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水稻组蛋白甲基转移酶和去乙酰化酶基因的功能研究

缩略词表第1-8页
摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
1. 文献综述第12-38页
   ·表观遗传学概述第12-16页
     ·表观遗传学概念的发展第12-14页
     ·经典遗传学与表观遗传学第14-16页
   ·染色质是真核生物表观遗传调控的物质基础第16-19页
     ·核小体是染色质的基本单位第16-18页
     ·常染色质与异染色质第18-19页
   ·表观遗传调控的分子机制第19-33页
     ·DNA甲基化与去甲基化第19-22页
     ·组蛋白修饰第22-31页
     ·染色质重塑(Chromatin remodelling)第31页
     ·其它调控机制第31-33页
   ·组蛋白HMTs和HDACs在植物基因表达调控和发育中的作用第33-36页
     ·组蛋白甲基化与植物基因调控和发育第33-34页
     ·组蛋白乙酰化/去乙酰化与植物基因调控和发育第34-36页
   ·研究表观遗传的几种技术和方法第36-37页
     ·染色质免疫沉淀第36页
     ·DNA甲基化分析第36-37页
   ·本研究的目的和意义第37-38页
2. 材料与方法第38-50页
   ·水稻材料第38页
   ·水稻组蛋白甲基转移酶基因和去乙酰化酶基因的获取第38-39页
     ·水稻组蛋白甲基转移酶基因和去乙酰化酶基因的整理和归类第38页
     ·序列分析第38页
     ·水稻组蛋白甲基转移酶基因和去乙酰化酶基因的获取第38-39页
   ·实验所用到的菌株、质粒、载体和感受态细胞第39页
   ·DNA的抽提和SOUTHERN杂交第39-40页
   ·RNA的抽提、反转录和NORTHERN杂交第40页
   ·PCR、RT-PCR和REAL-TIME PCR的检测第40-41页
   ·组织切片第41页
   ·遗传转化第41页
   ·GFP观察第41-42页
   ·组蛋白抽提和WESTERN印迹第42-43页
   ·蛋白原核表达与纯化第43-44页
   ·组蛋白甲基转移酶体外活性测定第44页
   ·DNA胞嘧啶甲基化分析第44页
   ·染色质免疫沉淀(CHIP)第44-50页
3. 结果与分析第50-91页
   ·水稻基因组中组蛋白甲基转移酶基因的序列分析与转基因材料的获得第50-58页
     ·水稻组蛋白甲基转移酶SET基因的序列分析第50-56页
     ·遗传转化材料的获得第56-58页
   ·转基因材料分析与组蛋白甲基转移酶基因功能分析第58-84页
     ·水稻组蛋白甲基转移酶基因结构分析及全长的分析第58页
     ·水稻SUVH基因的表达模式第58-61页
     ·水稻SUVH转基因材料RNA水平表达分析第61-63页
     ·水稻组蛋白甲基转移酶SUVH基因下调表达引起发育表型变化第63-69页
     ·Western Blot检测SUVH转基因植株的组蛋白修饰情况第69-71页
     ·SDG728是一个组蛋白H3K9甲基转移酶第71-76页
     ·SDG728调控DNA甲基化第76-78页
     ·SDG728参与对反转座子的抑制第78-82页
     ·SDG728调控反转座子位点的组蛋白H3K9三甲基化水平第82-84页
   ·水稻基因组中组蛋白去乙酰化酶基因的序列分析与功能研究第84-91页
     ·水稻组蛋白去乙酰化酶基因的序列获得与分析第84-85页
     ·水稻组蛋白去乙酰化酶基因表达模式分析第85-87页
     ·水稻HDAC转基因材料分析与功能研究第87-91页
4. 讨论第91-96页
   ·OsSUVH基因家族进化第91页
   ·OsSUVH基因家族的表达谱与功能分析第91-92页
   ·OsSUVH基因家族与JMJ706之间的关系第92-93页
   ·SDG728具有H3K9三甲基化功能第93-94页
   ·SDG728抑制反转座子的表达第94页
   ·组蛋白HDAC基因在水稻中的功能第94-96页
参考文献第96-120页
附录Ⅰ 部分实验的操作流程第120-130页
作者简介第130-132页
致谢第132-133页

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