| 摘要 | 第8-10页 |
| 前言 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1 肌细胞增强因子家族(MEF2)的研究进展 | 第11-14页 |
| 1.1 MEF2的发现及定位 | 第11页 |
| 1.2 MEF2蛋白的分子结构 | 第11页 |
| 1.3 MEF2的信号传导通路 | 第11-12页 |
| 1.4 MEF2的生物学功能研究 | 第12-14页 |
| 1.4.1 MEF2在骨骼肌发育中的调节作用 | 第12-13页 |
| 1.4.2 MEF2在心脏发育中的调节作用 | 第13页 |
| 1.4.3 MEF2在神经系统中的调节作用 | 第13-14页 |
| 1.4.4 MEF2在肝脏中的调节作用 | 第14页 |
| 2 MEF2A基因的研究进展 | 第14-15页 |
| 2.1 MEF2A的组织表达特征 | 第14页 |
| 2.2 MEF2A的功能及其研究进展 | 第14-15页 |
| 3 选择性剪接体的研究进展 | 第15-19页 |
| 3.1 mRNA可变剪接的概念和机制 | 第15-16页 |
| 3.2 可变剪接的主要模式 | 第16-17页 |
| 3.3 可变剪接的生物学意义 | 第17页 |
| 3.4 可变剪接的研究方法 | 第17-19页 |
| 3.4.1 EST数据预测可变剪接 | 第17页 |
| 3.4.2 生物芯片技术预测可变剪接 | 第17-18页 |
| 3.4.3 RNA-seq预测可变剪接 | 第18-19页 |
| 第二章 MEF2A4个可变剪接体的预测、鉴定和生物信息学分析 | 第19-39页 |
| 1 材料与方法 | 第19-24页 |
| 1.1 试验动物和组织采集 | 第19页 |
| 1.2 试验仪器和试剂 | 第19-20页 |
| 1.2.1 主要的仪器设备 | 第19页 |
| 1.2.2 主要试剂 | 第19页 |
| 1.2.3 试剂的配制 | 第19-20页 |
| 1.3 试验方法 | 第20-24页 |
| 1.3.1 总RNA的提取和纯化 | 第20页 |
| 1.3.2 RNA-seq与可变剪切预测 | 第20页 |
| 1.3.3 引物设计 | 第20-21页 |
| 1.3.4 猪MEF2A基因可变剪接位点的PCR扩增 | 第21页 |
| 1.3.5 MEF2A基因的克隆和测序 | 第21-23页 |
| 1.3.6 生物信息学分析 | 第23-24页 |
| 2 结果与分析 | 第24-36页 |
| 2.1 转录组测序可变剪切预测结果 | 第24页 |
| 2.2 MEF2A基因可变剪接CDS区的扩增 | 第24-25页 |
| 2.3 鉴定猪MEF2A基因新的剪接体 | 第25-29页 |
| 2.4 MEF2A基因的蛋白理化性质 | 第29-31页 |
| 2.5 MEF2A的蛋白二级结构 | 第31-33页 |
| 2.6 MEF2A基因磷酸化位点的预测 | 第33页 |
| 2.7 MEF2A的亚细胞定位 | 第33-34页 |
| 2.8 MEF2A的功能结构域 | 第34页 |
| 2.9 MEF2A基因的氨基酸同源性和进化树 | 第34-36页 |
| 3 讨论 | 第36-38页 |
| 4 小结 | 第38-39页 |
| 第三章 MEF2A 4个可变剪接体MRNA的组织表达差异 | 第39-51页 |
| 1 材料与方法 | 第39-42页 |
| 1.1 试验动物与样品采集 | 第39页 |
| 1.2 试验仪器和试剂 | 第39页 |
| 1.2.1 主要的仪器设备 | 第39页 |
| 1.2.2 主要试剂 | 第39页 |
| 1.3 试验方法 | 第39-42页 |
| 1.3.1 总RNA的提取 | 第39-40页 |
| 1.3.2 总RNA的检测 | 第40页 |
| 1.3.3 cDNA第一链的合成 | 第40-41页 |
| 1.3.4 实时荧光定量PCR的引物设计 | 第41-42页 |
| 1.3.5 实时荧光定量PCR体系 | 第42页 |
| 1.3.6 数据处理与分析 | 第42页 |
| 2 结果与分析 | 第42-49页 |
| 2.1 总RNA完整性与纯度检测 | 第42页 |
| 2.2 扩增动力学曲线和熔解曲线 | 第42-44页 |
| 2.3 MEF2A mRNA在13种组织中的表达谱 | 第44-46页 |
| 2.3.1 MEF2A1 mRNA在13种组织中的表达谱 | 第44页 |
| 2.3.2 MEF2A2 mRNA在13种组织中的表达谱 | 第44-45页 |
| 2.3.3 MEF2A3 mRNA在13种组织中的表达谱 | 第45-46页 |
| 2.3.4 MEF2A4 mRNA在13种组织中的表达谱 | 第46页 |
| 2.4 MEF2A mRNA在三种骨骼肌组织中的发育性表达 | 第46-49页 |
| 2.4.1 MEF2A mRNA在腰大肌中的发育性表达 | 第46-47页 |
| 2.4.2 MEF2A mRNA在股二头肌中的发育性表达 | 第47-48页 |
| 2.4.3 MEF2A mRNA在背最长肌中的发育性表达 | 第48-49页 |
| 3 讨论 | 第49-50页 |
| 4 小结 | 第50-51页 |
| 全文结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| Abstract | 第58-60页 |
| 致谢 | 第62页 |
