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鸭疫里默氏杆菌hemophore的发现及作为抗菌靶点的探索

中文摘要第1-5页
ABSTRACT第5-7页
缩略词表第7-13页
第一部分 文献综述第13-21页
 第一章 革兰氏阴性菌血红素转运系统及hemophore的研究进展第13-21页
  1. 革兰氏阴性菌血红素转运系统第13-19页
   ·血红素来源第14-15页
   ·血红素摄取第15-16页
     ·直接的血红素摄取第15页
     ·Hemophore介导的血红素摄取第15-16页
   ·血红素转运第16-18页
     ·血红素受体第16页
     ·TonB系统第16-17页
     ·ABC转运体第17页
     ·血红素的储存和降解第17-18页
   ·血红素转运的调控第18-19页
     ·Fur调控第18页
     ·σ调控第18页
     ·复合调控第18-19页
  2. 革兰氏阴性菌hemophore的研究进展第19-21页
   ·HasA型hemophore第19页
   ·HuxA型hemophore第19页
   ·HmuY型hemophore第19-21页
第二部分 试验部分第21-68页
 第二章 鸭疫里默氏杆菌hemophore的发现与鉴定第21-32页
  1 试验材料第21-24页
   ·菌株第21页
   ·主要试剂第21-22页
   ·试剂配制第22-23页
     ·细菌培养相关试剂配制第22页
     ·蛋白电泳相关试剂配制第22-23页
     ·Western-blot相关试剂配制第23页
     ·其它相关试剂配制第23页
   ·主要仪器第23-24页
  2 试验方法第24-26页
   ·鸭疫里默氏杆菌分泌蛋白的提取第24页
   ·胞外heme绑定蛋白的鉴定第24-25页
   ·Heme琼脂糖亲和层析第25页
   ·野生型hemophore分泌的优化第25页
   ·野生型hemophore稳定性的检测第25-26页
  3 结果与分析第26-30页
   ·鸭疫里默氏杆菌分泌蛋白的提取第26-27页
   ·胞外heme绑定蛋白的鉴定第27页
   ·Heme琼脂糖亲和层析第27-28页
   ·野生型hemophore分泌的优化第28-29页
   ·野生型hemophore稳定性的检测第29-30页
  4 讨论第30-32页
 第三章 鸭疫里默氏杆菌潜在hemophore的生物信息学分析第32-44页
  1 试验材料第32-33页
   ·主要生物信息学分析软件及在线分析工具第32-33页
  2 试验方法第33-34页
   ·潜在hemophore基因的查找第33页
   ·BLASTN分析第33页
   ·蛋白质疏水性分析第33页
   ·蛋白质抗原性及表面性分析第33页
   ·蛋白质信号肽预测第33-34页
   ·蛋白质亚细胞定位第34页
   ·蛋白质结构预测第34页
  3 结果与分析第34-43页
   ·鸭疫里默氏杆菌中的潜在hemophore基因第34-36页
   ·鸭疫里默氏杆菌潜在hemophore基因家族第36-38页
   ·蛋白质疏水性分析第38-39页
   ·蛋白质抗原性及表面抗原分析第39-40页
   ·蛋白质信号肽预测第40页
   ·蛋白质亚细胞定位第40-41页
   ·蛋白质结构预测第41-43页
  4 讨论第43-44页
 第四章 潜在hemophore基因的克隆、表达、蛋白纯化及其功能验证第44-63页
  1 试验材料第44-46页
   ·菌株第44页
   ·质粒第44页
   ·主要试剂第44页
   ·试剂配制第44-46页
     ·细菌培养相关试剂配制第44-45页
     ·核酸电泳相关试剂配制第45页
     ·蛋白电泳相关试剂配制第45页
     ·Western blot相关试剂配制第45页
     ·蛋白纯化相关试剂配制第45页
     ·其它相关试剂配制第45-46页
   ·主要仪器设备第46页
  2 试验方法第46-53页
   ·引物设计与合成第46-47页
   ·潜在hemophore的PCR扩增第47页
   ·PCR扩增产物的回收第47-48页
   ·重组表达质粒的构建第48-51页
     ·载体质粒的提取第48页
     ·基因片段及质粒的酶切和回收第48-49页
     ·连接第49页
     ·感受态细胞的制备第49页
     ·连接产物的转化第49-50页
     ·阳性克隆的PCR鉴定第50-51页
     ·阳性质粒的提取及测序第51页
   ·表达载体的构建及表达第51-52页
     ·重组质粒转入表达菌第51页
     ·表达菌阳性克隆的PCR鉴定第51页
     ·诱导表达第51-52页
     ·重组蛋白的SDS-PAGE检测第52页
   ·重组蛋白的纯化第52-53页
     ·重组蛋白的大量表达第52页
     ·蛋白纯化第52-53页
   ·潜在hemophore的功能验证第53页
  3 结果与分析第53-60页
   ·潜在hemophore基因扩增第53-54页
   ·PCR产物回收第54页
   ·质粒提取第54-55页
   ·酶切及连接第55页
   ·转化第55-57页
   ·PCR鉴定阳性克隆第57页
   ·测序鉴定结果第57页
   ·重组蛋白的诱导表达第57-59页
   ·重组蛋白的纯化第59-60页
   ·潜在hemophore的功能验证第60页
  4 讨论第60-63页
 第五章 hemophore作为抗菌靶点的探索第63-68页
  1 试验材料第63页
   ·菌株第63页
   ·主要试剂第63页
   ·试剂配制第63页
   ·主要仪器第63页
  2 试验方法第63-64页
   ·SDNS最小抑菌浓度的测定第64页
   ·抑菌生长曲线测定第64页
  3 结果与分析第64-66页
  4 讨论第66-68页
参考文献第68-73页
第三部分 致谢第73-74页
附录第74-75页
攻读学位期间发表的学术论文目录第75页

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