| 摘要 | 第1-14页 |
| Abstract | 第14-18页 |
| 资源家系测定性状的英文缩写 | 第18-20页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-40页 |
| 1 引言 | 第20页 |
| 2 脂肪细胞分化相关基因研究进展 | 第20-27页 |
| ·脂肪细胞分化相关转录因子PPARs基因家族 | 第21-24页 |
| ·脂肪细胞分化相关转录因子ADD1基因 | 第24-26页 |
| ·脂肪细胞分化相关转录因子AEBP1基因 | 第26-27页 |
| 3 脂肪沉积相关基因研究进展 | 第27-32页 |
| ·脂肪沉积相关基因MC4R和MC5R | 第28-31页 |
| ·脂肪沉积相关基因IGF2 | 第31-32页 |
| 4 糖原合成与代谢相关基因PRKAG3研究进展 | 第32-34页 |
| 5 猪新基因的分离方法 | 第34-36页 |
| 6 基因定位的方法与研究现状 | 第36-38页 |
| 7 mRNA选择性剪接 | 第38页 |
| 8 本研究的目的和意义 | 第38-40页 |
| 第二章 猪脂肪细胞分化相关基因AEBP1的分离、定位、转录本鉴定和组织表达谱研究 | 第40-72页 |
| 1 引言 | 第40页 |
| 2 试验材料 | 第40-43页 |
| ·试验样品 | 第40-41页 |
| ·猪组织样品 | 第40-41页 |
| ·猪血液样品 | 第41页 |
| ·基因定位所用的猪辐射杂种克隆板(IMpRH) | 第41页 |
| ·主要仪器和设备 | 第41页 |
| ·主要药品及试剂 | 第41-42页 |
| ·缓冲液及常用试剂的配制 | 第42页 |
| ·主要生物学软件 | 第42-43页 |
| 3 试验方法 | 第43-53页 |
| ·猪AEBP1基因cDNA的分离 | 第43-48页 |
| ·猪组织RNA的提取和cDNA第一链的合成 | 第43-44页 |
| ·依据电子克隆策略设计引物 | 第44-45页 |
| ·RT-PCR方法扩增cDNA | 第45-46页 |
| ·PCR产物回收、克隆、测序和生物信息学分析 | 第46-48页 |
| ·猪AEBP1基因组DNA的分离 | 第48-50页 |
| ·猪血液基因组DNA的提取、浓度测定及质量检测 | 第48-49页 |
| ·根据猪AEBP1基因的cDNA序列设计引物 | 第49页 |
| ·猪AEBP1基因内含子的PCR扩增 | 第49-50页 |
| ·PCR产物回收、克隆、测序和生物信息学分析 | 第50页 |
| ·猪AEBP1和PNPLA2基因染色体精细定位 | 第50-51页 |
| ·猪AEBP1基因定位所用引物 | 第50页 |
| ·猪PNPLA2基因定位所用引物 | 第50页 |
| ·PCR扩增分型 | 第50-51页 |
| ·数据分析 | 第51页 |
| ·猪AEBP1／MCLP转录本的鉴定 | 第51页 |
| ·引物设计 | 第51页 |
| ·RT-PCR方法鉴定AEBP1／ACLP转录本 | 第51页 |
| ·猪AEBP1／ACLP转录本推导的蛋白质基本特征分析 | 第51-52页 |
| ·猪AEBP1／ACLP转录本转录水平组织表达谱分析 | 第52-53页 |
| ·RT-PCR反应 | 第52页 |
| ·猪AEBP1／ACLP转录本RT-PCR反应产物的检测 | 第52-53页 |
| 4 结果与分析 | 第53-66页 |
| ·猪AEBP1基因cDNA的分离结果 | 第53-54页 |
| ·猪组织总RNA的提取 | 第53页 |
| ·猪AEBP1基因各引物的RT-PCR扩增及测序 | 第53页 |
| ·猪AEBP1基因cDNA序列的生物信息学分析 | 第53-54页 |
| ·猪AEBP1基因组DNA的分离结果 | 第54-58页 |
| ·猪AEBP1基因DNA片段扩增结果 | 第54-55页 |
| ·猪AEBP1基因DNA序列生物信息学分析 | 第55-58页 |
| ·猪AEBP1和PNPLA2基因的染色体精细定位 | 第58-59页 |
| ·猪AEBP1／ACLP转录本鉴定结果 | 第59页 |
| ·猪AEBP1／ACLP转录本推导的蛋白质基本特征分析 | 第59-65页 |
| ·猪AEBP1／ACLP转录本转录水平组织表达谱 | 第65-66页 |
| 5 讨论 | 第66-72页 |
| ·分离猪AEBP1基因cDNA序列的策略 | 第66-67页 |
| ·猪AEBP1基因SNPs在基因组的分布 | 第67-68页 |
| ·猪AEBP1基因的定位 | 第68-69页 |
| ·猪AEBP1／ACLP转录本的鉴定 | 第69-71页 |
| ·猪AEBP1／ACLP转录本的表达差异 | 第71-72页 |
| 第三章 猪脂肪细胞分化相关基因AEBP1,PPARγ和ADD1的SNPs及性状关联分析 | 第72-85页 |
| 1 引言 | 第72页 |
| 2 试验材料 | 第72-73页 |
