日本三角涡虫铅胁迫下的数字表达谱分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第1章 前言 | 第11-27页 |
| ·转录组测序技术的发展 | 第11-16页 |
| ·转录组的定义 | 第11-12页 |
| ·微阵列技术 | 第12页 |
| ·表达序列标签测序 | 第12-13页 |
| ·基因表达系列分析 | 第13-14页 |
| ·转录组测序 | 第14-16页 |
| ·数字基因表达谱的研究现状 | 第16-20页 |
| ·数字基因表达谱 | 第16页 |
| ·数字基因表达谱的应用范围 | 第16-18页 |
| ·数字基因表达谱在探究基因差异表达中的应用 | 第18-20页 |
| ·日本三角涡虫表达谱研究现状 | 第20页 |
| ·日本三角涡虫铅损伤研究现状 | 第20-24页 |
| ·重金属损伤效应的研究现状 | 第20-22页 |
| ·铅损伤对生物体的研究现状 | 第22-23页 |
| ·铅损伤对日本三角涡虫的研究 | 第23-24页 |
| ·选题意义 | 第24-27页 |
| ·日本三角涡虫的研究现状 | 第24页 |
| ·日本三角涡虫铅损伤的研究意义 | 第24-27页 |
| 第2章 材料与方法 | 第27-35页 |
| ·实验材料 | 第27-30页 |
| ·实验标本的采集与饲养 | 第27页 |
| ·实验材料处理方法 | 第27页 |
| ·实验仪器和试剂 | 第27-29页 |
| ·分析软件及数据库 | 第29-30页 |
| ·试验方法 | 第30-35页 |
| ·日本三角涡虫总RNA的提取 | 第30-31页 |
| ·检测RNA的纯度和完整性 | 第31页 |
| ·对RNA进行RNA-Seq测序 | 第31-32页 |
| ·测序评估 | 第32页 |
| ·基因功能注释 | 第32-33页 |
| ·差异表达谱的生物信息学分析 | 第33-35页 |
| 第3章 结果分析 | 第35-51页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳 | 第35-36页 |
| ·日本三角涡虫总RNA的浓度和纯度测定 | 第36页 |
| ·生物信息学分析 | 第36-51页 |
| ·测序数据处理与比对 | 第36-37页 |
| ·测序评估 | 第37-39页 |
| ·基因表达量统计 | 第39-40页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第40-42页 |
| ·基因表达模式聚类分析 | 第42-43页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第43-47页 |
| ·Gene Ontology功能分类 | 第47-48页 |
| ·KEGG Pathway显著性富集分析 | 第48-51页 |
| 第4章 讨论 | 第51-63页 |
| ·数字基因表达谱测序技术在探寻差异基因中的应用 | 第51页 |
| ·测序数据的比对 | 第51-52页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第52页 |
| ·差异表达基因的GO分析 | 第52-54页 |
| ·差异表达基因的Pathway分析 | 第54-63页 |
| ·蛋白质合成过程中的相关差异表达基因 | 第55-56页 |
| ·氧化磷酸化途径上的相关差异表达基因 | 第56-60页 |
| ·人类疾病相关的差异表达基因 | 第60-63页 |
| 第5章 结论 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-77页 |
| 致谢 | 第77-79页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第79页 |
