| 上海海洋大学硕士学位论文答辩委员会成员名单 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-16页 |
| ·研究背景 | 第9页 |
| ·贝类对干旱的反应 | 第9-10页 |
| ·海洋贝类的表达研究 | 第10-11页 |
| ·下一代测序研究 | 第11-12页 |
| ·甲壳动物的热休克蛋白反应 | 第12-14页 |
| ·论文研究目的意义 | 第14-16页 |
| 第二章 淡水蚌 P. grandis 转录组高通量测序及分析 | 第16-23页 |
| 1 前言 | 第16页 |
| 2 材料与方法 | 第16-19页 |
| ·实验动物和组织采样 | 第16-17页 |
| ·RNA 提取、文库构建和测序 | 第17-18页 |
| ·测序序列的从头组装 | 第18-19页 |
| ·基因注释和本体论 | 第19页 |
| 3 结果与分析 | 第19-23页 |
| ·斧足组织短表达序列的测序 | 第19-20页 |
| ·转录组的从头组装 | 第20-21页 |
| ·基因鉴定和注释 | 第21-23页 |
| 第三章 淡水蚌 U. tetralasmus 转录组高通量测序及分析 | 第23-28页 |
| 1 前言 | 第23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-24页 |
| ·实验动物和组织采样 | 第23-24页 |
| ·RNA 提取、文库构建和测序 | 第24页 |
| ·测序序列的从头组装 | 第24页 |
| ·基因注释和本体论 | 第24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-28页 |
| ·斧足组织短表达序列的测序 | 第24-25页 |
| ·转录组的从头组装 | 第25-26页 |
| ·基因鉴定和注释 | 第26-28页 |
| 第四章 两种淡水蚌 P.grandis 和 U. tetralasmus 的不同抗旱反应的转录组比较与分析 | 第28-50页 |
| 1 前言 | 第28-29页 |
| 2 材料与方法 | 第29-32页 |
| ·差异表达片段的鉴定 | 第29页 |
| ·基因本体论和富集分析 | 第29-30页 |
| ·实验验证—QPCR | 第30-31页 |
| ·关键基因的时相表达分析 | 第31-32页 |
| 3 结果 | 第32-43页 |
| ·差异表达基因的鉴定和分析 | 第32-33页 |
| ·富集和通路分析 | 第33-40页 |
| ·QPCR 验证 RNA-seq 分析 | 第40-42页 |
| ·关键热/干燥相关基因的时相表达 | 第42-43页 |
| 4 讨论 | 第43-48页 |
| ·伴侣蛋白/热休克蛋白 | 第45-46页 |
| ·抗氧化/氧化应激反应 | 第46页 |
| ·细胞增殖/细胞凋亡 | 第46-47页 |
| ·免疫 | 第47页 |
| ·细胞骨架 | 第47-48页 |
| ·其它 | 第48页 |
| 5 研究展望 | 第48-50页 |
| ·时间点分析 | 第48页 |
| ·个体变异和物种变异 | 第48-49页 |
| ·组织变异性 | 第49页 |
| ·测定的一致性 | 第49-50页 |
| 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-60页 |
| 附录 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
