| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述与研究目的及意义 | 第14-33页 |
| 1 文献综述 | 第14-30页 |
| ·遗传多样性的概念及意义 | 第14-15页 |
| ·遗传多样性的检测 | 第15-20页 |
| ·形态标记 | 第15页 |
| ·细胞学标记 | 第15页 |
| ·生化标记 | 第15页 |
| ·分子标记 | 第15-16页 |
| ·分子标记的分类及代表性技术的简介 | 第16-20页 |
| ·遗传多样性的度量方法 | 第20页 |
| ·微卫星标记详述及其在鱼类遗传多样性研究中的应用 | 第20-25页 |
| ·微卫星的发现 | 第20页 |
| ·微卫星的特点 | 第20-21页 |
| ·微卫星DNA的多态性及其产生的机理 | 第21-22页 |
| ·微卫星突变的理论模型 | 第22页 |
| ·微卫星DNA的功能 | 第22-24页 |
| ·微卫星序列的获得 | 第24页 |
| ·微卫星DNA标记技术的基本流程 | 第24-25页 |
| ·微卫星标记的优点及不足 | 第25页 |
| ·微卫星DNA标记在鱼类遗传多样性研究中的应用 | 第25页 |
| ·AFLP技术详述及其在鱼类遗传多样性研究中的应用 | 第25-30页 |
| ·AFLP基本原理 | 第25-26页 |
| ·AFLP的特点 | 第26-27页 |
| ·AFLP技术流程 | 第27-29页 |
| ·关于AFLP技术的评价 | 第29页 |
| ·AFLP技术在鱼类遗传多样性研究中的应用 | 第29-30页 |
| 2 黑斑原鮡的研究概况 | 第30-31页 |
| 3 研究目的与意义 | 第31-33页 |
| 第二章 利用AFLP技术对黑斑原鮡不同地理群体的遗传多样性研究 | 第33-46页 |
| 1 引言 | 第33页 |
| 2 材料和方法 | 第33-38页 |
| ·实验材料 | 第33-34页 |
| ·主要仪器 | 第34页 |
| ·主要试剂及溶液配制 | 第34-35页 |
| ·研究方法 | 第35-38页 |
| ·基因组DNA制备 | 第35-36页 |
| ·基因组DNA的酶切连接 | 第36页 |
| ·预扩增 | 第36-37页 |
| ·选择性扩增 | 第37页 |
| ·引物对的筛选 | 第37页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶检测 | 第37-38页 |
| ·数据整理分析 | 第38页 |
| 3 试验结果 | 第38-42页 |
| ·基因组DNA电泳检测 | 第38-39页 |
| ·选择性扩增产物的聚丙烯凝胶电泳检测 | 第39-40页 |
| ·群体遗传多样性 | 第40-42页 |
| ·群体间的遗传分化 | 第42页 |
| 4 讨论 | 第42-46页 |
| ·实验材料收集问题 | 第42-43页 |
| ·AFLP实验操作问题 | 第43页 |
| ·AFLP研究中多态性位点数的有效性 | 第43-44页 |
| ·黑斑原鮡遗传多样性问题 | 第44页 |
| ·黑斑原鮡资源保护及利用 | 第44-46页 |
| 第三章 利用微卫星标记对黑斑原鮡不同地理群体的遗传多样性研究 | 第46-56页 |
| 1 引言 | 第46页 |
| 2 材料与方法: | 第46-48页 |
| ·试验材料 | 第46页 |
| ·主要实验仪器和试剂 | 第46页 |
| ·实验仪器 | 第46页 |
| ·主要试剂 | 第46页 |
| ·研究方法 | 第46-48页 |
| ·基因组DNA的提取及定量 | 第46页 |
| ·PCR扩增 | 第46页 |
| ·电泳分离和银染显影 | 第46-47页 |
| ·数据分析 | 第47-48页 |
| 3 结果 | 第48-53页 |
| ·微卫星座位上的PCR扩增和变异 | 第48-50页 |
