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水稻窄叶基因nal11/Osdnajc1的定位与克隆

摘要第3-6页
abstract第6-9页
英文缩写词与英汉对照表第10-17页
第一章 文献综述第17-62页
    1.1 水稻叶片形态的研究进展第17-27页
        1.1.1 水稻叶片的形态和结构第18-19页
        1.1.2 水稻叶片的发育第19-22页
            1.1.2.1 水稻叶原基的发育第19-21页
            1.1.2.2 与叶原基发育相关的基因第21-22页
        1.1.3 叶极性的建立第22-27页
            1.1.3.1 叶片背-腹轴的发育第24-25页
            1.1.3.2 叶片基-顶轴的发育第25-26页
            1.1.3.3 叶片中-边轴的发育第26-27页
    1.2 植物内源激素与叶的发育第27-30页
        1.2.1 生长素与叶及叶中维管束发育的关系第27-29页
        1.2.2 赤霉素与维管束形成层的关系第29页
        1.2.3 细胞分裂素与维管束形成层的关系第29页
        1.2.4 乙稀与维管束形成层的关系第29-30页
    1.3 水稻叶片形态和株型的关系第30-32页
    1.4 水稻窄叶性状的基因定位研究进展第32-41页
    1.5 植物热激蛋白的研究进展第41-50页
        1.5.1 植物热激蛋白的产生第42-43页
        1.5.2 热激蛋白的分类第43-45页
        1.5.3 热激蛋白的特点第45-46页
        1.5.4 热激蛋白的功能第46-50页
    1.6 DNAJ蛋白的研究进展第50-60页
        1.6.1 DNAJ蛋白的特征第50-51页
        1.6.2 DNAJ蛋白的分类和命名第51-52页
        1.6.3 DNAJ蛋白的功能结构域第52-54页
        1.6.4 DNAJ蛋白的分布第54页
        1.6.5 DNAJ蛋白的功能第54-57页
            1.6.5.1 人、动物和致病菌中DNAJ蛋白的功能第54-55页
            1.6.5.2 植物中DNAJ蛋白的功能第55-57页
        1.6.6 水稻中DNAJ蛋白的研究进展第57-60页
    1.7 本研究的目的和意义第60-62页
第二章 水稻窄叶材料的形态和生理学分析第62-74页
    2.1 材料与方法第62-64页
        2.1.1 材料第62-63页
        2.1.2 实验设计与性状调查第63页
        2.1.3 石蜡切片观察第63页
        2.1.4 扫描电镜观察第63-64页
        2.1.5 内源激素的测定第64页
    2.2 结果与分析第64-73页
        2.2.1 实验材料的农艺性状表现第64-67页
        2.2.2 实验材料的叶脉/维管束显微观察第67-69页
        2.2.3 实验材料叶片上表皮的扫描电镜观察第69-72页
        2.2.4 实验材料的内源激素含量测定第72-73页
    2.3 小结与讨论第73-74页
第三章 水稻窄叶基因nal11的定位第74-83页
    3.1 材料与方法第75-76页
        3.1.1 材料第75页
        3.1.2 水稻DNA的提取第75页
        3.1.3 SSR和InDel标记的开发第75-76页
        3.1.4 F_2作图群体的基因分型检测第76页
        3.1.5 遗传作图第76页
    3.2 结果与分析第76-82页
        3.2.1 窄叶性状的遗传分析第76页
        3.2.2 亲本材料的多态性分析第76-77页
        3.2.3 nal11的初步定位第77-79页
        3.2.4 nal11的精细定位第79-82页
    3.3 小结与讨论第82-83页
第四章 水稻窄叶基因nal11的克隆第83-102页
    4.1 材料与方法第83-87页
        4.1.1 实验材料第83页
        4.1.2 水稻DNA的提取第83-84页
        4.1.3 水稻cDNA的制备第84-85页
            4.1.3.1 水稻总RNA的提取第84页
            4.1.3.2 mRNA的反转录第84-85页
        4.1.4 物理图谱的构建与注释第85页
        4.1.5 候选基因的序列扩增与序列分析第85-86页
        4.1.6 NAL11的克隆与序列分析第86-87页
        4.1.7 NAL11基因的启动子序列分析第87页
    4.2 结果与分析第87-100页
        4.2.1 定位区间的基因注释第87-88页
        4.2.2 候选基因的筛选第88-90页
        4.2.3 候选基因的克隆分析第90-93页
        4.2.4 候选基因的蛋白质分析第93-95页
        4.2.5 NAL11的系统进化分析第95-96页
