| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 课题研究背景、目的及意义 | 第10-11页 |
| 1.1.1 课题研究背景 | 第10-11页 |
| 1.1.2 研究目的及意义 | 第11页 |
| 1.2 国内外研究进展 | 第11-19页 |
| 1.2.1 微生物群落结构分析方法 | 第11-16页 |
| 1.2.2 分类特异性引物设计 | 第16-18页 |
| 1.2.3 相似序列识别技术 | 第18页 |
| 1.2.4 错配理论 | 第18-19页 |
| 1.3 本课题研究内容及课题来源 | 第19-21页 |
| 1.3.1 本课题研究内容 | 第19-20页 |
| 1.3.2 课题来源 | 第20-21页 |
| 第2章 SAP错配模式特异性研究 | 第21-44页 |
| 2.1 引言 | 第21页 |
| 2.2 材料与仪器 | 第21-24页 |
| 2.2.1 主要仪器与试剂 | 第21-22页 |
| 2.2.2 数据与质粒来源 | 第22-23页 |
| 2.2.3 使用软件 | 第23-24页 |
| 2.3 实验方法 | 第24-30页 |
| 2.3.1 引物设计 | 第24-27页 |
| 2.3.2 质粒提取及引物处理 | 第27-28页 |
| 2.3.3 PCR实验 | 第28-30页 |
| 2.4 结果与分析 | 第30-41页 |
| 2.4.1 引物设计 | 第30-32页 |
| 2.4.2 质粒提取及引物处理 | 第32-34页 |
| 2.4.3 PCR实验 | 第34-41页 |
| 2.4 讨论 | 第41-42页 |
| 2.5 本章小结 | 第42-44页 |
| 第3章 引物设计辅助软件开发 | 第44-55页 |
| 3.1 引言 | 第44页 |
| 3.2 BIOX-SAP-1 的设计 | 第44-49页 |
| 3.2.1 需求分析 | 第44-45页 |
| 3.2.2 Biox-SAP-1 的详细设计与编程 | 第45-49页 |
| 3.3 BIOX-SAP-1 的功能及说明 | 第49-54页 |
| 3.3.1 Biox-SAP-1 的功能介绍 | 第49-53页 |
| 3.3.2 多序列比对 | 第53-54页 |
| 3.4 本章小结 | 第54-55页 |
| 第4章SAP技术定量识别窖泥微生物群落 | 第55-92页 |
| 4.1 引言 | 第55页 |
| 4.2 材料与仪器 | 第55-56页 |
| 4.3 实验方法 | 第56-61页 |
| 4.3.1 引物设计 | 第56-57页 |
| 4.3.2 宏基因组提取 | 第57-58页 |
| 4.3.3 PCR特异性检测 | 第58页 |
| 4.3.4 qPCR定量 | 第58-61页 |
| 4.4 结果与分析 | 第61-90页 |
| 4.4.1 引物设计 | 第61-70页 |
| 4.4.2 宏基因组提取 | 第70-71页 |
| 4.4.3 PCR特异性检测 | 第71-79页 |
| 4.4.4 qPCR定量 | 第79-90页 |
| 4.5 讨论 | 第90-91页 |
| 4.6 本章小结 | 第91-92页 |
| 结论 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-100页 |
| 附录 | 第100-112页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第112-114页 |
| 致谢 | 第114页 |