| ·微卫星位点的遗传多样性 | 第50-52页 |
| ·群体内的遗传多样性 | 第52-53页 |
| 4 讨论 | 第53-56页 |
| ·微卫星座位的保守性和变异性 | 第53-54页 |
| ·黑斑原鮡群体遗传多样性 | 第54页 |
| ·群体间遗传变异 | 第54-55页 |
| ·SSR和AFLP两种标记系统的比较 | 第55-56页 |
| 第四章 构建微卫星富集文库筛选微卫星序列 | 第56-70页 |
| 1 前言 | 第56页 |
| 2 材料与方法 | 第56-62页 |
| ·材料 | 第56-59页 |
| ·实验材料 | 第56页 |
| ·菌株 | 第56页 |
| ·载体和酶 | 第56-57页 |
| ·接头引物序列 | 第57页 |
| ·探针 | 第57页 |
| ·载体PCR引物 | 第57页 |
| ·试剂盒 | 第57页 |
| ·主要仪器和药品 | 第57-59页 |
| ·方法 | 第59-62页 |
| ·基因组DNA的制备(同第二章) | 第59页 |
| ·构建微卫星富集文库 | 第59-60页 |
| ·连接反应 | 第60-61页 |
| ·转化 | 第61页 |
| ·PCR方法筛选含有微卫星序列的阳性克隆 | 第61页 |
| ·测序 | 第61页 |
| ·序列分析 | 第61-62页 |
| 3 试验结果 | 第62-68页 |
| ·基因组DNA提取结果 | 第62页 |
| ·基因组DNA的酶切检测及回收 | 第62页 |
| ·连接片段PCR扩增结果 | 第62-63页 |
| ·双链DNA目的片段的检测 | 第63页 |
| ·PCR方法筛选含微卫星的阳性克隆的结果 | 第63-65页 |
| ·阳性克隆的测序结果及序列特征分析 | 第65-68页 |
| 4 讨论 | 第68-70页 |
| ·探针的选择 | 第68页 |
| ·酶切片段的大小及酶的种类 | 第68页 |
| ·测序过程中出现信号衰减的讨论 | 第68-69页 |
| ·微卫星序列特征分析 | 第69-70页 |
| 第五章 微卫星标记的筛选及通用性的检测 | 第70-84页 |
| 1 前言 | 第70页 |
| 2 材料与方法 | 第70-73页 |
| ·实验材料 | 第70页 |
| ·实验设备和试剂 | 第70-71页 |
| ·实验方法 | 第71-73页 |
| ·模板DNA的提取(同第二章) | 第71页 |
| ·微卫星引物设计 | 第71-72页 |
| ·微卫星引物的初步筛选 | 第72页 |
| ·微卫星多态性引物的筛选 | 第72-73页 |
| ·微卫星标记的通用性检测 | 第73页 |
| ·数据分析 | 第73页 |
| 3 试验结果 | 第73-81页 |
| ·引物设计 | 第73-74页 |
| ·初步筛选结果 | 第74-75页 |
| ·多态性微卫星引物的筛选结果 | 第75-76页 |
| ·通过跨属扩增得到的多态性微卫星标记 | 第76-78页 |
| ·数据统计与分析 | 第78-81页 |
| ·黑斑原鮡微卫星DNA数据分析 | 第79-81页 |
| ·黄斑褶鮡微卫星DNA多态数据分析 | 第81页 |
| 4 讨论 | 第81-84页 |
| ·黑斑原鮡微卫星引物设计中微卫星序列的选取 | 第81-82页 |
| ·微卫星引物初筛和复筛时模板的选取 | 第82页 |
| ·跨种扩增微卫星位点进行多态性分析 | 第82-84页 |
| 第六章 结论 | 第84-86页 |
| 1 主要研究结果 | 第84页 |
| 2 创新之处 | 第84-85页 |
| 3 展望 | 第85-86页 |
| 主要参考文献: | 第86-103页 |
| 附图:黑斑原鮡部分微卫星序列在Genebank的登录情况 | 第103-107页 |
| 在学期间的论文情况: | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
