| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 前言 | 第11-16页 |
| 1.1 研究背景 | 第11页 |
| 1.2 温度变化对贝类的影响 | 第11-12页 |
| 1.3 贝类温度适应性机制的研究 | 第12-14页 |
| 1.3.1 能量代谢和免疫调节 | 第12-13页 |
| 1.3.2 细胞膜物相改变 | 第13页 |
| 1.3.3 小分子抗冻物质及功能蛋白 | 第13-14页 |
| 1.4 组学方法在贝类温度适应性研究中的应用 | 第14-15页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第15-16页 |
| 2 马氏珠母贝耐低温选系与对照群体转录组比较分析 | 第16-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第16-17页 |
| 2.1.1 马氏珠母贝耐低温群体的培育 | 第16页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第16页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第16-17页 |
| 2.2 实验方法 | 第17-19页 |
| 2.2.1 总RNA提取及其质量检测 | 第17页 |
| 2.2.2 转录组测序 | 第17-18页 |
| 2.2.3 转录组的组装和功能注释 | 第18页 |
| 2.2.4 转录组数据的验证 | 第18-19页 |
| 2.3 结果 | 第19-29页 |
| 2.3.1 总RNA质量检测 | 第19-20页 |
| 2.3.2 转录组装配评价 | 第20页 |
| 2.3.3 SP和BP的差异表达基因的筛选及其功能富集 | 第20-23页 |
| 2.3.4 KEGG通路富集分析 | 第23-29页 |
| 2.3.4.1 HSPs | 第23-24页 |
| 2.3.4.2 能量代谢 | 第24-25页 |
| 2.3.4.3 氨基酸代谢 | 第25页 |
| 2.3.4.4 不饱和脂肪酸生物合成 | 第25-26页 |
| 2.3.4.5 溶酶体蛋白 | 第26-28页 |
| 2.3.4.6 免疫相关基因 | 第28-29页 |
| 2.4 讨论 | 第29-32页 |
| 3 温度适应性相关基因的验证 | 第32-42页 |
| 3.1 实验材料 | 第32页 |
| 3.1.1 马氏珠母贝梯度温度养殖 | 第32页 |
| 3.1.2 主要仪器 | 第32页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第32页 |
| 3.2 实验方法 | 第32-33页 |
| 3.2.1 总RNA的提取及其质量检测 | 第32页 |
| 3.2.2 引物设计 | 第32-33页 |
| 3.2.3 不同温度下马氏珠母贝鳃中温度适应性相关基因的时序表达 | 第33页 |
| 3.3 结果 | 第33-38页 |
| 3.3.1 HSPs | 第33-34页 |
| 3.3.1.1 Pm-HSP40 | 第33-34页 |
| 3.3.1.2 Pm-HSP70 | 第34页 |
| 3.3.2 能量代谢相关基因 | 第34-36页 |
| 3.3.2.1 Pm-HK | 第34-35页 |
| 3.3.2.2 Pm-PEPCK | 第35-36页 |
| 3.3.3 脂肪酸去饱和酶 | 第36-37页 |
| 3.3.3.1 Pm-Δ6FAD | 第36页 |
| 3.3.3.2 Pm-SCD | 第36-37页 |
| 3.3.4 组织蛋白酶 | 第37-38页 |
| 3.3.4.1 Pm-CTSL | 第37-38页 |
| 3.3.4.2 Pm-CTSC | 第38页 |
| 3.4 讨论 | 第38-42页 |
| 4 温度适应性相关基因的克隆及其表达特性分析 | 第42-77页 |
| 4.1 实验材料 | 第42页 |
| 4.1.1 全组织定量材料 | 第42页 |
| 4.1.2 主要仪器 | 第42页 |
| 4.1.3 主要试剂 | 第42页 |
| 4.2 实验方法 | 第42-45页 |
| 4.2.1 总RNA的提取检验及cDNA第一链的合成 | 第42页 |
| 4.2.2 引物设计 | 第42-44页 |
| 4.2.3 RACEPCR获得各全长序列 | 第44页 |
| 4.2.4 序列分析 | 第44页 |
| 4.2.5 组织间的差异表达分析 | 第44-45页 |
| 4.3 结果 | 第45-74页 |
| 4.3.1 HSPs | 第45-52页 |
| 4.3.1.1 Pm-HSP40 | 第45-48页 |
| 4.3.1.2 Pm-HSP70 | 第48-52页 |
| 4.3.2 能量代谢相关基因 | 第52-61页 |
| 4.3.2.1 Pm-HK | 第52-56页 |
| 4.3.2.2 Pm-PEPCK | 第56-61页 |
| 4.3.3 脂肪酸去饱和酶 | 第61-67页 |
| 4.3.3.1 Pm-Δ6FAD | 第61-64页 |
| 4.3.3.2 Pm-SCD | 第64-67页 |
| 4.3.4 组织蛋白酶 | 第67-74页 |
| 4.3.4.1 Pm-CTSL | 第67-70页 |
| 4.3.4.2 Pm-CTSC | 第70-74页 |
| 4.4 讨论 | 第74-77页 |
| 5 结论 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 作者简介 | 第87-89页 |
| 导师简介 | 第89页 |
