中文摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第1章 引言 | 第10-26页 |
1.1 艾滋病与免疫缺陷病毒简介 | 第10-13页 |
1.1.1 艾滋病与免疫缺陷病毒 | 第10-12页 |
1.1.2 HIV辅助蛋白及天然宿主免疫限制因子 | 第12-13页 |
1.2 HIV宿主限制因子 | 第13-18页 |
1.2.1 APOBEC3G | 第13-15页 |
1.2.2 TRIM5α | 第15-16页 |
1.2.3 BST-2 | 第16-18页 |
1.3 SAMHD1 | 第18-22页 |
1.3.1 天然HIV病毒限制因子SAMHD1的发现 | 第18页 |
1.3.2 SAMHD1的结构 | 第18-20页 |
1.3.3 SAMHD1的抗病毒机制 | 第20页 |
1.3.4 SAMHD1的调控 | 第20-21页 |
1.3.5 SAMHD1与拮抗因子Vpx的相互作用 | 第21-22页 |
1.4 MxB | 第22-24页 |
1.4.1 天然HIV-1 限制因子Mx B的发现 | 第22-23页 |
1.4.2 MxB的结构 | 第23页 |
1.4.3 MxB的抗病毒机制 | 第23-24页 |
1.5 研究内容与意义 | 第24-26页 |
第2章 材料与方法 | 第26-44页 |
2.1 实验材料 | 第26-33页 |
2.1.1 质粒载体 | 第26页 |
2.1.2 cDNA | 第26-27页 |
2.1.3 菌株及细胞 | 第27页 |
2.1.4 实验试剂 | 第27-30页 |
2.1.5 实验仪器 | 第30-31页 |
2.1.6 引物 | 第31-33页 |
2.2 实验方法 | 第33-44页 |
2.2.1 基因克隆 | 第33-36页 |
2.2.1.1 PCR | 第33-34页 |
2.2.1.2 限制性内切酶酶切体系 | 第34页 |
2.2.1.3 DNA片段胶回收 | 第34-35页 |
2.2.1.4 T4连接酶连接体系 | 第35页 |
2.2.1.5 DpnⅠ酶消化体系 | 第35页 |
2.2.1.6 感受态细胞的转化 | 第35-36页 |
2.2.1.7 质粒提取(以小提质粒为例) | 第36页 |
2.2.2 蛋白的表达与纯化 | 第36-37页 |
2.2.2.1 蛋白最佳表达条件的筛选 | 第36-37页 |
2.2.2.2 蛋白的大量表达与纯化 | 第37页 |
2.2.3 蛋白dNTPase活性分析 | 第37-38页 |
2.2.4 细胞转染(以六孔板为例) | 第38-39页 |
2.2.5 Western Blot | 第39页 |
2.2.6 免疫共沉淀(以HA为例) | 第39-40页 |
2.2.7 HIV衣壳蛋白结合实验 | 第40页 |
2.2.8 蛋白质结晶 | 第40-41页 |
2.2.8.1 结晶条件筛选 | 第40-41页 |
2.2.8.2 晶体优化 | 第41页 |
2.2.9 蛋白晶体的数据收集与结构解析 | 第41-44页 |
2.2.9.1 衍射数据的收集与处理 | 第41页 |
2.2.9.2 晶体结构的解析 | 第41-44页 |
第3章 SAMHD1的抗病毒机制研究 | 第44-66页 |
3.1 SAMHD1调节dNTP机制的结构生物学研究 | 第44-47页 |
3.1.1 SAMHD1的克隆、表达及纯化 | 第44页 |
3.1.2 SAMHD1关键残基对其功能的影响 | 第44-46页 |
3.1.3 不同状态SAMHD1亚基之间的作用方式 | 第46-47页 |
3.1.4 SAMHD1高效调节dNTP机制探讨 | 第47页 |
3.2 SAMHD1核酶活性的结构生物学研究 | 第47-51页 |
3.2.1 SAMHD1的克隆、表达、纯化以及结晶 | 第48页 |
3.2.2 SAMHD1核酸复合物晶体结构解析 | 第48页 |
3.2.3 SAMHD1核酸复合物结构分析 | 第48-51页 |
3.3 SAMHD1与SIVmac/rcm Vpx的“抑制-反抑制”功能研究 | 第51-54页 |
3.3.1 SAMHD1与SIVmac Vpx的相互作用机制 | 第51-53页 |
3.3.1.1 基因克隆与蛋白表达纯化 | 第51-52页 |
3.3.1.2 SAMHD1-SIVmac Vpx-DCAF1的作用机制 | 第52-53页 |
3.3.2 SAMHD1与SIVrcm Vpx的相互作用机制 | 第53-54页 |
3.3.2.1 基因克隆与蛋白表达纯化 | 第53页 |
3.3.2.2 重组蛋白SIVrcm Vpx-SAMHD1与DCAF1作用机制 | 第53-54页 |
3.4 SAMHD1可通过非酶活机制“阻击”HIV? | 第54-66页 |
3.4.1 SAMHD1与CA识别作用的发现 | 第54-56页 |
3.4.1.1 基因克隆与细胞转染 | 第55页 |
3.4.1.2 HA-SAMHD1与HIV-1 CA免疫共沉淀 | 第55-56页 |
3.4.2 SAMHD1与CA的作用区域以及形式 | 第56-61页 |
3.4.2.1 基因克隆与蛋白表达纯化 | 第56-57页 |
3.4.2.2 SAMHD1与CA具体作用区域及形式 | 第57-61页 |
3.4.3 SAMHD1、TRIM5α、MxB与CA的识别作用 | 第61-66页 |
3.4.3.1 基因克隆与蛋白表达纯化 | 第62页 |
3.4.3.2 SAMHD1、TRIM5α、MxB与CA的识别作用的关系 | 第62-66页 |
第4章 MxB的抗病毒机制研究 | 第66-74页 |
4.1 MxB与HIV衣壳蛋白相互作用的功能研究 | 第66-69页 |
4.1.1 基因克隆及蛋白表达纯化 | 第66-67页 |
4.1.2 MxB与HIV-1 CA相互作用的探究 | 第67-69页 |
4.2 MxB抗病毒机制的模型 | 第69-74页 |
4.2.1 MxB可自组装成高级寡聚体 | 第69-70页 |
4.2.2 MxB的高级寡聚体结构 | 第70-72页 |
4.2.3 MxB—新型模式识别受体? | 第72-74页 |
第5章 研究结论及意义 | 第74-76页 |
参考文献 | 第76-94页 |
发表论文和参加科研情况说明 | 第94-96页 |
致谢 | 第96-97页 |