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扬州鹅肠道微生物多样性及其受饲粮纤维水平的调控研究

中文摘要第1-9页
Abstracts第9-13页
符号说明第13-14页
引言第14页
第一章 文献综述第14-41页
 1 家禽胃肠道营养与微生物区系的相互关系第14-20页
   ·家禽的肠道微生物第15-16页
   ·胃肠道微生物区系与宿主之间的关系第16-17页
   ·日粮对肠道微生物区系的调控第17-20页
 2 胃肠道微生物群体的研究手段第20-25页
   ·纯培养的方法第20页
   ·分子微生态学第20-25页
 3 日粮纤维的研究进展第25-26页
 4 鹅对饲料纤维利用的研究进展第26-28页
   ·日粮纤维对鹅生长性能的影响第27-28页
   ·鹅日粮中粗纤维的适宜水平第28页
   ·鹅对饲料纤维消化的影响第28页
 5 鹅对日粮纤维利用机制的研究进展第28-31页
   ·鹅肌胃的作用第29页
   ·鹅的后肠道对纤维物质消化的特点第29-30页
   ·鹅的回肠第30-31页
 6 鹅肠道微生物多样性的研究进展第31页
 7 研究目标、技术路线和试验假设第31-33页
   ·研究目标和意义第31页
   ·主要内容与技术路线第31-32页
   ·试验假设第32-33页
 8 参考文献第33-41页
第二章 鹅盲肠中产纤维素降解菌的分离鉴定及系统发育分析第41-53页
 引言第41页
 1第41-45页
   ·材料与方法第41页
   ·主要试剂的配制第41-43页
   ·纤维素降解菌株的分离第43页
   ·纤维降解菌的分子鉴定第43-45页
   ·系统发育分析第45页
 2 结果与分析第45-48页
   ·3个菌株的16S rRNA序列第45-47页
   ·3个菌株的16S rRNA序列的同源性比较第47-48页
   ·进化树分析第48页
 3 讨论第48-50页
 4 小结第50页
 5 参考文献第50-53页
第三章 扬州鹅盲肠细菌16S RRNA基因序列分析第53-76页
 引言第53页
 1 材料与方法第53-56页
   ·材料第53-54页
   ·主要试剂第54页
   ·试验方法第54-55页
   ·GenBank序列第55-56页
 2 结果与分析第56-67页
   ·盲肠内容物细菌16Sr RNA克隆文库分析第56-57页
   ·盲肠粘膜细菌16Sr RNA克隆文库分析第57-67页
 3 讨论第67-69页
 4 小结第69-72页
 5 参考文献第72-76页
第四章 扬州鹅回肠细菌16S RRNA基因序列分析第76-84页
 引言第76页
 1 材料与方法第76-78页
   ·材料第76页
   ·主要试剂第76-77页
   ·试验方法第77-78页
 2 结果与分析第78-80页
 3 讨论第80-81页
 4 小结第81页
 5 参考文献第81-84页
第五章 应用PCR-DGGE技术研究不同周龄扬州鹅肠道细菌的区系变化第84-98页
 引言第84页
 1 材料与方法第84-88页
   ·试验日粮与饲养管理第84-85页
   ·主要试剂和仪器第85页
   ·溶液与培养基第85-86页
   ·试验方法第86-88页
   ·数据分析第88页
 2 结果与分析第88-93页
   ·不同周龄对鹅肠道内容物菌群的影响第88-90页
   ·10周龄鹅特异性肠道菌群和共性肠道菌群分析第90-93页
 3 讨论第93-95页
 4 小结第95页
 5 参考文献第95-98页
第六章 饲粮中不同纤维水平对扬州鹅肠道微生物的影响第98-123页
 引言第98-99页
 1. 材料与方法第99-105页
   ·材料第99-100页
   ·试验设计与样品采集第100页
   ·DNA提取第100-101页
   ·PCR扩增第101页
   ·DGGE分析与图谱分析第101页
   ·部分优势条带的克隆和分析第101-102页
   ·实时荧光定量PCR第102-105页
     ·引物设计与合成第102页
     ·常规PCR反运第102-103页
     ·实时焚光定量PCR反应第103-105页
   ·数据处理第105页
 2 结果与分析第105-116页
   ·饲粮中纤维水平对鹅各肠道微生物菌群多样性的影响第105-107页
   ·纤维素水平对鹅盲肠微生物种类的影响第107-111页
   ·鹅盲肠细菌Real-time PCR标准曲线第111-115页
     ·目的片段的扩增与序列比对第111页
     ·质粒标准曲线第111-115页
   ·Real-time PCR分析不同纤维水平对鹅盲肠微生物菌群数量的影响第115-116页
 3 讨论第116-118页
   ·不同纤维水平对鹅肠道微生物菌群结构的影响第116-118页
   ·不同纤维水平对鹅盲肠微生物菌群数量的影响第118页
 4 小结第118-119页
 5 参考文献第119-123页
第七章 全文总体讨论、结论、创新点与有待研究的问题第123-127页
 1 全文讨论第123-125页
   ·扬州鹅肠道的微生物多样性第123-124页
   ·饲粮纤维水平对扬州鹅肠道菌群的影响第124-125页
 2 结论第125页
 3 研究的创新点第125-126页
 4 有待研究的问题第126-127页
致谢第127-128页
博士期间发的论文第128-129页

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