| 附件 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 引言 | 第10-19页 |
| ·遗传标记的研究进展 | 第10页 |
| ·DNA 分子标记技术 | 第10-17页 |
| ·限制性片段多态性 | 第10页 |
| ·随机多态性扩增 DNA | 第10-11页 |
| ·扩增片段长度多态性 | 第11页 |
| ·微卫星 | 第11-13页 |
| ·微卫星在群体遗传多样性研究中的应用 | 第12-13页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第13-16页 |
| ·SNPs 的特点 | 第13-14页 |
| ·SNP 检测方法 | 第14-16页 |
| ·直接的测序方法 | 第14页 |
| ·构象检测法 | 第14-15页 |
| ·基于 PCR 以及酶切的方法 | 第15页 |
| ·杂交方法 | 第15-16页 |
| ·高通量测序法 | 第16页 |
| ·高分辨率溶解曲线（high resolution melting, HRM) | 第16-17页 |
| ·HRM 原理 | 第16-17页 |
| ·HRM 的特点 | 第17页 |
| ·HRM 技术的应用 | 第17页 |
| ·泥蚶分子遗传标记的研究进展 | 第17-18页 |
| ·课题的目的与意义 | 第18-19页 |
| 第二章 泥蚶 EST-SSR 标记的开发 | 第19-38页 |
| ·材料与方法 | 第19-22页 |
| ·泥蚶 DNA 提取 | 第19-20页 |
| ·获取 EST-SSR 位点 | 第20页 |
| ·引物设计 | 第20页 |
| ·引物筛选 | 第20-21页 |
| ·8％非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳制作 | 第21-22页 |
| ·泥蚶 SSR 位点分析 | 第22页 |
| ·结果与分析 | 第22-23页 |
| ·泥蚶 SSR 位点的筛选 | 第22页 |
| ·碱基重复类型 | 第22-23页 |
| ·SSR 位点的多态性评价 | 第23页 |
| ·基因功能注释 | 第23页 |
| ·讨论 | 第23-25页 |
| ·两种来源 SSR 候选位点扩增成功率比较 | 第24页 |
| ·碱基重复类型分析 | 第24页 |
| ·S-SSR 与 C-SSR 多态性比较 | 第24-25页 |
| ·小结 | 第25-38页 |
| 第三章 基于转录组的 78 个泥蚶多态性 EST-SNP 标记的开发 | 第38-51页 |
| ·材料与方法 | 第38-41页 |
| ·实验主要药品试剂 | 第38-39页 |
| ·DNA 的提取 | 第39页 |
| ·候选位点的筛选与引物设计 | 第39-40页 |
| ·高分辨率溶解曲线 | 第40页 |
| ·基因分型及数据分析 | 第40-41页 |
| ·结果与分析 | 第41-43页 |
| ·引物筛选结果 | 第41页 |
| ·SNPs 分型结果 | 第41-42页 |
| ·SNP 类型 | 第42-43页 |
| ·群体遗传多样性分析 | 第43页 |
| ·讨论 | 第43-51页 |
| ·SNP 位点多态性分析 | 第43-44页 |
| ·SNP 类型比较 | 第44页 |
| ·SNP 与 SSR 遗传多样性比较 | 第44-51页 |
| 第四章 我国东南沿海泥蚶 4 个地理群体的遗传变异分析 | 第51-58页 |
| ·材料与方法 | 第51-53页 |
| ·实验群体 | 第51页 |
| ·DNA 提取 | 第51页 |
| ·群体的 SSR 分析 | 第51-52页 |
| ·数据分析 | 第52-53页 |
| ·结果 | 第53-56页 |
| ·群体遗传多样性对比 | 第54-55页 |
| ·遗传分化系数及遗传距离 | 第55-56页 |
| ·讨论 | 第56-58页 |
| ·群体间遗传多样性比较 | 第56-57页 |
| ·群体遗传分化情况 | 第57-58页 |
| 第五章 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 附录 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
