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通过权重基因共表达网络鉴定与肾细胞癌临床病理特征相关的分子标志物

论文创新点第5-6页
英汉对照缩略名词对照表第6-9页
中文摘要第9-12页
Abstracts第12-16页
引言第17-19页
第一部分 通过WGCNA鉴定与乳头状肾细胞癌病理分期相关的分子标志物第19-42页
    1 材料与方法第19-22页
        1.1 临床信息和基因数据的收集和预处理第19页
        1.2 差异基因的筛选第19-20页
        1.3 基因共表达网络构建和模块保守性分析第20页
        1.4 发现目的模块和目的模块的功能注释第20-21页
        1.5 鉴定枢纽基因及枢纽基因与临床特征的相关性分析第21页
        1.6 枢纽基因的生存分析和效能评价第21-22页
    2 结果第22-37页
        2.1 临床信息与基因数据的准备第22-26页
        2.2 差异表达基因的筛选第26-27页
        2.3 共表达网络构建和模块保守性分析第27-30页
        2.4 确定有临床意义的模块和功能注释第30-32页
        2.5 鉴定枢纽基因和相关性分析第32-34页
        2.6 枢纽基因的预后分析和效能评价第34-37页
    3 讨论第37-42页
第二部分 通过WGNCA鉴定与肾透明细胞癌组织学分级相关的分子标志物第42-58页
    1 材料与方法第42-44页
        1.1 临床与mRNA-Seq数据的收集第42页
        1.2 筛选差异基因第42-43页
        1.3 权重基因共表达网络构建和模块保守性统计第43页
        1.4 寻找有临床意义的模块和鉴定枢纽基因第43-44页
        1.5 枢纽基因表达在肿瘤组织学分级的统计学分析第44页
    2 结果第44-53页
        2.1 临床信息与基因数据的准备第44-47页
        2.2 肾透明细胞癌样本中差异表达基因的筛选第47-48页
        2.3 基因共表达网络构建和模块保守性分析第48-50页
        2.4 寻找有临床意义的模块和识别模块的枢纽基因第50-52页
        2.5 枢纽基因的表达水平在不同的肿瘤组织学分级中的统计分析第52-53页
    3 讨论第53-58页
第三部分 BUB1的蛋白表达与肾透明细胞癌Furhman分级的相关性研究及机制探索第58-75页
    1 材料与方法第58-66页
        1.1 患者临床病理特征信息与样本的收集第58-60页
        1.2 免疫组化的主要试剂及实验方法第60-61页
        1.3 免疫组织化学染色结果判定第61页
        1.4 细胞培养及瞬时转染第61-62页
        1.5 实时荧光定量PCR检测第62-64页
        1.6 Western blot实验第64-65页
        1.7 MTT检测肿瘤细胞增殖能力第65页
        1.8 肿瘤细胞侵袭实验第65-66页
        1.9 肿瘤细胞迁移实验第66页
    2 结果第66-71页
        2.1 BUB1在肾透明细胞癌及癌旁组织中的表达情况及临床意义第66-69页
        2.2 RT-PCR与western blot检测786-0细胞的敲除效率第69页
        2.3 BUB1具有调节肾透明细胞癌增殖活性的能力第69-70页
        2.4 BUB1具有调节肾透明细胞癌侵袭及迁移的能力第70-71页
    3 讨论第71-75页
参考文献第75-81页
综述第81-91页
    参考文献第87-91页
攻读博士学位期间科研成果第91-92页
致谢第92页

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