| 致谢 | 第1-11页 |
| 摘要 | 第11-13页 |
| Abstract | 第13-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-42页 |
| 1 洋葱伯克氏菌的种群多样性及其分类地位 | 第16-17页 |
| 2 Bcc在环境中的重要性及其分布情况 | 第17-24页 |
| ·Bcc在环境中的益处 | 第17-20页 |
| ·Bcc作为植物病害生防菌 | 第17-18页 |
| ·Bcc作为植物促生菌 | 第18-19页 |
| ·Bcc作为生物降解菌 | 第19-20页 |
| ·Bcc的潜在风险 | 第20-21页 |
| ·Bcc作为植物病原菌 | 第20页 |
| ·Bcc作为植物冰核菌 | 第20-21页 |
| ·Bcc作为人体条件致病菌 | 第21页 |
| ·Bcc在医院环境中的分布 | 第21-22页 |
| ·Bcc自然在环境中的分布情况 | 第22-23页 |
| ·关于环境中的Bcc对人体的危险性的探讨 | 第23-24页 |
| 3 Bcc菌的鉴定方法研究进展 | 第24-28页 |
| ·表型鉴定 | 第24-25页 |
| ·全细胞蛋白电泳 | 第25-26页 |
| ·全细胞脂肪酸分析 | 第26页 |
| ·AFLP分析 | 第26-27页 |
| ·基于16S rRNA的鉴定方法 | 第27页 |
| ·基于recA基因的鉴定方法 | 第27-28页 |
| ·基于其他保守基因的鉴定方法 | 第28页 |
| 4 多位点测序分型技术(MLST) | 第28-31页 |
| 5 Bcc的致病性 | 第31-35页 |
| ·Bcc致病因子 | 第31-32页 |
| ·Bcc致病模型研究进展 | 第32-35页 |
| 6 壳聚糖的杀菌机制及其对Bcc的抑制效果 | 第35-40页 |
| ·壳聚糖的杀菌机制 | 第35-38页 |
| ·壳聚糖对Bcc的抑制效果 | 第38-40页 |
| 7 本研究的目的和意义 | 第40-42页 |
| 第二章 竹子和桑树根围洋葱伯克氏菌的分离与常规鉴定 | 第42-52页 |
| 1 材料和方法 | 第43-45页 |
| ·标准菌株与主要培养基 | 第43页 |
| ·样本的采集和处理 | 第43页 |
| ·细菌的分离和纯化 | 第43-44页 |
| ·Bcc菌群的PCR鉴定 | 第44-45页 |
| ·DNA的提取 | 第44页 |
| ·Bcc菌群的PCR反应 | 第44-45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-49页 |
| ·Bcc菌群的PCR鉴定 | 第45-46页 |
| ·Bcc菌群在三种植物根围土壤中的分布情况 | 第46-49页 |
| ·Bcc在毛竹根围的分布 | 第46-47页 |
| ·Bcc在雷竹根围的分布 | 第47-48页 |
| ·Bcc在桑树根围的分布 | 第48-49页 |
| 3 结论与讨论 | 第49-51页 |
| ·不同选择性培养基对Bcc菌的分离率 | 第49页 |
| ·Bcc菌群的鉴定及与疑似菌株的区分 | 第49-50页 |
| ·Bcc菌群在不同植物根围的分布情况 | 第50-51页 |
| 4 本章小结 | 第51-52页 |
| 第三章 竹子和桑树根围洋葱伯克氏菌的特异性鉴定 | 第52-90页 |
| 1 材料和方法 | 第53-57页 |
| ·供试菌株和主要试剂 | 第53页 |
| ·Bcc菌DNA模板的制备和recA基因的扩增 | 第53页 |
