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陕西地区汉族人群基因多态性与乳腺癌发病风险的病例对照关联研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
中英文对照第8-13页
第一章 绪论第13-17页
    1.1 乳腺癌发病情况第13页
    1.2 乳腺癌遗传因素的国内外研究进展第13-15页
    1.3 研究对象所处地理位置(陕西)介绍第15页
    1.4 实验设计第15-17页
第二章 实验内容及统计方法第17-31页
    2.1 实验材料和方法第17-18页
        2.1.1 实验主要试剂第17页
        2.1.2 主要实验仪器及生产厂家第17-18页
    2.2 研究对象第18-19页
        2.2.1 乳腺癌病例组第18页
        2.2.2 正常对照组第18页
        2.2.3 流行病学资料及血液样本的收集第18-19页
    2.3 实验方法第19-26页
        2.3.1 使用QIAgen试剂盒进行DNA提取第19-20页
        2.3.2 DNA浓度及纯度的测定第20页
        2.3.3 乳腺癌相关位点的选择第20-21页
        2.3.4 引物设计与定制及质谱分型原理第21-22页
        2.3.5 预实验优化第22-23页
        2.3.6 SNP分型实验第23-26页
    2.4 结果收集与数据分析第26-31页
        2.4.1 数据整理第26页
        2.4.2 均衡性检验第26页
        2.4.3 质控(位点/样本过滤)第26-27页
        2.4.4 频数/频率统计第27页
        2.4.5 卡方检验第27页
        2.4.6 Hardy-Weinberg(HW)平衡检验第27页
        2.4.7 单个SNP位点分析第27-28页
        2.4.8 连锁不平衡分析及单倍体风险评估第28页
        2.4.9 统计分析方法及软件介绍第28-31页
第三章 实验结果及分析第31-57页
    3.1 样本和位点的基本信息第31-33页
    3.2 引物信息第33-36页
    3.3 Massarray质谱分型结果第36-39页
    3.4 数据分析第39-57页
        3.4.1 哈迪-温伯格平衡检验第39-40页
        3.4.2 等位基因及遗传模型下的卡方分析结果总结第40-47页
        3.4.3 遗传模型下的Logistic回归模型分析第47-52页
        3.4.4 单体型分析第52-53页
        3.4.5 雌激素受体(ER)分层分析第53-54页
        3.4.6 孕激素受体(PR)分层分析第54-55页
        3.4.7 TNM分期分层分析第55-57页
第四章 讨论第57-61页
参考文献第61-67页
附录第67-88页
攻读硕士学位期间取得的学术成果第88-89页
致谢第89页

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