| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-18页 |
| ·研究背景和意义 | 第11-13页 |
| ·研究背景 | 第11-12页 |
| ·研究的意义 | 第12-13页 |
| ·国内外的研究现状 | 第13-15页 |
| ·图聚类 | 第13-14页 |
| ·DNA 计算 | 第14-15页 |
| ·本文主要研究内容 | 第15-16页 |
| ·图聚类和 DNA 计算的相关理论概述 | 第15页 |
| ·基于 Adleman 模型的 DNA 计算在图聚类中的应用 | 第15页 |
| ·基于改进闭环 DNA 模型的介数算法在图聚类中的应用 | 第15-16页 |
| ·基于改进 DNA 粘贴模型的算法在图聚类中的应用 | 第16页 |
| ·本文的创新点 | 第16页 |
| ·本文的组织结构 | 第16-18页 |
| 第二章 图聚类相关理论 | 第18-31页 |
| ·图论 | 第18-22页 |
| ·可取的簇性质 | 第22-23页 |
| ·识别簇的方法 | 第23-25页 |
| ·图聚类算法 | 第25-31页 |
| ·Kernighan-Lin 算法 | 第25-26页 |
| ·谱平分法 | 第26页 |
| ·电压和电势法 | 第26-27页 |
| ·基于 Normal 矩阵的谱平分法 | 第27-28页 |
| ·GN 算法 | 第28-29页 |
| ·结合谱分析的凝聚算法 | 第29-31页 |
| 第三章 DNA 计算 | 第31-36页 |
| ·DNA 计算基本概念和原理 | 第31-33页 |
| ·DNA 分子的结构 | 第31-32页 |
| ·DNA 操作技术 | 第32页 |
| ·DNA 计算的机理 | 第32-33页 |
| ·DNA 计算模型 | 第33-36页 |
| ·双链 DNA 计算模型 | 第33-34页 |
| ·粘贴模型 | 第34页 |
| ·闭环 DNA 计算模型 | 第34-36页 |
| 第四章 基于 DNA 计算的最大流算法在图聚类上的应用 | 第36-45页 |
| ·最大流算法背景知识 | 第36-37页 |
| ·最大流和最小切 | 第36页 |
| ·最大流算法研究现状 | 第36-37页 |
| ·基于 Adleman 模型的最大流算法的基本思想 | 第37页 |
| ·无向图的聚类方法 | 第37-40页 |
| ·构造适合于应用最大流算法的网络图 | 第37-38页 |
| ·改进的 DNA 两阶段算法流程 | 第38-40页 |
| ·有向图的聚类方法 | 第40-41页 |
| ·构造适合于应用最大流算法的网络图 | 第40-41页 |
| ·算法的流程 | 第41页 |
| ·算法的生化实验操作 | 第41-42页 |
| ·算例 | 第42-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 第五章 基于闭环 DNA 计算的 GN 算法的研究 | 第45-54页 |
| ·GN 算法 | 第45页 |
| ·GN 算法的基本思想 | 第45页 |
| ·GN 算法中边介数的计算方法 | 第45页 |
| ·闭环 DNA 模型及其基本的生化实验操作 | 第45-47页 |
| ·推广的最短路问题的闭环 DNA 计算模型 | 第45-46页 |
| ·推广的闭环 DNA 生化试验 | 第46-47页 |
| ·基于推广的闭环 DNA 计算的 GN 算法的流程 | 第47-50页 |
| ·算法的基本思想 | 第47页 |
| ·算法描述 | 第47-50页 |
| ·算例 | 第50-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 第六章 基于改进 DNA 粘贴模型的算法在图聚类中的应用 | 第54-63页 |
| ·粘贴模型及其改进 | 第54-56页 |
| ·基本的粘贴模型 | 第54页 |
| ·粘贴计算 | 第54-55页 |
| ·粘贴模型的四种基本生物操作 | 第55页 |
| ·改进的粘贴模型 | 第55-56页 |
| ·基于改进 DNA 粘贴模型的图聚类算法 | 第56-59页 |
| ·编码存储合成物及分离探针 | 第56-57页 |
| ·算法的生化实验步骤 | 第57-59页 |
| ·聚类操作 | 第59页 |
| ·仿真实验 | 第59-62页 |
| ·本章小结 | 第62-63页 |
| 第七章 总结与展望 | 第63-65页 |
| ·研究总结 | 第63-64页 |
| ·研究展望 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 攻读硕士学位期间公开发表的论文 | 第71页 |
