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盐生杜氏藻3-磷酸甘油脱氢酶同工酶基因的克隆、功能及产生机制研究

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-12页
前言第12-14页
论文第14-80页
 第一章 盐生杜氏藻3-磷酸甘油脱氢酶同工酶基因的克隆及序列分析第14-32页
  1. 材料与方法第14-24页
   ·实验材料第14-15页
     ·菌种第14页
     ·藻种第14-15页
     ·酶和试剂盒第15页
   ·实验方法第15-24页
     ·EST的克隆第15-16页
     ·GPDH基因EST引物的设计第16页
     ·盐藻总RNA的提取第16-17页
     ·反转录第17-18页
     ·3’端序列的克隆第18-20页
     ·5’RACE的引物设计第20页
     ·5’端序列的克隆第20-24页
     ·全长cDNA序列拼接第24页
     ·全长cDNA的ORF的验证第24页
  2 结果与分析第24-29页
   ·GPDH1和GPDH3的EST的克隆第24-25页
   ·GPDH1和GPDH3的3’端序列的克隆第25页
   ·GPDH1和GPDH3的5’端序列的克隆第25-26页
   ·GPDH1和GPDH2的SerB结构域的氨基酸序列比对第26-27页
   ·GPDH1和GPDH2的GPD结构域的氨基酸序列比对第27-28页
   ·GPDH3的序列分析第28-29页
  3. 讨论第29-32页
   ·GPDH1和GPDH2的序列比较及功能预测第29-32页
 第二章 盐生杜氏藻3-磷酸甘油脱氢酶同工酶基因的表达及细胞的甘油动态合成第32-47页
  1. 材料与方法第32-38页
   ·实验材料第32-33页
     ·藻种第32页
     ·酶和试剂盒第32-33页
   ·实验方法第33-38页
     ·各种胁迫处理第33页
     ·盐藻总RNA的提取第33页
     ·反转录第33-34页
     ·Realtime PCR的引物设计第34页
     ·标准曲线制作第34-35页
     ·样品的realtime PCR反应第35页
     ·相对定量的计算方法第35-36页
     ·Northern杂交第36-37页
     ·盐藻细胞甘油含量的测定第37页
     ·盐藻细胞湿重的计算第37-38页
  2 结果与分析第38-45页
   ·标准曲线第38-39页
   ·样品的realtime PCR反应结果与分析第39-43页
   ·Northern杂交结果(GPDH2)与分析第43-44页
   ·甘油合成的动态变化第44-45页
  3 讨论第45-47页
 第三章 盐生杜氏藻3-磷酸甘油脱氢酶基因的原核表达及酶学分析第47-59页
  1 材料与方法第47-52页
   ·材料第47-48页
     ·菌种第47页
     ·质粒第47页
     ·载体第47-48页
     ·酶制剂第48页
     ·试剂及试剂盒第48页
     ·层析柱子第48页
     ·仪器设备第48页
   ·方法第48-52页
     ·大肠杆菌表达载体的构建第48-49页
     ·重组蛋白的表达第49-50页
     ·一步亲和层析纯化第50页
     ·蛋白质含量的测定及 SDS-PAGE电泳第50页
     ·重组蛋白GPDH2的GPD活性测定方法第50-51页
     ·气相色谱检测 GPDH2反应液中的甘油含量第51-52页
  2 结果与分析第52-58页
   ·载体pET-gpdh2的构建及转化第52页
   ·重组蛋白的表达第52-53页
   ·重组蛋白的纯化第53-54页
   ·GPDH2反应液中甘油含量的测定第54-58页
  3 讨论第58-59页
 第四章 3-磷酸甘油脱氢酶同工酶基因的产生机制研究第59-74页
  1. 材料与方法第59-68页
   ·实验材料第59-60页
     ·藻种第59页
     ·菌种第59-60页
     ·酶和试剂盒第60页
   ·实验方法第60-63页
     ·GPDH1和 GPDH2的基因序列克隆第60-62页
     ·基因组 DNA杂交(Southern blotting)第62-63页
   Procedure第63-68页
  2 结果与分析第68-74页
   ·GPDH1和GPDH2的基因组序列克隆第68-69页
   ·GPDH1和 GPDH2的基因组结构比较第69-71页
     ·GPDH1和 GPDH2的GPD结构域的基因组结构(外显子和内含子)比较第69-70页
     ·GPDH1和GPDH2的SerB结构域的基因组结构(外显子和内含子)比较第70-71页
   ·基因组Southern杂交第71-74页
 结论第74-75页
 参考文献第75-77页
 在读期间科研成果简介第77-79页
 致谢第79-80页
综述第80-99页
 盐藻一种重要的模式物种-盐藻的研究现状及未来发展方向第80-99页
  1. 杜氏藻研究概况第80-83页
   ·杜氏藻属的分类第80-81页
   ·杜氏藻的类胡萝卜素第81页
   ·杜氏藻的耐盐能力第81-82页
   ·杜氏藻细胞对渗透的行为第82页
   ·杜氏藻细胞内的盐和溶质的浓度第82-83页
   ·采用蛋白质组学的方法研究盐藻的耐盐第83页
  2 盐藻研究的发展方向第83-93页
   ·基因进化第84-90页
     ·新基因产生的分子机制第84-85页
     ·新基因的进化第85-87页
       ·新生基因的命运第85-86页
       ·新基因的加速进化第86-87页
     ·新基因产生的频率第87-88页
     ·新基因产生的X染色体偏好性第88-89页
     ·总结和展望第89-90页
   ·比较基因组学第90-93页
     ·基因组结构的进化第90页
     ·基因组功能的进化第90-91页
     ·群体基因组学和系统基因组学第91-92页
     ·比较的方法和基因组的功能注释第92页
     ·前景第92-93页
  参考文献第93-99页
附录第99-102页

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