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P53下游候选基因PAP1的鉴定和生物信息学分析

中文摘要第1-4页
英文摘要第4-7页
1 绪论第7-12页
   ·引言第7-8页
     ·p53 基因作用的物质基础第7页
     ·P53 下游基因的筛选方法及意义第7-8页
   ·国内外研究现状第8-12页
     ·p53 负调控基因mdm 2第8页
     ·细胞周期负调控相关基因p21waf 1/cip 1,1423232σ和cyclin G第8-9页
     ·DNA 复制与修复基因gadd 45第9页
     ·细胞永生化基因Igf2bp3第9页
     ·细胞凋亡相关基因bax ,gml ,p2xm ,killer/dr 5 和pag 608第9-10页
     ·血管生成抑制基因TSP21第10页
     ·应答细胞胁迫有关基因tp 53 tg 1 ,csr 和pig 3第10-12页
2 P53 下游基因 PAP1 的鉴定第12-27页
   ·新克隆的基因-PAP1 简述第12页
   ·P53 下游基因PAP1 基因的鉴定第12-27页
     ·材料第12页
     ·试剂第12-13页
     ·仪器第13页
     ·试剂的配制第13-14页
     ·方法第14-21页
     ·结果第21-27页
3 PAP1 基因的生物信息学分析第27-41页
   ·PAP1 的基因结构分析第27-33页
     ·ORFfinder 预测开放阅读框(ORF)第27页
     ·Blastn 分析第27-28页
     ·双序列比对-needle 算法第28页
     ·多序列比对,构建进化树第28-30页
     ·启动子预测第30-31页
     ·P53 蛋白下游结合位点分析第31-32页
     ·PAP1 基因结构分析第32-33页
   ·PAP1 基因的功能分析第33-41页
     ·PAP1 蛋白的理化性质预测第33页
     ·PAP1 蛋白的信号肽与跨膜螺旋预测第33-35页
     ·PAP1 蛋白的疏水性预测第35页
     ·PAP1 蛋白的细胞器定位第35页
     ·BLASTP 数据库搜索第35-36页
     ·多序列比对第36-37页
     ·PAP1 蛋白的三维结构预测第37-39页
     ·PAP1 蛋白二次数据库搜索第39-41页
4 结论与展望第41-43页
致谢第43-44页
参考文献第44-47页
附录第47-50页

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