        4.2.6 NAL11在水稻基因组中的同源性分析第96-100页
        4.2.7 NAL11基因的启动子序列分析第100页
    4.3 小结与讨论第100-102页
第五章 水稻窄叶基因nal11的初步功能研究第102-133页
    5.1 材料与方法第102-114页
        5.1.1 水稻材料第102页
        5.1.2 所用的试剂、质粒和菌株第102-103页
        5.1.3 大肠杆菌感受态细胞的制备和转化第103页
        5.1.4 农杆菌感受态细胞的制备和转化第103-104页
        5.1.5 NAL11的遗传转化载体的构建第104-111页
            5.1.5.1 互补载体的构建第104-106页
            5.1.5.2 过量表达载体的构建第106-107页
            5.1.5.3 Cas9定点编辑载体的构建第107-108页
            5.1.5.4 GUS载体的构建第108-110页
            5.1.5.5 GFP载体的构建第110-111页
        5.1.6 遗传转化第111-114页
            5.1.6.1 实验用到的各种培养基第111-112页
            5.1.6.2 水稻愈伤组织的诱导和继代第112页
            5.1.6.3 农杆菌介导法转化水稻第112-113页
            5.1.6.4 愈伤组织的筛选和分化第113页
            5.1.6.5 转基因植株的鉴定第113页
            5.1.6.6 转基因植株GUS基因的组织化学染色第113-114页
            5.1.6.7 水稻原生质体的制备与转化第114页
    5.2 结果与分析第114-131页
        5.2.1 基因互补载体的构建第115-117页
        5.2.2 过量表达载体的构建第117页
        5.2.3 Cas9定点编辑载体的构建第117-119页
        5.2.4 GUS表达载体的构建第119-120页
        5.2.5 GFP表达载体的构建第120-121页
        5.2.6 遗传转化及转基因植株的鉴定第121-129页
            5.2.6.1 基因互补转基因植株的鉴定第122页
            5.2.6.2 过量表达转基因植株的鉴定第122-125页
            5.2.6.3 Cas9定点编辑转基因植株的鉴定第125-128页
            5.2.6.4 GUS转基因植株的鉴定第128-129页
        5.2.7 转基因植株GUS基因的组织化学染色第129-130页
        5.2.8 转基因植株GFP蛋白的电镜观察第130-131页
    5.3 小结与讨论第131-133页
第六章 窄叶基因nal11的表达谱分析第133-153页
    6.1 材料与方法第135-138页
        6.1.1 实验材料与实验设计第135页
        6.1.2 nal11的RT-PCR表达分析第135-136页
        6.1.3 nal11的荧光定量分析第136页
        6.1.4 转录组测序分析第136-138页
    6.2 结果与分析第138-151页
        6.2.1 nal11的RT-PCR表达分析第138-139页
        6.2.2 nal11的real-time荧光定量分析第139-140页
        6.2.3 转录组测序分析第140-151页
            6.2.3.1 测序样品质量评估第140-141页
            6.2.3.2 测序样品结果统计第141-143页
            6.2.3.3 基因覆盖度统计第143-144页
            6.2.3.4 差异表达基因的筛选第144-146页
            6.2.3.5 差异表达基因的聚类分析第146-148页
            6.2.3.6 差异表达基因的Pathway显著性富集分析第148-150页
            6.2.3.7 NAL11转录本的确认及表达量分析第150-151页
    6.3 小结与讨论第151-153页
第七章 全文结论与讨论第153-167页
    7.1 全文结论第153-155页
    7.2 综合讨论第155-166页
        7.2.1 nal11与其他窄叶基因的关系第155-157页
        7.2.2 水稻叶宽与内源激素的关系第157-164页
        7.2.3 新型热激蛋白基因NAL11在水稻育种中的应用第164-166页
    7.3 本研究的创新之处第166页
    7.4 进一步的研究设想第166-167页
致谢第167-168页
参考文献第168-181页
附录I 通过 5’和 3’RACE获得的NAL11基因的全长cDNA序列第181-183页
附录II 生长素相关差异表达基因(上调)第183-191页
附录III 生长素相关差异表达基因(下调)第191-198页

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