| 中文摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-11页 |
| ·研究背景及意义 | 第7页 |
| ·基因调控网络构建的问题描述及研究现状 | 第7-9页 |
| ·问题描述 | 第7-8页 |
| ·研究现状 | 第8-9页 |
| ·论文的研究内容和主要工作 | 第9页 |
| ·论文结构安排 | 第9-11页 |
| 第二章 基因调控网络构建综述 | 第11-17页 |
| ·基因调控网络构建概述 | 第11-12页 |
| ·生物数据源 | 第12-14页 |
| ·核酸序列数据库 | 第12页 |
| ·微阵列数据库 | 第12-13页 |
| ·蛋白质序列数据库 | 第13页 |
| ·蛋白质相互作用数据库 | 第13-14页 |
| ·功能数据库 | 第14页 |
| ·基因调控网络构建方法 | 第14-16页 |
| ·多源数据融合的研究现状 | 第16页 |
| ·小结 | 第16-17页 |
| 第三章 基于变结构DBN 模型与多源数据融合的网络构建算法 | 第17-37页 |
| ·数据预处理 | 第18-22页 |
| ·基因表达数据预处理 | 第18-21页 |
| ·蛋白质相互作用数据预处理 | 第21-22页 |
| ·基因表达数据的动态平稳性分析 | 第22-26页 |
| ·基因表达数据的非平稳度测量 | 第22-23页 |
| ·基因表达数据的平稳区间识别 | 第23-25页 |
| ·平稳区间内的基因筛选 | 第25-26页 |
| ·变结构动态贝叶斯网络学习算法设计 | 第26-34页 |
| ·动态贝叶斯网络与变结构动态贝叶斯网络 | 第26-29页 |
| ·动态贝叶斯网络学习算法 | 第29-33页 |
| ·变结构动态贝叶斯网络构造算法 | 第33-34页 |
| ·多源数据融合方案 | 第34-37页 |
| ·融合protein-protein interaction 数据 | 第35页 |
| ·融合protein complex 数据 | 第35-37页 |
| 第四章 基因调控网络构建平台的设计与实现 | 第37-41页 |
| ·GRN Constructor 功能分析 | 第37-38页 |
| ·GRN Constructor 架构设计 | 第38-39页 |
| ·GRN Constructor 的实现 | 第39-41页 |
| 第五章 实验数据的选取及试验结果分析 | 第41-55页 |
| ·多源生物数据的获取 | 第41-43页 |
| ·基因表达数据的获取 | 第41-42页 |
| ·蛋白质相互作用数据的获取 | 第42页 |
| ·Pathway 数据的获取 | 第42-43页 |
| ·实验结果评价标准介绍 | 第43-44页 |
| ·实验结果分析 | 第44-55页 |
| ·数据预处理结果分析 | 第44页 |
| ·平稳性分析结果分析 | 第44-46页 |
| ·网络构建结果分析 | 第46-54页 |
| ·实验结果的总体分析及结论 | 第54-55页 |
| 第六章 总结与展望 | 第55-57页 |
| ·全文总结 | 第55-56页 |
| ·工作展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-60页 |
| 发表论文和科研情况说明 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |