中文摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-7页 |
缩略词表 | 第7-13页 |
第一部分 文献综述 | 第13-21页 |
第一章 革兰氏阴性菌血红素转运系统及hemophore的研究进展 | 第13-21页 |
1. 革兰氏阴性菌血红素转运系统 | 第13-19页 |
·血红素来源 | 第14-15页 |
·血红素摄取 | 第15-16页 |
·直接的血红素摄取 | 第15页 |
·Hemophore介导的血红素摄取 | 第15-16页 |
·血红素转运 | 第16-18页 |
·血红素受体 | 第16页 |
·TonB系统 | 第16-17页 |
·ABC转运体 | 第17页 |
·血红素的储存和降解 | 第17-18页 |
·血红素转运的调控 | 第18-19页 |
·Fur调控 | 第18页 |
·σ调控 | 第18页 |
·复合调控 | 第18-19页 |
2. 革兰氏阴性菌hemophore的研究进展 | 第19-21页 |
·HasA型hemophore | 第19页 |
·HuxA型hemophore | 第19页 |
·HmuY型hemophore | 第19-21页 |
第二部分 试验部分 | 第21-68页 |
第二章 鸭疫里默氏杆菌hemophore的发现与鉴定 | 第21-32页 |
1 试验材料 | 第21-24页 |
·菌株 | 第21页 |
·主要试剂 | 第21-22页 |
·试剂配制 | 第22-23页 |
·细菌培养相关试剂配制 | 第22页 |
·蛋白电泳相关试剂配制 | 第22-23页 |
·Western-blot相关试剂配制 | 第23页 |
·其它相关试剂配制 | 第23页 |
·主要仪器 | 第23-24页 |
2 试验方法 | 第24-26页 |
·鸭疫里默氏杆菌分泌蛋白的提取 | 第24页 |
·胞外heme绑定蛋白的鉴定 | 第24-25页 |
·Heme琼脂糖亲和层析 | 第25页 |
·野生型hemophore分泌的优化 | 第25页 |
·野生型hemophore稳定性的检测 | 第25-26页 |
3 结果与分析 | 第26-30页 |
·鸭疫里默氏杆菌分泌蛋白的提取 | 第26-27页 |
·胞外heme绑定蛋白的鉴定 | 第27页 |
·Heme琼脂糖亲和层析 | 第27-28页 |
·野生型hemophore分泌的优化 | 第28-29页 |
·野生型hemophore稳定性的检测 | 第29-30页 |
4 讨论 | 第30-32页 |
第三章 鸭疫里默氏杆菌潜在hemophore的生物信息学分析 | 第32-44页 |
1 试验材料 | 第32-33页 |
·主要生物信息学分析软件及在线分析工具 | 第32-33页 |
2 试验方法 | 第33-34页 |
·潜在hemophore基因的查找 | 第33页 |
·BLASTN分析 | 第33页 |
·蛋白质疏水性分析 | 第33页 |
·蛋白质抗原性及表面性分析 | 第33页 |
·蛋白质信号肽预测 | 第33-34页 |
·蛋白质亚细胞定位 | 第34页 |
·蛋白质结构预测 | 第34页 |
3 结果与分析 | 第34-43页 |
·鸭疫里默氏杆菌中的潜在hemophore基因 | 第34-36页 |
·鸭疫里默氏杆菌潜在hemophore基因家族 | 第36-38页 |
·蛋白质疏水性分析 | 第38-39页 |
·蛋白质抗原性及表面抗原分析 | 第39-40页 |
·蛋白质信号肽预测 | 第40页 |
·蛋白质亚细胞定位 | 第40-41页 |
·蛋白质结构预测 | 第41-43页 |
4 讨论 | 第43-44页 |
第四章 潜在hemophore基因的克隆、表达、蛋白纯化及其功能验证 | 第44-63页 |
1 试验材料 | 第44-46页 |
·菌株 | 第44页 |
·质粒 | 第44页 |
·主要试剂 | 第44页 |
·试剂配制 | 第44-46页 |
·细菌培养相关试剂配制 | 第44-45页 |
·核酸电泳相关试剂配制 | 第45页 |
·蛋白电泳相关试剂配制 | 第45页 |
·Western blot相关试剂配制 | 第45页 |
·蛋白纯化相关试剂配制 | 第45页 |
·其它相关试剂配制 | 第45-46页 |
·主要仪器设备 | 第46页 |
2 试验方法 | 第46-53页 |
·引物设计与合成 | 第46-47页 |
·潜在hemophore的PCR扩增 | 第47页 |
·PCR扩增产物的回收 | 第47-48页 |
·重组表达质粒的构建 | 第48-51页 |
·载体质粒的提取 | 第48页 |
·基因片段及质粒的酶切和回收 | 第48-49页 |
·连接 | 第49页 |
·感受态细胞的制备 | 第49页 |
·连接产物的转化 | 第49-50页 |
·阳性克隆的PCR鉴定 | 第50-51页 |
·阳性质粒的提取及测序 | 第51页 |
·表达载体的构建及表达 | 第51-52页 |
·重组质粒转入表达菌 | 第51页 |
·表达菌阳性克隆的PCR鉴定 | 第51页 |
·诱导表达 | 第51-52页 |
·重组蛋白的SDS-PAGE检测 | 第52页 |
·重组蛋白的纯化 | 第52-53页 |
·重组蛋白的大量表达 | 第52页 |
·蛋白纯化 | 第52-53页 |
·潜在hemophore的功能验证 | 第53页 |
3 结果与分析 | 第53-60页 |
·潜在hemophore基因扩增 | 第53-54页 |
·PCR产物回收 | 第54页 |
·质粒提取 | 第54-55页 |
·酶切及连接 | 第55页 |
·转化 | 第55-57页 |
·PCR鉴定阳性克隆 | 第57页 |
·测序鉴定结果 | 第57页 |
·重组蛋白的诱导表达 | 第57-59页 |
·重组蛋白的纯化 | 第59-60页 |
·潜在hemophore的功能验证 | 第60页 |
4 讨论 | 第60-63页 |
第五章 hemophore作为抗菌靶点的探索 | 第63-68页 |
1 试验材料 | 第63页 |
·菌株 | 第63页 |
·主要试剂 | 第63页 |
·试剂配制 | 第63页 |
·主要仪器 | 第63页 |
2 试验方法 | 第63-64页 |
·SDNS最小抑菌浓度的测定 | 第64页 |
·抑菌生长曲线测定 | 第64页 |
3 结果与分析 | 第64-66页 |
4 讨论 | 第66-68页 |
参考文献 | 第68-73页 |
第三部分 致谢 | 第73-74页 |
附录 | 第74-75页 |
攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第75页 |