| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-13页 |
| 第一章 前言 | 第14-35页 |
| 1 高分子量PAHs的危害及生物降解 | 第14-23页 |
| 1.1 高分子量PAHs的危害 | 第14-15页 |
| 1.2 降解苯并芘的微生物 | 第15-23页 |
| 2 苯并芘生物降解过程中关键酶的研究进展 | 第23-27页 |
| 2.1 环羟基化双加氧酶(RHOs)研究进展 | 第23-24页 |
| 2.2 中心代谢途径酶反应研究进展 | 第24-27页 |
| 3 多环芳烃生物降解的代谢调控网络研究进展 | 第27-32页 |
| 3.1 芳烃降解菌代谢网络构建—以Mycobacterium vanbaalenii PYR-1为例 | 第27-31页 |
| 3.2 芳烃降解菌调控网络研究进展 | 第31-32页 |
| 4 新鞘氨醇杆属细菌的研究进展 | 第32-33页 |
| 5 本论文的研究内容及意义 | 第33-35页 |
| 第二章 材料与方法 | 第35-45页 |
| 1 材料 | 第35-37页 |
| 1.1 实验菌株 | 第35页 |
| 1.2 培养基 | 第35页 |
| 1.3 主要药品试剂 | 第35-36页 |
| 1.4 主要溶液配制 | 第36页 |
| 1.5 主要仪器 | 第36-37页 |
| 1.6 主要分析软件 | 第37页 |
| 2 基本方法 | 第37-45页 |
| 2.1 PAHs降解率测定 | 第37-38页 |
| 2.2 质粒敲除与检验 | 第38-40页 |
| 2.3 Uv-Vis检测菌株对PAHs及其中间代谢产物的利用 | 第40-41页 |
| 2.4 目标基因的定量PCR | 第41-43页 |
| 2.5 N.pentaromativorans US6-1全转录组测序 | 第43页 |
| 2.6 N.pentaromativorans US6-1链特异转录组测序 | 第43页 |
| 2.7 电子传递系统活性(ETSA)的检测 | 第43-45页 |
| 第三章 结果与分析 | 第45-131页 |
| 1 N.pentaromativorans US6-1对PAHs的降解特性 | 第45-48页 |
| 1.1 N.pentaromativorans US6-1对菲的降解 | 第45页 |
| 1.2 N.pentaromativorans US6-1对芘的降解 | 第45-46页 |
| 1.3 N.pentaromativorans US6-1对苯并芘的降解 | 第46-48页 |
| 2 N.pentaromativorans US6-1基因组分析 | 第48-75页 |
| 2.1 N.pentaromativorans US6-1全基因组基本分析 | 第49-52页 |
| 2.2 N.pentaromativorans US6-1质粒的分析 | 第52-65页 |
| 2.3 N.pentaromativorans US6-1中RHOs基因的分析 | 第65-75页 |
| 3 N.pentaromativorans US6-1与突变株N.pentaromativorans CPUS6-1的比较 | 第75-102页 |
| 3.1 突变株N.pentaromativorans CPUS6-1(去除质粒菌株)的获得 | 第75-76页 |
| 3.2 突变株N.pentaromativorans CPUS6-1的验证 | 第76-77页 |
| 3.3 N.pentaromativorans US6-1与突变株N.pentaromativorans CPUS6-1对芳烃类物质的降解 | 第77-102页 |
| 4. N.pentaromativorans US6-1中RHOs基因以及质粒上部分基因在PAHs降解过程中的差异表达 | 第102-109页 |
| 4.1 引物特异性及扩增效率分析 | 第103-105页 |
| 4.2 RHOs基因以及质粒上部分基因的表达动力学分析 | 第105-109页 |
| 5 N.pentaromativorans US6-1在苯并芘培养条件下全转录组分析 | 第109-111页 |
| 6 N.pentaromativorans US6-1的链特异比较转录组分析 | 第111-115页 |
| 6.1 RHOs基因差异表达分析 | 第111-112页 |
| 6.2 全局调控相关基因差异表达分析 | 第112-115页 |
| 7 N.pentaromativorans US6-1降解苯并芘过程中的生理应答机制 | 第115-131页 |
| 7.1 N.pentaromativorans US6-1在苯并芘的降解过程中的生理指征的变化 | 第115-118页 |
| 7.2 N.pentaromativorans US6-1在苯并芘的降解过程中基因表达差异 | 第118-131页 |
| 第四章 讨论 | 第131-138页 |
| 1 N.pentaromativorans US6-1对PAHs的降解特性 | 第131页 |
| 2 N.pentaromativorans US6-1降解芳烃物质的代谢路径推测 | 第131-134页 |
| 3 N.pentaromativorans US6-1中RHOs基因以及质粒上部分基因在PAHs降解过程中的作用 | 第134-135页 |
| 4 N.pentaromativorans US6-1在苯并芘降解过程中的生理应答机制 | 第135-138页 |
| 第五章 结论与展望 | 第138-140页 |
| 1 结论 | 第138页 |
| 2 本论文创新点 | 第138-139页 |
| 2.1 新内容 | 第138-139页 |
| 2.2 新技术 | 第139页 |
| 3 展望 | 第139-140页 |
| 参考文献 | 第140-148页 |
| 附录 | 第148-149页 |
| 致谢 | 第149页 |