| ·限制性酶切长度多态性(RFLP)分析 | 第53页 |
| ·Bcc基因型特异性引物PCR鉴定 | 第53-54页 |
| ·Bcc菌recA基因PCR产物的测序 | 第54-55页 |
| ·Bcc菌recA基因的序列分析和聚类分析 | 第55页 |
| ·多位点序列分型(MLST)分析 | 第55-57页 |
| ·Bcc菌的菌株多样性分析(BOX-PCR指纹图谱) | 第57页 |
| 2 结果与分析 | 第57-76页 |
| ·Bcc菌recA基因的RFLP分析 | 第57-61页 |
| ·Bcc菌recA基因的HaeⅢ-RFLP分析 | 第57-60页 |
| ·Bcc菌recA基因的MnlⅠ-RFLP分析 | 第60-61页 |
| ·基因型特异性PCR结果 | 第61-63页 |
| ·毛竹根围土壤来源Bcc菌的特异性PCR结果 | 第61页 |
| ·雷竹根围土壤来源Bcc菌的特异性PCR结果 | 第61-62页 |
| ·桑树根围土壤米源Bcc菌的特异性PCR结果 | 第62-63页 |
| ·无法通过特异性PCR鉴定的菌株 | 第63-64页 |
| ·毛竹根围土壤Bcc菌中待确认的菌株 | 第63页 |
| ·雷竹根围土壤Bcc菌中待确认的菌株 | 第63页 |
| ·桑树根围土壤Bcc菌中待确认的菌株 | 第63-64页 |
| ·Bcc菌recA基因序列分析 | 第64-69页 |
| ·毛竹根围Bcc菌的recA基因序列分析 | 第64-67页 |
| ·雷竹根围Bcc菌的recA基因序列分析 | 第67-68页 |
| ·桑树根围Bcc菌的recA基因序列分析 | 第68-69页 |
| ·Bcc菌的多位点序列分型(MLST)鉴定 | 第69-71页 |
| ·不同植物根围土壤中的Bcc基因型分布 | 第71-74页 |
| ·毛竹根围土壤中Bcc菌的基因型分布 | 第71-72页 |
| ·雷竹根围土壤中Bcc菌的基因型分布 | 第72-73页 |
| ·桑树根围土壤中Bcc菌的基因型分布 | 第73-74页 |
| ·Bcc的菌株多样性分析 | 第74-76页 |
| 3 结论与讨论 | 第76-81页 |
| ·毛竹、雷竹和桑树根围土壤中Bcc菌的多样性 | 第76-80页 |
| ·选择性培养基对Bcc不同基因型的偏好性 | 第77页 |
| ·不同采样地点Bcc菌群的多样性比较 | 第77-78页 |
| ·不同植物根围土壤中优势基因型分析 | 第78-79页 |
| ·不同植物根围土壤中Bcc菌的潜在风险 | 第79-80页 |
| ·各项鉴定技术对Bcc的种群研究 | 第80-81页 |
| 4 本章小结 | 第81-90页 |
| 第四章 洋葱伯克氏菌的致病毒力研究 | 第90-106页 |
| 1 材料和方法 | 第91-94页 |
| ·供试菌株和主要试剂 | 第91页 |
| ·Bcc菌的活化和培养 | 第91页 |
| ·Bcc菌在洋葱鳞茎上的致病性研究 | 第91-92页 |
| ·Bcc菌在苜蓿模型上的毒力研究 | 第92-93页 |
| ·Bcc菌悬液的准备 | 第92页 |
| ·苜蓿种子的预处理 | 第92-93页 |
| ·苜蓿幼苗接种 | 第93页 |
| ·Bcc菌在生菜模型上的毒力研究 | 第93-94页 |
| ·Bcc菌悬液的准备 | 第93页 |
| ·Bcc菌在生菜上的致病性 | 第93-94页 |
| 2 结果与分析 | 第94-103页 |
| ·Bcc菌株对洋葱的致病性 | 第94-95页 |
| ·B.stabilis菌株对洋葱的致病性 | 第94页 |
