| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 课题背景与意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-12页 |
| 1.3 论文结构及主要内容 | 第12-14页 |
| 第2章 生物信息学基本概念 | 第14-24页 |
| 2.1 生物学概念 | 第14-18页 |
| 2.1.1 染色体和DNA | 第14-15页 |
| 2.1.2 SNP与基因突变的关系 | 第15-16页 |
| 2.1.3 单体型与基因型 | 第16-18页 |
| 2.2 基因测序的工具 | 第18-21页 |
| 2.2.1 基因芯片技术 | 第18-19页 |
| 2.2.2 Taqman技术 | 第19-20页 |
| 2.2.3 分子信标技术 | 第20-21页 |
| 2.3 连锁不平衡性LD介绍 | 第21-22页 |
| 2.4 基因数据集的分类 | 第22-24页 |
| 第3章 基于PL分割策略的Hapar单体型推导算法 | 第24-43页 |
| 3.1 已有相关工作 | 第25-33页 |
| 3.1.1 Clark单体型推导算法 | 第25-26页 |
| 3.1.2 EM单体型推导算法 | 第26-28页 |
| 3.1.3 Hapar单体型推导算法 | 第28-30页 |
| 3.1.4 Phase单体型推导算法 | 第30-33页 |
| 3.2 基因型的分割策略 | 第33-37页 |
| 3.2.1 PL分割策略 | 第33-34页 |
| 3.2.2 最小边界的MDBlock分割方法 | 第34-35页 |
| 3.2.3 基于LD关联度的BOOSTRAPPER分割方法 | 第35-37页 |
| 3.3 加入PL分割策略的Hapar单体型推导算法 | 第37-38页 |
| 3.4 算法性能比较 | 第38-43页 |
| 第4章 基于PL分割策略和最大汉明距策略的Phase单体型推导算法 | 第43-61页 |
| 4.1 运用最大汉明距的Phase算法优化 | 第43-45页 |
| 4.1.1 最大汉明距 | 第43-44页 |
| 4.1.2 加入最大汉明距策略的Phase算法 | 第44-45页 |
| 4.2 加入PL分割策略的Phase单体型推导算法 | 第45-50页 |
| 4.2.1 研究思路 | 第46-47页 |
| 4.2.2 加入PL分割策略的Phase单体型推导算法 | 第47-48页 |
| 4.2.3 推导后的单体型合并 | 第48-50页 |
| 4.3 算法性能比较 | 第50-61页 |
| 4.3.1 加入最大汉明距策略的phase单体型推导算法的性能分析 | 第50-55页 |
| 4.3.2 加入分割策略的phase单体型推导算法的性能分析 | 第55-56页 |
| 4.3.3 总体性能分析 | 第56-61页 |
| 第5章 总结与展望 | 第61-63页 |
| 5.1 总结 | 第61-62页 |
| 5.2 展望 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 作者简介 | 第67页 |
