| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第1章 文献综述 | 第12-20页 |
| 1.1 鱼类遗传多样性和遗传结构的研究 | 第12页 |
| 1.1.1 遗传多样性和遗传结构的内涵 | 第12页 |
| 1.2 分子标记技术及其应用 | 第12-16页 |
| 1.2.1 线粒体DNA标记及其在鱼类群体遗传研究中的应用 | 第13-14页 |
| 1.2.2 微卫星标记及其在鱼类群体遗传研究中的应用 | 第14-15页 |
| 1.2.3 主要组织相容性复合体(MHC)及其在鱼类群体遗传中的应用 | 第15-16页 |
| 1.3 胭脂鱼的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.3.1 胭脂鱼生物学研究 | 第16-17页 |
| 1.3.2 胭脂鱼遗传多样性研究 | 第17-18页 |
| 1.4 本研究的目的意义 | 第18-20页 |
| 第2章 基于线粒体DNA的胭脂鱼遗传多样性的分析 | 第20-38页 |
| 2.1 引言 | 第20页 |
| 2.2 材料与方法 | 第20-22页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第20页 |
| 2.2.2 基因组DNA提取 | 第20-21页 |
| 2.2.3 引物设计 | 第21页 |
| 2.2.4 PCR扩增 | 第21-22页 |
| 2.2.5 线粒体Cytb和CR遗传多样性分析 | 第22页 |
| 2.2.6 基于mtDNA的系统发育以及单倍型网络图分析 | 第22页 |
| 2.2.7 遗传分化分析 | 第22页 |
| 2.2.8 种群历史动态分析 | 第22页 |
| 2.3 结果 | 第22-33页 |
| 2.3.1 序列多态性 | 第22-24页 |
| 2.3.2 单倍型分布及系统发育分析 | 第24-28页 |
| 2.3.3 种群结构、分化和分子方差分析 | 第28-30页 |
| 2.3.4 基于线粒体DNA的胭脂鱼群体历史动态分析 | 第30-33页 |
| 2.4 讨论 | 第33-36页 |
| 2.4.1 养殖胭脂鱼与其他养殖鱼类的遗传多样性比较 | 第33-35页 |
| 2.4.2 四个胭脂鱼养殖群体间的遗传多样性差异 | 第35-36页 |
| 2.4.3 研究鱼类养殖群体遗传多样性时分子标记的选择 | 第36页 |
| 2.5 小结 | 第36-38页 |
| 第3章 基于微卫星分子标记的胭脂鱼遗传多样性研究 | 第38-58页 |
| 3.1 引言 | 第38页 |
| 3.2 材料与方法 | 第38-41页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第38页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第38-40页 |
| 3.2.3 数据统计分析 | 第40-41页 |
| 3.3 结果 | 第41-53页 |
| 3.3.1 胭脂鱼基因组中微卫星数量统计 | 第41页 |
| 3.3.2 胭脂鱼多态性微卫星标记的开发 | 第41-42页 |
| 3.3.3 基于微卫星分子标记的胭脂鱼遗传多样性 | 第42-52页 |
| 3.3.4 四个胭脂鱼群体间的遗传分化和遗传距离 | 第52-53页 |
| 3.3.5 胭脂鱼群体遗传结构分析 | 第53页 |
| 3.4 讨论 | 第53-56页 |
| 3.4.1 胭脂鱼多态性微卫星标记的筛选方法 | 第53-54页 |
| 3.4.2 胭脂鱼种群的遗传多样性水平 | 第54-56页 |
| 3.4.3 胭脂鱼群体的分化 | 第56页 |
| 3.5 小结 | 第56-58页 |
| 第4章 胭脂鱼MHCⅡB基因特征及其遗传多样性研究 | 第58-84页 |
| 4.1 引言 | 第58页 |
| 4.2 材料与方法 | 第58-64页 |
| 4.2.1 MHC Ⅱ B基因克隆和分析 | 第58-62页 |
| 4.2.2 MHC ⅡB分子标记在4个养殖群体的遗传多样性研究 | 第62-64页 |
| 4.3 结果 | 第64-80页 |
| 4.3.1 胭脂鱼MHC Ⅱ B基因cDNA、多态性、同源性和系统发育树分析 | 第64-72页 |
| 4.3.2 MHCⅡB基因作为分子标记对胭脂鱼群体遗传多样性研究 | 第72-80页 |
| 4.4 讨论 | 第80-83页 |
| 4.4.1 胭脂鱼MHC ⅡB基因序列分析 | 第80-82页 |
| 4.4.2 人工养殖胭脂鱼与其他养殖鱼类的遗传多样性比较 | 第82页 |
| 4.4.3 四个养殖胭脂鱼群体间的遗传多样性差异 | 第82-83页 |
| 4.5 小结 | 第83-84页 |
| 第5章 结论与展望 | 第84-86页 |
| 5.1 结论 | 第84-85页 |
| 5.2 展望 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-96页 |
| 致谢 | 第96-98页 |
| 在校期间科研实践情况 | 第98页 |
