首页--农业科学论文--林业论文--林业基础科学论文--森林土壤学论文--森林土壤生物学论文

长白山自然保护区北坡森林土壤真菌多样性的分子生物学研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
引言第9-10页
1 综述第10-15页
    1.1 土壤真菌概述第10页
    1.2 土壤真菌群落的结构特征第10-11页
        1.2.1 土壤真菌群落空间结构第10页
        1.2.2 土壤真菌群落的的时间结构第10-11页
    1.3 土壤真菌的分子生物学研究方法第11-12页
        1.3.1 荧光原位杂交技术(Fluorescence in situ hybridization, FISH)第11页
        1.3.2 基因芯片(DNA chip)第11页
        1.3.3 随机扩增多态性 DNA 技术(Random amplified polymorphim DNA, RAPD)第11页
        1.3.4 限制性片段长度多态性技术 (Restriction fragment length polymorphism,RFLP)第11-12页
        1.3.5 变性梯度凝胶电泳(Denatured gradient gel electrophoresis, DGGE)第12页
        1.3.6 克隆文库技术(Clone library)第12页
        1.3.7 高通量测序技术(High-throughput sequencing techniques)第12页
    1.4 长白山自然保护区植被带概述第12-13页
        1.4.1 高山苔原带第13页
        1.4.2 岳桦林带第13页
        1.4.3 暗针叶林带第13页
        1.4.4 针阔混交林带第13页
    1.5 对长白山自然保护区土壤真菌研究的意义第13-15页
2 基于形态学鉴定法与基因序列分析法结合对长白山自然保护区北坡森林土壤真菌多样性研究第15-26页
    2.1 材料与方法第15-18页
        2.1.1 形态学鉴定法第15-16页
        2.1.2 基因序列分析法第16-18页
    2.2 结果与分析第18-24页
        2.2.1 形态学鉴定法真菌鉴定结果第18-19页
        2.2.2 基因序列分析法实验结果第19-21页
        2.2.3 形态学鉴定法与基因序列分析法结合结果与分析第21-24页
    2.3 结论与讨论第24-26页
3 基于变性梯度凝胶电泳技术对长白山自然保护区北坡森林土壤真菌多样性的研究第26-40页
    3.1 材料与方法第26-30页
        3.1.1 样品来源第26页
        3.1.2 试剂与药品第26页
        3.1.3 实验仪器第26页
        3.1.4 样品总DNA的提取第26-27页
        3.1.5 电泳检测DNA提取结果第27页
        3.1.6 真菌rDNA的ITS序列的巢氏PCR扩增第27-28页
        3.1.7 PCR产物的纯化第28页
        3.1.8 变性梯度凝胶电泳第28-29页
        3.1.9 真菌DGGE条带的Shannon-Weaver index(H')主成分分析第29页
        3.1.10 DGGE条带的回收测序第29-30页
    3.2 结果与分析第30-38页
        3.2.1 土壤总DNA提取及PCR扩增结果第30页
        3.2.2 土壤真菌群落结构的DGGE指纹图谱分析第30-32页
        3.2.3 不同土壤样品真菌多样性变化第32-35页
        3.2.4 不同月份土壤真菌群落分析第35-36页
        3.2.5 土壤真菌DGGE条带基因片段测序分析第36-38页
    3.3 结论与讨论第38-40页
4 基于分子克隆技术对长白山自然保护区北坡森林土壤真菌多样性的研究第40-51页
    4.1 材料与方法第40-43页
        4.1.1 样品来源第40页
        4.1.2 实验试剂第40页
        4.1.3 实验仪器第40-41页
        4.1.4 培养基的配置第41页
        4.1.5 土壤DNA的提取第41页
        4.1.6 电泳检测DNA提取结果第41页
        4.1.7 真菌rDNA的ITS序列和β-tublin序列PCR扩增第41-42页
        4.1.8 电泳检测PCR扩增结果第42页
        4.1.9 PCR产物的纯化第42页
        4.1.10 克隆第42页
        4.1.11 检测第42-43页
        4.1.12 数据分析处理第43页
    4.2 结果与分析第43-49页
        4.2.1 ITS测序结果分析第43-47页
        4.2.2 β-tublin测序结果分析第47-49页
    4.3 结论与讨论第49-51页
5 基于高通量测序技术对长白山自然保护区北坡森林土壤真菌多样性的研究第51-65页
    5.1 材料与方法第51-53页
        5.1.1 土样采集方法第51页
        5.1.2 试剂与药品第51页
        5.1.3 实验仪器第51页
        5.1.4 样品总DNA的提取及检测第51-52页
        5.1.5 初次PCR扩增第52页
        5.1.6 第二轮扩增第52页
        5.1.7 PCR产物的回收第52-53页
        5.1.8 定量混合第53页
        5.1.9 数据处理第53页
    5.2 结果与分析第53-62页
        5.2.1 土壤基因组DNA检测第53-54页
        5.2.2 所得PCR产物检测第54-55页
        5.2.3 长白山土壤真菌的多样性分析第55-58页
        5.2.4 长白山土壤真菌随时间的变化规律第58-59页
        5.2.5 长白山土壤真菌随海拔的变化规律第59-62页
    5.3 讨论与结论第62-65页
结论第65-67页
参考文献第67-73页
附录A DGGE供试土壤样品信息第73-74页
附录B 克隆真菌分类操作单元最匹配真菌第74-78页
附录C 高通量供试土壤样品信息第78-81页
附录D 属水平长白山真菌分类(高通量测序)第81-84页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第84-85页
致谢第85页

论文共85页,点击 下载论文
上一篇:基于微波辐射计的空中水汽含量反演方法研究
下一篇:HNF1A和FOXA2过表达诱导大鼠骨髓间充质干细胞定向分化为肝样细胞的研究