| ·试验猪群体和性状测定 | 第72-73页 |
| ·主要仪器设备及试剂 | 第73页 |
| ·PCR扩增引物 | 第73页 |
| ·主要生物学软件 | 第73页 |
| 3 试验方法 | 第73-75页 |
| ·猪AEBP1、PPARγ和ADD1基因PCR扩增和序列分析 | 第73-74页 |
| ·PCR扩增 | 第73页 |
| ·PCR产物电泳检测 | 第73页 |
| ·猪ADD1基因序列分析 | 第73-74页 |
| ·猪AEBP1和PPARγ基因PCR-RFLP分析 | 第74页 |
| ·统计分析 | 第74-75页 |
| 4 结果与分析 | 第75-83页 |
| ·猪AEBP1、PPARγ和ADD1基因PCR扩增结果 | 第75-76页 |
| ·猪ADD1基因的序列分析 | 第76页 |
| ·猪AEBP1和PPARγ基因PCR-RFLP结果 | 第76-77页 |
| ·猪AEBP1、PPARγ基因型频率及性状关联分析 | 第77-83页 |
| ·猪AEBP1基因的基因型频率及性状关联分析 | 第77-80页 |
| ·猪PPARγ基因型频率及性状关联分析 | 第80-83页 |
| 5 讨论 | 第83-85页 |
| ·内含子SNPs的生物学效应 | 第83页 |
| ·猪AEBP1和PPARγ基因在不同群体中基因型频率分布 | 第83页 |
| ·猪AEBP1和PPARγ基因遗传效应分析 | 第83-84页 |
| ·猪ADD1基因的SNPs | 第84-85页 |
| 第四章 猪脂肪沉积候选基因MC4R、MC5R和IGF2的性状关联分析 | 第85-99页 |
| 1 引言 | 第85页 |
| 2 试验材料 | 第85-86页 |
| ·试验猪群体和性状测定 | 第85-86页 |
| ·主要药品及试剂 | 第86页 |
| ·PCR扩增引物 | 第86页 |
| ·主要生物学软件 | 第86页 |
| 3 试验方法 | 第86-87页 |
| ·猪MC4R、MC5R和IGF2基因PCR扩增及检测 | 第86页 |
| ·PCR扩增 | 第86页 |
| ·PCR产物的电泳检测 | 第86页 |
| ·猪MC4R、MC5R和IGF2基因PCR-RFLP分析 | 第86-87页 |
| ·统计分析 | 第87页 |
| 4 结果与分析 | 第87-94页 |
| ·猪MC4R、MC5R和IGF2基因PCR扩增结果 | 第87-88页 |
| ·猪MC4R、MC5R和IGF2基因PCR-RFLP结果 | 第88-90页 |
| ·猪MC4R、MC5R和IGF2基因型频率及性状关联分析 | 第90-94页 |
| ·猪MC5R基因型频率及性状关联分析 | 第90-93页 |
| ·猪MC4R基因型频率及性状关联分析 | 第93页 |
| ·猪IGF2基因型频率及性状关联分析 | 第93-94页 |
| 5 讨论 | 第94-99页 |
| ·猪MC4R、MC5R和IGF2基因在不同群体中基因型频率分布 | 第94-96页 |
| ·候选基因的遗传效应分析 | 第96-99页 |
| 第五章 糖原代谢相关基因PRKAG3的性状关联分析 | 第99-108页 |
| 1 引言 | 第99页 |
| 2 试验材料 | 第99-100页 |
| ·试验猪群体和性状测定 | 第99页 |
| ·主要药品及试剂 | 第99页 |
| ·PCR扩增引物 | 第99页 |
| ·主要生物学软件 | 第99-100页 |
| 3 试验方法 | 第100页 |
| ·猪PRKAG3基因扩增及检测 | 第100页 |
| ·PCR扩增 | 第100页 |
| ·PCR产物的电泳检测 | 第100页 |
| ·猪PRKAG3基因PCR-RFLP分析 | 第100页 |
| ·统计分析 | 第100页 |
| 4 结果与分析 | 第100-104页 |
| ·猪PRKAG3基因PCR扩增结果 | 第100-101页 |
| ·猪PRKAG3基因PCR-RFLP结果 | 第101-102页 |
| ·猪PRKAG3基因型频率及性状关联分析 | 第102-104页 |
| ·I199V和G52S位点基因型频率分布 | 第102-103页 |
| ·199V和G52S位点基因型与猪肌内脂肪含量的关联分析 | 第103页 |
| ·I199V和G52S位点基因型与pH值的关联分析 | 第103-104页 |
| ·I199V和G52S位点基因型与失水率等性状的关联分析 | 第104页 |
| 5 讨论 | 第104-108页 |
| ·猪PRKAG3基因在不同群体中基因型频率分布 | 第104-107页 |
| ·猪PRKAG3基因遗传效应分析 | 第107-108页 |
| 小结 | 第108-111页 |
| 下一步工作 | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-126页 |
| 在读期间发表论文题录 | 第126-127页 |
| 附录 | 第127-159页 |
| 致谢 | 第159页 |
