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基因微阵列特征选择与分类方法研究

ABSTRACT第1-7页
摘要第7-13页
CHAPTER 1 INTRODUCTION第13-20页
   ·Background第13-17页
   ·Roadmap of this thesis第17-20页
CHAPTER 2 A HYBRID PSO-BFGS STRATEGY FOR GLOBAL OPTIMIZATION OF MULTIMODAL FUNCTIONS第20-41页
   ·Introduction第20-21页
   ·PSO-BFGS strategy第21-28页
     ·Canonical particle swarm optimization第21-22页
     ·Premature convergence and local swarm diversity第22页
     ·Modification of BFGS method第22-23页
     ·Territory technique第23-24页
     ·Reposition technique第24-25页
     ·General scheme of PSO-BFGS strategy第25-27页
     ·Reconstruction technique第27-28页
   ·Benchmark tests and discussions第28-39页
     ·Experimental setup第28-30页
     ·Experimental results and discussions第30-39页
   ·Conclusions第39-41页
CHAPTER 3 TUNING SVM PARAMETERS USING A HYBRID CLPSO-BFGS ALGORITHM第41-58页
   ·Introduction第41-42页
   ·Preliminary studies第42-45页
     ·SVM formulations第42-43页
     ·Existing generalization error bounds第43-45页
   ·Proposed method第45-49页
     ·BFGS method for SVM parameter tuning第45-46页
     ·CLPSO-BFGS for tuning SVM parameters第46-49页
   ·Experimental results and discussions第49-57页
     ·Parameter settings第49页
     ·Derivative calculation of the LOO bounds第49-50页
     ·Benchmark datasets第50-51页
     ·Experimental results第51-57页
   ·Conclusions第57-58页
CHAPTER 4 GENE SELECTION AND TISSUE CLASSIFICATION BASED ON SUPPORT VECTOR MACHINE AND GENETIC ALGORITHM第58-65页
   ·Introduction第58-59页
   ·The proposed method第59-62页
     ·Coarse selection with Wilcoxon-test第59-60页
     ·Data normalization第60页
     ·Fine selection with SVM第60-61页
     ·Parameter optimization with GA第61-62页
   ·Experimental results第62-64页
     ·Dataset description and performance evaluation第62页
     ·Experimental setup第62-63页
     ·Experimental results第63-64页
   ·Conclusions第64-65页
CHAPTER 5 GRAPH EMBEDDING BASED FEATURE SELECTION第65-82页
   ·Introduction第65-67页
   ·Prior knowledge: graph embedding for feature extraction第67-70页
   ·Graph embedding based feature selection第70-74页
     ·MFA score based filter methods for feature selection第72-74页
     ·Complexity analysis第74页
   ·Experiments第74-81页
     ·Data preparation and performance evaluations第74-75页
     ·Model selection第75-76页
     ·Toy experiments第76-77页
     ·Real-data experiments第77-81页
   ·Conclusions第81-82页
CONCLUSION AND FUTURE WORK第82-85页
REFERENCES第85-94页
ACKNOWLEDGEMENTS第94-95页
APPENDICES A第95页

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