水蛭素/凝血酶体系的分子动力学模拟与分析
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 引言 | 第9-11页 |
| 1 蛋白质分子计算机模拟技术及其应用 | 第11-27页 |
| ·蛋白质分子计算机模拟技术的研究进展 | 第11-20页 |
| ·生物大分子分子模拟简介 | 第11-13页 |
| ·分子动力学简介 | 第13-17页 |
| ·拉伸分子动力学简介 | 第17-19页 |
| ·分子动力学模拟在生物大分子研究中的应用 | 第19-20页 |
| ·水蛭素及其分子模拟 | 第20-24页 |
| ·水蛭素的组成和结构 | 第20-21页 |
| ·水蛭素的抗凝活性及作用机制 | 第21-22页 |
| ·水蛭素的聚乙二醇修饰 | 第22-23页 |
| ·水蛭素/凝血酶体系的分子动力学模拟 | 第23-24页 |
| ·本论文的研究思路 | 第24-25页 |
| 参考文献 | 第25-27页 |
| 2 水蛭素特性的分子动力学模拟与分析 | 第27-39页 |
| ·引言 | 第27页 |
| ·计算方法 | 第27-29页 |
| ·初始结构准备 | 第27-29页 |
| ·分子动力学模拟 | 第29页 |
| ·结果与讨论 | 第29-35页 |
| ·模拟的稳定性和能量分析 | 第29-30页 |
| ·水蛭素分子的结构信息 | 第30-33页 |
| ·水蛭素的构象分析 | 第33-35页 |
| ·静电相互作用和二硫键对水蛭素稳定性的影响 | 第35-37页 |
| ·小结 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-39页 |
| 3 PEG修饰水蛭素位点的理论预测与分析 | 第39-54页 |
| ·引言 | 第39-41页 |
| ·材料以及方法 | 第41-42页 |
| ·实验材料 | 第41页 |
| ·液相修饰水蛭素 | 第41页 |
| ·固相修饰水蛭素 | 第41页 |
| ·PEG化水蛭素的电泳检测 | 第41-42页 |
| ·生物活性测定 | 第42页 |
| ·计算方法 | 第42页 |
| ·结果与讨论 | 第42-51页 |
| ·液相和固相修饰水蛭素的比较 | 第42-44页 |
| ·水蛭素的带电特性与赖氨酸残基分布 | 第44-45页 |
| ·水蛭素液相修饰位点的预测与分析 | 第45-48页 |
| ·水蛭素固相修饰位点的预测与分析 | 第48-51页 |
| ·结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-54页 |
| 4 水蛭素/凝血酶复合体的拉伸动力学分析 | 第54-64页 |
| ·引言 | 第54页 |
| ·计算方法 | 第54-56页 |
| ·体系准备 | 第54页 |
| ·分子动力学模拟 | 第54-55页 |
| ·拉伸动力学方法 | 第55-56页 |
| ·结果与讨论 | 第56-61页 |
| ·拉伸动力学模拟结果 | 第56-58页 |
| ·水蛭素的C域重要的氢键和盐桥 | 第58-61页 |
| ·小结 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-64页 |
| 结论 | 第64-65页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
