5.3 根据rDNA ITS序列对火石花属植物亲缘关系研究第41-43页
第三章 火石花的cpDNA trnL-F及rpl16序列分析第43-59页
    3.1 试验材料第43-44页
    3.2 试验程序第44-45页
    3.3 数据处理第45-46页
    3.4 结果与分析第46-58页
        3.4.1 cpDNA片段的扩增与测序第46-47页
        3.4.2 cpDNA长度及碱基频率第47-48页
        3.4.3 cpDNA序列变异第48-52页
        3.4.4 遗传距离与地理距离的相关性分析第52-54页
        3.4.5 火石花9个居群亲缘关系分析第54-55页
        3.4.6 火石花属植物的序列分析第55-57页
        3.4.7 根据trnL-F序列对火石花属植物的亲缘关系的探讨第57-58页
    3.5 讨论第58-59页
        3.5.1 cpDNA trnL-F、rpl16序列对火石花亲缘关系分析第58页
        3.5.2 根据cpDNA trnL-F序列对火石花属植物分析第58-59页
第四章 结论与展望第59-65页
    4.1 结论第59-62页
        4.1.1 三段序列对9个居群火石花的对比分析第59-60页
        4.1.2 ITS序列和trnL-F序列对火石花属植物的对比分析第60-61页
        4.1.3 野生火石花的保护性开发策略探讨第61页
        4.1.4 trnL-F序列对火石花属植物的鉴定作用第61-62页
    4.2 存在的不足第62页
    4.3 展望第62-65页
致谢第65-67页
参考文献第67-75页
附录A 攻读硕士学位期间科研情况第75-77页
附录B 火石花属植物全序列第77-85页
附录C 实验附图第85-87页
附录D 符号说明第87页

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