| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-45页 |
| 1 棉花种质资源遗传多样性研究进展 | 第15-26页 |
| 1.1 棉花种质资源概况 | 第15-23页 |
| 1.2 棉花种质资源遗传多样性研究进展 | 第23-26页 |
| 2 植物关联分析研究进展 | 第26-31页 |
| 2.1 关联分析概念 | 第26-27页 |
| 2.2 连锁不平衡(LD)及其计算方法 | 第27页 |
| 2.3 影响连锁不平衡的因素及连锁不平衡的衰减 | 第27-28页 |
| 2.4 关联分析研究策略 | 第28页 |
| 2.5 关联分析的程序及统计方法 | 第28-29页 |
| 2.6 关联分析在植物研究中的应用 | 第29-31页 |
| 3 陆地棉指纹图谱构建研究进展 | 第31-43页 |
| 3.1 分子标记概述 | 第32-39页 |
| 3.2 DNA指纹图谱构建研究进展 | 第39-43页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第43-45页 |
| 第二章 中国陆地棉品种遗传多样性分析 | 第45-67页 |
| 1 材料与方法 | 第45-53页 |
| 1.1 试验材料 | 第45-50页 |
| 1.2 田间种植 | 第50页 |
| 1.3 性状调查 | 第50-51页 |
| 1.4 棉花叶片DNA提取 | 第51页 |
| 1.5 SSR引物筛选及PCR扩增 | 第51-52页 |
| 1.6 扩增产物检测及SSR位点分型 | 第52页 |
| 1.7 数据分析 | 第52-53页 |
| 2 结果与分析 | 第53-65页 |
| 2.1 表型性状遗传多样性分析 | 第53-63页 |
| 2.2 基于分子标记的遗传多样性分析 | 第63-65页 |
| 3 讨论 | 第65-67页 |
| 3.1 表型聚类与分子标记聚类相结合用于遗传多样性分析 | 第65-66页 |
| 3.2 遗传多样性分析对育种和相关研究的启示 | 第66-67页 |
| 第三章 陆地棉重要性状的关联分析 | 第67-93页 |
| 1 材料和方法 | 第67-68页 |
| 1.1 实验材料的选取 | 第68页 |
| 1.2 实验材料的种植 | 第68页 |
| 1.3 性状调查 | 第68页 |
| 1.4 SSR多态性检测和基因分型 | 第68页 |
| 1.5 群体结构分析 | 第68页 |
| 1.6 标记位点与QTL的关联作图 | 第68页 |
| 2 结果与分析 | 第68-89页 |
| 2.1 表型性状相关分析 | 第69-71页 |
| 2.2 群体结构估计和亲缘关系分析 | 第71-72页 |
| 2.3 与棉花重要性状关联的标记位点 | 第72-89页 |
| 3 讨论 | 第89-93页 |
| 3.1 影响关联分析的因素 | 第89-90页 |
| 3.2 QTL的稳定性 | 第90-91页 |
| 3.3 与多性状关联的标记位点 | 第91页 |
| 3.4 关联分析在棉花中的应用前景 | 第91-93页 |
| 第四章 陆地棉品种DNA指纹条形码构建 | 第93-107页 |
| 1 材料和方法 | 第94-95页 |
| 1.1 实验材料的选取 | 第94页 |
| 1.2 实验材料的种植 | 第94页 |
| 1.3 DNA提取、多态性检测和基因分型 | 第94页 |
| 1.4 数据处理 | 第94页 |
| 1.5 核心引物的筛选及DNA条形码构建 | 第94-95页 |
| 1.6 核心引物对180份陆地棉品种的聚类分析 | 第95页 |
| 2 结果与分析 | 第95-104页 |
| 2.1 核心引物的筛选与评价 | 第95-98页 |
| 2.2 基于核心引物构建棉花品种DNA条形码 | 第98-103页 |
| 2.3 基于核心引物的180份陆地棉品种聚类分析 | 第103-104页 |
| 3 讨论 | 第104-107页 |
| 3.1 用于棉花DNA指纹分析的基础引物 | 第104-105页 |
| 3.2 用于棉花DNA指纹分析的核心引物 | 第105-106页 |
| 3.3 关于DNA指纹条形码 | 第106-107页 |
| 全文结论 | 第107-109页 |
| 本研究的创新之处 | 第109-111页 |
| 附表 | 第111-123页 |
| 参考文献 | 第123-141页 |
| 攻读博士学位期间发表及待发表的论文 | 第141-143页 |
| 致谢 | 第143页 |