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HIV宿主天然限制因子SAMHD1与MxB结构与功能的研究

中文摘要第4-5页
ABSTRACT第5-6页
第1章 引言第10-26页
    1.1 艾滋病与免疫缺陷病毒简介第10-13页
        1.1.1 艾滋病与免疫缺陷病毒第10-12页
        1.1.2 HIV辅助蛋白及天然宿主免疫限制因子第12-13页
    1.2 HIV宿主限制因子第13-18页
        1.2.1 APOBEC3G第13-15页
        1.2.2 TRIM5α第15-16页
        1.2.3 BST-2第16-18页
    1.3 SAMHD1第18-22页
        1.3.1 天然HIV病毒限制因子SAMHD1的发现第18页
        1.3.2 SAMHD1的结构第18-20页
        1.3.3 SAMHD1的抗病毒机制第20页
        1.3.4 SAMHD1的调控第20-21页
        1.3.5 SAMHD1与拮抗因子Vpx的相互作用第21-22页
    1.4 MxB第22-24页
        1.4.1 天然HIV-1 限制因子Mx B的发现第22-23页
        1.4.2 MxB的结构第23页
        1.4.3 MxB的抗病毒机制第23-24页
    1.5 研究内容与意义第24-26页
第2章 材料与方法第26-44页
    2.1 实验材料第26-33页
        2.1.1 质粒载体第26页
        2.1.2 cDNA第26-27页
        2.1.3 菌株及细胞第27页
        2.1.4 实验试剂第27-30页
        2.1.5 实验仪器第30-31页
        2.1.6 引物第31-33页
    2.2 实验方法第33-44页
        2.2.1 基因克隆第33-36页
            2.2.1.1 PCR第33-34页
            2.2.1.2 限制性内切酶酶切体系第34页
            2.2.1.3 DNA片段胶回收第34-35页
            2.2.1.4 T4连接酶连接体系第35页
            2.2.1.5 DpnⅠ酶消化体系第35页
            2.2.1.6 感受态细胞的转化第35-36页
            2.2.1.7 质粒提取(以小提质粒为例)第36页
        2.2.2 蛋白的表达与纯化第36-37页
            2.2.2.1 蛋白最佳表达条件的筛选第36-37页
            2.2.2.2 蛋白的大量表达与纯化第37页
        2.2.3 蛋白dNTPase活性分析第37-38页
        2.2.4 细胞转染(以六孔板为例)第38-39页
        2.2.5 Western Blot第39页
        2.2.6 免疫共沉淀(以HA为例)第39-40页
        2.2.7 HIV衣壳蛋白结合实验第40页
        2.2.8 蛋白质结晶第40-41页
            2.2.8.1 结晶条件筛选第40-41页
            2.2.8.2 晶体优化第41页
        2.2.9 蛋白晶体的数据收集与结构解析第41-44页
            2.2.9.1 衍射数据的收集与处理第41页
            2.2.9.2 晶体结构的解析第41-44页
第3章 SAMHD1的抗病毒机制研究第44-66页
    3.1 SAMHD1调节dNTP机制的结构生物学研究第44-47页
        3.1.1 SAMHD1的克隆、表达及纯化第44页
        3.1.2 SAMHD1关键残基对其功能的影响第44-46页
        3.1.3 不同状态SAMHD1亚基之间的作用方式第46-47页
        3.1.4 SAMHD1高效调节dNTP机制探讨第47页
    3.2 SAMHD1核酶活性的结构生物学研究第47-51页
        3.2.1 SAMHD1的克隆、表达、纯化以及结晶第48页
        3.2.2 SAMHD1核酸复合物晶体结构解析第48页
        3.2.3 SAMHD1核酸复合物结构分析第48-51页
    3.3 SAMHD1与SIVmac/rcm Vpx的“抑制-反抑制”功能研究第51-54页
        3.3.1 SAMHD1与SIVmac Vpx的相互作用机制第51-53页
            3.3.1.1 基因克隆与蛋白表达纯化第51-52页
            3.3.1.2 SAMHD1-SIVmac Vpx-DCAF1的作用机制第52-53页
        3.3.2 SAMHD1与SIVrcm Vpx的相互作用机制第53-54页
            3.3.2.1 基因克隆与蛋白表达纯化第53页
            3.3.2.2 重组蛋白SIVrcm Vpx-SAMHD1与DCAF1作用机制第53-54页
    3.4 SAMHD1可通过非酶活机制“阻击”HIV?第54-66页
        3.4.1 SAMHD1与CA识别作用的发现第54-56页
            3.4.1.1 基因克隆与细胞转染第55页
            3.4.1.2 HA-SAMHD1与HIV-1 CA免疫共沉淀第55-56页
        3.4.2 SAMHD1与CA的作用区域以及形式第56-61页
            3.4.2.1 基因克隆与蛋白表达纯化第56-57页
            3.4.2.2 SAMHD1与CA具体作用区域及形式第57-61页
        3.4.3 SAMHD1、TRIM5α、MxB与CA的识别作用第61-66页
            3.4.3.1 基因克隆与蛋白表达纯化第62页
            3.4.3.2 SAMHD1、TRIM5α、MxB与CA的识别作用的关系第62-66页
第4章 MxB的抗病毒机制研究第66-74页
    4.1 MxB与HIV衣壳蛋白相互作用的功能研究第66-69页
        4.1.1 基因克隆及蛋白表达纯化第66-67页
        4.1.2 MxB与HIV-1 CA相互作用的探究第67-69页
    4.2 MxB抗病毒机制的模型第69-74页
        4.2.1 MxB可自组装成高级寡聚体第69-70页
        4.2.2 MxB的高级寡聚体结构第70-72页
        4.2.3 MxB—新型模式识别受体?第72-74页
第5章 研究结论及意义第74-76页
参考文献第76-94页
发表论文和参加科研情况说明第94-96页
致谢第96-97页

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