| ·B.anthina菌株对洋葱的致病性 | 第94页 |
| ·B.pyrrocinia菌株对洋葱的致病性 | 第94页 |
| ·B.arboris菌株对洋葱的致病性 | 第94-95页 |
| ·9株疑似Bcc新种的菌株对洋葱的致病性 | 第95页 |
| ·不同种的Bcc菌对洋葱的致病差异 | 第95页 |
| ·洋葱伯克氏菌对苜蓿幼苗的毒力表现 | 第95-98页 |
| ·B.stabilis菌株对苜蓿的毒力表现 | 第96页 |
| ·B.anthina菌株对洋葱的毒力表现 | 第96页 |
| ·B.pyrrocinia菌株对洋葱的毒力表现 | 第96-97页 |
| ·B.arboris菌株对苜蓿的毒力表现 | 第97页 |
| ·9株疑似Bcc新种的菌株对苜蓿的毒力表现 | 第97页 |
| ·不同种的Bcc菌对苜蓿的毒力差异 | 第97-98页 |
| ·洋葱伯克氏菌对生菜的致病毒力 | 第98-103页 |
| ·毛竹根围土壤Bcc菌对生菜的毒力表现 | 第98-100页 |
| ·雷竹根围土壤Bcc菌对生菜的致病毒力 | 第100-101页 |
| ·桑树根围土壤Bcc菌对生菜的致病毒力 | 第101-102页 |
| ·不同种Bcc菌对生菜的致病毒力 | 第102-103页 |
| 3 结论与讨论 | 第103-105页 |
| ·Bcc菌对洋葱的致病性 | 第103页 |
| ·Bcc菌对苜蓿的致病毒力 | 第103-104页 |
| ·Bcc菌对生菜的致病毒力 | 第104-105页 |
| 4 本章小结 | 第105-106页 |
| 第五章 壳聚糖对洋葱伯克氏菌的抑菌机理研究 | 第106-122页 |
| 1 材料和方法 | 第107-111页 |
| ·供试菌株和主要试剂 | 第107页 |
| ·壳聚糖分子量和脱乙酰度的测定 | 第107页 |
| ·Bcc菌的活化和培养和壳聚糖母液的配置 | 第107-108页 |
| ·细菌悬浮液的制备和活菌计数方法 | 第108页 |
| ·壳聚糖对浮游态Bcc菌的抑菌实验 | 第108页 |
| ·壳聚糖对生物膜Bcc菌的抑菌实验 | 第108-109页 |
| ·壳聚糖对Bcc菌细胞膜完整性的影响 | 第109页 |
| ·壳聚糖对Bcc菌细胞膜通透性的影响 | 第109-110页 |
| ·透射电镜观察(TEM) | 第110-111页 |
| 2 结果与分析 | 第111-118页 |
| ·壳聚糖对浮游态Bcc菌的抑菌实验 | 第111-112页 |
| ·壳聚糖种类以及浓度对抑制Bcc菌的影响 | 第111页 |
| ·壳聚糖处理Bcc的时间对其抑制作用的影响 | 第111-112页 |
| ·壳聚糖抑制B.seminalis的机制 | 第112-117页 |
| ·壳聚糖对B.seminalis细胞膜完整性的影响 | 第112-115页 |
| ·壳聚糖对B.seminalis细胞膜外膜通透性的影响 | 第115-116页 |
| ·壳聚糖处理B.seminalis的透射电镜观察 | 第116-117页 |
| ·壳聚糖对B.seminalis生物膜的抑制作用 | 第117-118页 |
| 3 结论与讨论 | 第118-121页 |
| ·壳聚糖对浮游态B.seminalis的抑菌作用 | 第118-119页 |
| ·壳聚糖抑制B.seminalis的机制 | 第119-120页 |
| ·壳聚糖对B.seminalis生物膜的影响 | 第120-121页 |
| 4 本章小结 | 第121-122页 |
| 参考文献 | 第122-140页 |
| 附录 | 第140-141页 |
