| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第12-20页 |
| 1.1. 鱼类生长调控轴研究现状 | 第12-15页 |
| 1.1.1 生长激素(GH) | 第13页 |
| 1.1.2 胰岛素样生长因子(IGFs) | 第13页 |
| 1.1.3 生长激素促释放素(GHRH) | 第13-14页 |
| 1.1.4 垂体腺苷酸环化酶活化肽(PACAP) | 第14页 |
| 1.1.5 生长抑素(SST) | 第14-15页 |
| 1.1.6 其他神经多肽(neuropeptides)和神经介质(neurotransmitters) | 第15页 |
| 1.2. 鱼类生殖调控轴研究现状 | 第15-17页 |
| 1.2.1 促性腺激素释放激素(Gn RH) | 第16页 |
| 1.2.2 多巴胺 | 第16-17页 |
| 1.2.3 性类固醇激素 | 第17页 |
| 1.3. 生长生殖轴调控网络研究 | 第17-20页 |
| 第二章 材料方法和实验内容 | 第20-31页 |
| 2.1 组织准备和总RNA的抽提 | 第20-21页 |
| 2.1.1 组织准备 | 第20页 |
| 2.1.2 半滑舌鳎总RNA的提取过程 | 第20-21页 |
| 2.2 RNA-seq测序，基因注释和新基因鉴定 | 第21页 |
| 2.3 差异表达基因的分析 | 第21-22页 |
| 2.4 相关性分析和主成分分析 | 第22页 |
| 2.5 基因共表达网络的构建 | 第22-24页 |
| 2.6 模块特征关系和关键基因鉴定 | 第24-26页 |
| 2.7 实时荧光定量核酸扩增检测系统（q PCR）验证高通量转录组测序数据 | 第26-28页 |
| 2.8 关键基因的半定量和定量分析及时空表达模式分析 | 第28-30页 |
| 2.8.1 关键基因在各组织中表达模式的半定量分析实验 | 第28-29页 |
| 2.8.2 关键基因在各组织中表达模式的实时荧光定量分析实验 | 第29-30页 |
| 2.9 基因染色体定位分析 | 第30-31页 |
| 第三章 实验结果及分析 | 第31-72页 |
| 3.1 高通量测序数据 | 第31-33页 |
| 3.2 差异表达基因和样本聚类分析 | 第33-37页 |
| 3.3 转录组高通量测序的验证 | 第37-38页 |
| 3.4 差异表达基因GO（gene ontology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes）富集分析 | 第38-43页 |
| 3.4.1 The forkhead box O信号传导通路（The forkhead box O signalingpathway，FoxO） | 第40-41页 |
| 3.4.2 类固醇生物合成通路（Steroid synthesis pathway） | 第41-42页 |
| 3.4.3 丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK) | 第42-43页 |
| 3.5 基因共表达网络的构建 | 第43-45页 |
| 3.6 生长相关模块的识别和功能注释 | 第45-46页 |
| 3.7 Hub基因鉴定和网络构建 | 第46-47页 |
| 3.8 半定量和实时荧光定量实验对关键基因表达模式分析 | 第47-62页 |
| 3.8.1 同一时期不同组织中的半定量实验结果 | 第47-51页 |
| 3.8.2 同一时期不同组织中的荧光定量实验结果 | 第51-53页 |
| 3.8.3 同一组织不同发育时期性别表达模式的荧光定量实验结果 | 第53-62页 |
| 3.9 基因染色体定位分析 | 第62-72页 |
| 3.9.1 purb基因的染色体位置 | 第62-63页 |
| 3.9.2 W染色体和14号染色体上purb基因的m RNA序列比对 | 第63-64页 |
| 3.9.3 W染色体和14号染色体上purb基因的蛋白质序列比对 | 第64页 |
| 3.9.4 nipbla基因的染色体位置 | 第64-65页 |
| 3.9.5 W染色体和Z染色体上nipbla基因的m RNA序列比对 | 第65-69页 |
| 3.9.6 W染色体和Z号染色体上nipbla基因的蛋白质序列比对 | 第69-72页 |
| 结论 | 第72-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-84页 |
| 论文发表情况 | 第84页 |
