| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-8页 |
| 第1章 相关文献综述 | 第8-20页 |
| ·统计显著性和生物显著性 | 第8-10页 |
| ·序列对位理论 | 第10-17页 |
| ·对位算法 | 第11-14页 |
| ·得分矩阵 | 第14-16页 |
| ·罚分系统 | 第16-17页 |
| ·序列对位的显著性研究现状 | 第17-19页 |
| ·本研究的内容和意义 | 第19-20页 |
| 第2章 序列的选择和处理 | 第20-31页 |
| ·序列的选择 | 第20-26页 |
| ·序列的随机化处理 | 第26-29页 |
| ·根据平均氨基酸组成产生随机序列(ACL) | 第26-27页 |
| ·根据真实序列的氨基酸组成分布和序列长度产生随机序列(CLA) | 第27页 |
| ·全局重排(CS) | 第27页 |
| ·局部重排(LS) | 第27-28页 |
| ·根据PAM矩阵模拟序列进化过程产生随机序列(SMP) | 第28-29页 |
| ·真实不相关序列的选择和处理 | 第29-31页 |
| 第3章 序列的全局对位 | 第31-38页 |
| ·得分系统的确定 | 第31页 |
| ·全局对位程序设计 | 第31-38页 |
| ·共用程序的设计 | 第31-34页 |
| ·不同序列的对位程序设计 | 第34-38页 |
| 第4章 对位得分的分布拟合 | 第38-49页 |
| ·备选拟合分布 | 第38页 |
| ·备选分布的参数估计 | 第38-40页 |
| ·伽玛分布的参数估计 | 第39页 |
| ·正态分布的参数估计 | 第39-40页 |
| ·极值分布的参数估计 | 第40页 |
| ·备选分布的函数拟合(卡方检验) | 第40-49页 |
| ·卡方检验和皮尔逊定理 | 第40-41页 |
| ·程序设计流程 | 第41页 |
| ·拟合结果 | 第41-49页 |
| 第5章 结果和讨论 | 第49-52页 |
| ·研究结果 | 第49-50页 |
| ·序列长度对拟合得到的三参数伽玛分布的影响 | 第49-50页 |
| ·块大小(window size)对拟合得到的三参数伽玛分布的影响 | 第50页 |
| ·得分系统对拟合得到的三参数伽玛分布的影响 | 第50页 |
| ·与前人工作的比较以及有待进一步研究的问题 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 作者简介 | 第57页 |
