| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 第1章 引言 | 第8-20页 |
| ·海洋氮循环 | 第9-12页 |
| ·氮循环过程及其微生物 | 第9-11页 |
| ·海洋氮污染 | 第11-12页 |
| ·氨氧化细菌及其功能基因 amoA 的研究 | 第12-15页 |
| ·氨氧化细菌种群特征及分类 | 第13页 |
| ·amoA 基因在氨氧化细菌研究中的应用 | 第13-14页 |
| ·环境因子对氨氧化菌群的影响 | 第14-15页 |
| ·研究海域的特点及意义 | 第15-17页 |
| ·渤海生态环境 | 第16页 |
| ·渤海氮污染现状 | 第16-17页 |
| ·本论文研究意义与技术路线 | 第17-20页 |
| ·选题背景 | 第17-18页 |
| ·研究目标与意义 | 第18-19页 |
| ·技术路线 | 第19-20页 |
| 第2章 渤海沉积环境氨氧化细菌 amoA 基因文库的建立 | 第20-42页 |
| ·引言 | 第20-21页 |
| ·试剂和材料 | 第21-25页 |
| ·样品及站位来源 | 第21页 |
| ·实验试剂 | 第21-23页 |
| ·培养基及试剂配制 | 第23-24页 |
| ·主要仪器设备 | 第24-25页 |
| ·实验方法 | 第25-32页 |
| ·宏基因组 DNA 提取 | 第25-26页 |
| ·amoA 基因序列的 PCR 扩增 | 第26-27页 |
| ·PCR 产物的乙醇沉淀 | 第27-28页 |
| ·切胶纯化 | 第28-29页 |
| ·连接转化 | 第29-30页 |
| ·克隆的 PCR 扩增 | 第30-31页 |
| ·PCR 产物限制性酶切反应（RFLP） | 第31-32页 |
| ·测序及保种 | 第32页 |
| ·文库质量检测 | 第32页 |
| ·实验结果与讨论 | 第32-40页 |
| ·amoA 基因文库的建立 | 第32-35页 |
| ·amoA 基因文库的筛选及 RFLP 分析 | 第35-38页 |
| ·基因文库覆盖率与稀释曲线 | 第38-39页 |
| ·基因文库多样性指数分析 | 第39-40页 |
| ·小结 | 第40-42页 |
| 第3章 渤海沉积物样品环境因子分析 | 第42-46页 |
| ·前言 | 第42页 |
| ·材料与方法 | 第42-43页 |
| ·结果与讨论 | 第43-45页 |
| ·各站位环境因子的测定结果及分析 | 第43-44页 |
| ·沉积物样品环境因子聚类分析 | 第44-45页 |
| ·小结 | 第45-46页 |
| 第4章 渤海氨氧化细菌 amoA 群落结构及分子生态学分析 | 第46-55页 |
| ·引言 | 第46页 |
| ·amoA 基因系统进化分析 | 第46-50页 |
| ·UniFrac 聚类分析 | 第50-52页 |
| ·AOB 群落结构与环境因子的典型对应分析（CCA） | 第52-54页 |
| ·小结 | 第54-55页 |
| 第5章 讨论 | 第55-59页 |
| ·渤海沉积环境氨氧化细菌的系统进化分析 | 第55-56页 |
| ·渤海沉积环境氨氧化细菌群落分布与环境的关系 | 第56-59页 |
| 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-69页 |
| 攻读硕士学位期间取得的学术成果 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
