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腐霉属的DNA条形码和分子系统学研究

摘要第4-7页
Abstract第7-9页
缩写表第10-17页
1 文献综述第17-29页
    1.1 引言第17页
    1.2 腐霉属的形态分类学第17-21页
        1.2.1 分类历史和分类地位第17-18页
        1.2.2 形态分类学依据第18-19页
        1.2.3 形态分类学的局限性第19-20页
        1.2.4 国内外腐霉种类资源调查第20-21页
    1.3 植物病原腐霉及腐霉病害第21-24页
        1.3.1 我国植物腐霉病害的种类及其发生情况第22-23页
        1.3.2 国内草坪草腐霉病害的研究现状第23-24页
    1.4 腐霉属的DNA条形码研究第24-26页
    1.5 腐霉属的分子系统学第26-28页
    1.6 本研究的目标第28-29页
2 腐霉属的分类鉴定第29-129页
    2.1 引言第29页
    2.2 材料与方法第29-32页
        2.2.1 土壤样品的采集第29-30页
        2.2.2 培养基第30页
        2.2.3 腐霉的分离培养和保存第30页
        2.2.4 腐霉的形态鉴定第30-31页
        2.2.5 DNA提取、扩增、测序和分子比对第31-32页
    2.3 结果第32-127页
        2.3.1 瓜果腐霉第32-34页
        2.3.2 德里腐霉第34-36页
        2.3.3 田野腐霉第36-38页
        2.3.4 Pythiurn sp.nov.1第38-39页
        2.3.5 囊形腐霉第39-40页
        2.3.6 簇囊腐霉第40-43页
        2.3.7 稻根腐霉第43-45页
        2.3.8 群结腐霉第45-47页
        2.3.9 姜腐霉第47页
        2.3.10 无性腐霉第47-50页
        2.3.11 多卵腐霉第50-52页
        2.3.12 周雄腐霉第52页
        2.3.13 广西腐霉第52-55页
        2.3.14 肿囊腐霉第55-57页
        2.3.15 芒孢腐霉第57-59页
        2.3.16 强雄腐霉第59-61页
        2.3.17 Pythium sp.nov.2第61-63页
        2.3.18 异丝腐霉第63-64页
        2.3.19 宽雄腐霉第64-67页
        2.3.20 卵突腐霉第67页
        2.3.21 四季腐霉第67-70页
        2.3.22 棘腐霉第70-72页
        2.3.23 Pythium sp.nov.3第72-74页
        2.3.24 寡雄腐霉第74-75页
        2.3.25 Pythium sp.nov.4第75-76页
        2.3.26 Pythium sp.nov.5第76-78页
        2.3.27 奇雄腐霉第78-79页
        2.3.28 满器腐霉第79-82页
        2.3.29 高山腐霉第82-84页
        2.3.30 顶生腐霉第84-86页
        2.3.31 长囊腐霉第86-88页
        2.3.32 刺腐霉第88-90页
        2.3.33 Pythium sp.nov.6第90-92页
        2.3.34 武汉腐霉第92-93页
        2.3.35 畸雌腐霉第93-94页
        2.3.36 Pythium sp. nov.7第94-96页
        2.3.37 Pythium sp. nov.8第96-97页
        2.3.38 Pythium sp. nov.9第97-100页
        2.3.39 Pythium sp. nov.10第100-102页
        2.3.40 土栖腐霉第102-106页
        2.3.41 林栖腐霉第106-107页
        2.3.42 固执腐霉第107-109页
        2.3.43 引雄腐霉第109-112页
        2.3.44 间型腐霉第112-113页
        2.3.45 终极腐霉第113-114页
        2.3.46 异宗腐霉第114-116页
        2.3.47 华丽腐霉第116-118页
        2.3.48 百色腐霉第118-121页
        2.3.49 奴氏腐霉第121-123页
        2.3.50 钟形腐霉第123-125页
        2.3.51 短枝腐霉第125-127页
    2.4 讨论第127-129页
3 腐霉属的DNA条形码研究第129-167页
    3.1 引言第129-130页
    3.2 材料与方法第130页
        3.2.1 腐霉菌株第130页
        3.2.2 DNA提取、扩增和测序第130页
        3.2.3 数据处理第130页
    3.3 结果第130-162页
        3.3.1 供试菌株4个备选DNA片段的PCR和测序成功率第140页
        3.3.2 备选DNA片段的种间种内相似率第140-142页
        3.3.3 备选DNA片段的聚类分析第142-162页
    3.4 讨论第162-167页
        3.4.1 PCR和测序的难易第162-164页
        3.4.2 备选DNA片段的分化阈值第164页
        3.4.3 备选DNA片段的聚类分析第164-167页
4 腐霉属分子系统学研究第167-187页
    4.1 引言第167-169页
    4.2 材料与方法第169-170页
        4.2.1 土壤样品的采集第169页
        4.2.2 DNA提取,扩增和测序第169页
        4.2.3 腐霉的分离培养、纯化和保存第169页
        4.2.4 腐霉的形态鉴定第169页
        4.2.5 DNA提取、扩增和测序第169页
        4.2.6 系统学分析第169-170页
    4.3 结果第170-183页
        4.3.1 腐霉属的ITS系统发育关系第170页
        4.3.2 腐霉属的COⅠ系统发育关系第170-172页
        4.3.3 腐霉属的COⅡ系统发育关系第172-176页
        4.3.4 腐霉属的β-tub系统发育关系第176页
        4.3.5 利用ITS和COⅠ双基因片段联合建树分析探讨腐霉属的系统发育关系第176-178页
        4.3.6 利用COⅠ、COⅡ、ITS和β-tub等4基因片段联合建树分析探讨腐霉属的系统发育关系第178-182页
        4.3.7 从形态学角度评估分子系统学第182-183页
    4.4 讨论第183-187页
5 DNA条形码在广西草坪腐霉群落组成和物种多样性研究中的应用第187-199页
    5.1 引言第187-188页
    5.2 材料与方法第188-189页
        5.2.1 研究地点与土样采集第188页
        5.2.2 腐霉的分离培养、纯化和保存第188页
        5.2.3 腐霉的形态鉴定第188页
        5.2.4 分子鉴定第188页
        5.2.5 数据处理第188-189页
    5.3 结果第189-197页
        5.3.1 草坪土壤中腐霉的种类组成第189-190页
        5.3.2 不同季节草坪腐霉的多样性和群落组成第190页
        5.3.3 不同地点的草坪腐霉的组成和多样性第190-197页
    5.4 讨论第197-199页
        5.4.1 草坪土壤中丰富的腐霉资源第197页
        5.4.2 广西草坪腐霉的季节变化规律第197-198页
        5.4.3 广西草坪腐霉的地理分布第198-199页
6 结论第199-201页
    6.1 全文总结第199-200页
    6.2 论文创新点第200页
    6.3 问题与展望第200-201页
致谢第201-203页
参考文献第203-213页
附录第213页

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