| 缩略词表 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-40页 |
| ·染色质是真核生物基因表达与调控的物质基础 | 第12-13页 |
| ·表观遗传学(Epigenetics) | 第13-14页 |
| ·组蛋白末端的动力学修饰变化及与之相关的修饰酶 | 第14-33页 |
| ·组蛋白尾部修饰的类型 | 第14-15页 |
| ·组蛋白尾部的修饰与转录调控 | 第15-17页 |
| ·组蛋白乙酰化与去乙酰化 | 第17-20页 |
| ·组蛋白甲基化与去甲基化 | 第20-28页 |
| ·组蛋白去甲基化及与之相关的酶 | 第28-32页 |
| ·其它的组蛋白末端修饰 | 第32-33页 |
| ·DNA甲基化与去甲基化 | 第33-35页 |
| ·"第5种碱基" | 第33页 |
| ·DNA甲基转移酶 | 第33-34页 |
| ·DNA去甲基化酶 | 第34-35页 |
| ·基因的命名法 | 第35-36页 |
| ·植物表观基因组学研究进展 | 第36-37页 |
| ·几种研究表观遗传的技术和方法 | 第37-39页 |
| ·DNA甲基化分析方法 | 第37-38页 |
| ·染色质免疫沉淀 | 第38页 |
| ·免疫染色 | 第38-39页 |
| ·PICh(Proteomics of Isolated Chromatin segments) | 第39页 |
| ·本研究的目的和意义: | 第39-40页 |
| 2 材料与方法 | 第40-55页 |
| ·水稻材料与来源 | 第40页 |
| ·菌株 | 第40页 |
| ·基因序列分析 | 第40页 |
| ·载体的构建 | 第40-41页 |
| ·农杆菌介导的遗传转化 | 第41-42页 |
| ·基因枪介导的瞬时表达与GFP观察 | 第42页 |
| ·核酸操作方法 | 第42-44页 |
| ·DNA抽提与Southern杂交 | 第42-43页 |
| ·RNA抽提和Northern杂交分析 | 第43页 |
| ·RT-PCR和实时定量RT-PCR分析 | 第43页 |
| ·Small RNA文库的构建 | 第43-44页 |
| ·蛋白质操作方法 | 第44-47页 |
| ·蛋白原核表达,纯化及体外去甲基化酶活实验 | 第44-45页 |
| ·水稻叶片组蛋白的抽提 | 第45页 |
| ·水稻总蛋白的抽提方法 | 第45页 |
| ·细胞质蛋白与细胞核蛋白的分离方法 | 第45-46页 |
| ·Western杂交及所用抗体 | 第46页 |
| ·OsSRT1和JMJ706抗体的获得 | 第46-47页 |
| ·水稻染色质操作相关实验 | 第47-55页 |
| ·DNA甲基化分析 | 第47页 |
| ·染色质免疫沉淀 | 第47-48页 |
| ·原位免疫染色 | 第48-55页 |
| 3 结果与分析 | 第55-102页 |
| ·OsSRT1基因功能的研究 | 第55-58页 |
| ·OsSRT1可去除组蛋白H3K9位点的乙酰化修饰 | 第55-56页 |
| ·OsSRT1抗原表达、纯化、抗体制备、检测与纯化 | 第56-58页 |
| ·使用纯化抗体构建ChIP-Seq文库 | 第58页 |
| ·水稻组蛋白去甲基化酶基因家族 | 第58-65页 |
| ·水稻组蛋白去甲基化酶家族基因序列分析 | 第58-65页 |
| ·RT-PCR分析部分jmjC家族基因的表达谱 | 第65页 |
| ·水稻JMJ706基因功能缺失后导致花发育异常 | 第65-70页 |
| ·JMJ706基因功能缺失突变体材料的获得 | 第65-66页 |
| ·JMJ706突变体导致花发育异常 | 第66-70页 |
| ·JMJ706是一个组蛋白H3K9去甲基化酶 | 第70-74页 |
| ·JMJ706体外的去甲基化酶活性分析 | 第70-71页 |
| ·JMJ706突变体的组蛋白修饰情况 | 第71-73页 |
| ·超量表达JMJ706植株的H3K9甲基化修饰情况 | 第73-74页 |
| ·JMJ706基因全长cDNA互补以及amiRNA转化验证 | 第74-80页 |
| ·用于全长cDNA互补载体的改造 | 第74-76页 |
| ·互补载体的构建及转化 | 第76-78页 |
| ·互补材料的获得及检测 | 第78-79页 |
| ·利用人工小RNA(amiRNA)技术对JMJ706进行抑制 | 第79-80页 |
| ·JMJ706蛋白在细胞内的精确定位 | 第80-81页 |
| ·JMJ706洋葱表皮的亚细胞定位分析 | 第80页 |
| ·JMJ706在细胞核内的精细定位 | 第80-81页 |
| ·JMJ706突变后引起花发育突变的原因分析 | 第81-85页 |
| ·JMJ706突变引起部分花发育相关基因的表达发生改变 | 第81-83页 |
| ·JMJ706表观调控OsMADS47和DH1基因 | 第83-85页 |
| ·JMJ706与基因表达 | 第85-95页 |
| ·DNA甲基化分析异染色质相关区域 | 第85-86页 |
| ·野生型和突变体两个时期的全基因组芯片分析 | 第86-89页 |
| ·Os03g02470基因表达和DNA甲基化修饰情况 | 第89-94页 |
| ·野生型和突变体两个时期的small RNA cDNA文库的构建 | 第94-95页 |
| ·JMJ706与SUVH家族基因之间的关系分析 | 第95-99页 |
| ·SUVH基因在jmj6中的表达情况 | 第95-96页 |
| ·构建水稻SUVH亚家族基因amiRNA载体并转化jmj6 | 第96-98页 |
| ·amiSDG转基因植株表达量分析 | 第98-99页 |
| ·JMJ706抗体制备 | 第99-102页 |
| 4 讨论 | 第102-112页 |
| ·水稻去乙酰化酶OsSRT1功能的探讨 | 第102页 |
| ·植物组蛋白去甲基化酶与其他物种的不同 | 第102-105页 |
| ·JMJ706去甲基化酶活性及可能行使的染色质调节功能 | 第105页 |
| ·JMJ706可影响水稻的多种发育过程 | 第105-109页 |
| ·JMJ706突变引起不同的花形态突变 | 第105-106页 |
| ·JMJ706突变后影响种子的胚乳发育 | 第106-108页 |
| ·JMJ706突变后影响水稻开花期 | 第108-109页 |
| ·针对JMJ706深入的功能探讨 | 第109-110页 |
| ·JMJ706控制基因的表达 | 第109-110页 |
| ·JMJ706与水稻SUVH基因之间的功能关系 | 第110页 |
| ·其它jmjC基因可能的功能 | 第110-111页 |
| ·组蛋白末端的表观动力学修饰与植物的生长发育 | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-129页 |
| 附录 | 第129-145页 |
| 附录A | 第129-144页 |
| 附录B | 第144-145页 |
| 致谢 | 第145页 |
