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Wnt抑制基因甲基化与信号通路活化及胃癌预后的相关性研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
缩略语表第8-13页
第一章 文献综述第13-28页
    1.1 胃癌现状第13-16页
        1.1.1 胃癌流行病学第13-14页
        1.1.2 胃癌发生风险因素第14-15页
        1.1.3 胃癌的防治策略第15-16页
    1.2 Wnt信号通路简介第16-22页
        1.2.1 经典Wnt信号通路也称为Wnt/β-catenin/LEF/TCF途径第17-18页
        1.2.2 非经典Wnt信号通路第18-19页
        1.2.3 Wnts配体第19-20页
        1.2.4 Wnt受体第20-21页
        1.2.5 Wnt抑制基因第21-22页
    1.3 Wnt信号通路与胃癌第22-23页
    1.4 DNA甲基化研究概述第23-28页
        1.4.1 DNA甲基化简介第23-24页
        1.4.2 DNA甲基化检测方法综述第24-28页
第二章 Wnt抑制基因甲基化在胃癌中的研究第28-48页
    2.1 引言第28-29页
    2.2 实验材料与仪器第29-30页
        2.2.1 样本收集第29页
        2.2.2 主要试剂:第29页
        2.2.3 主要仪器第29-30页
    2.3 实验方法第30-36页
        2.3.1 DNA提取第30页
        2.3.2 新鲜组织样本总RNA的提取第30-31页
        2.3.3 亚硫酸氢盐对DNA样本进行预处理第31-32页
        2.3.4 目标基因启动子区的扩增第32-34页
        2.3.5 RNA表达检测第34-36页
    2.4 统计分析第36页
    2.5 实验结果第36-45页
        2.5.1 Wnt抑制基因启动子区甲基化检测方法的建立第36-37页
        2.5.2 Wnt抑制基因甲基化在胃癌与癌旁组织的比较第37-39页
        2.5.3 Wnt抑制基因SRP2和DKK2在胃癌中共发存在第39-41页
        2.5.4 Wnt抑制基因甲基化与mRNA表达第41-42页
        2.5.5 SFRP2与DKK2共发高甲基化与β-catenin表达相关第42-43页
        2.5.6 Wnt抑制基因甲基化与临床病理的关系第43页
        2.5.7 总生存期分析第43-44页
        2.5.8 DAC药物处理后Wnt抑制基因表达的恢复第44-45页
    2.6 讨论第45-48页
第三章 DKK2基因在胃癌细胞中功能的研究第48-67页
    3.1 引言第48-49页
    3.2 材料与仪器第49-50页
        3.2.1 主要材料与试剂:第49-50页
        3.2.2 主要仪器第50页
    3.3 实验方法第50-59页
        3.3.1 过表达慢病毒克隆的制备第50-54页
        3.3.2 质粒抽提第54页
        3.3.3 慢病毒包装与质量检测第54-56页
        3.3.4 细胞培养第56页
        3.3.5 RNA及总蛋白提取与检测第56-57页
        3.3.6 Western Blot检测第57-58页
        3.3.7 CCK8细胞增殖实验第58页
        3.3.8 克隆形成第58页
        3.3.9 细胞凋亡实验第58页
        3.3.10 细胞迁移第58-59页
        3.3.11 细胞侵袭第59页
    3.4 统计分析第59页
    3.5 实验结果第59-65页
        3.5.1 克隆质粒的验证第59-61页
        3.5.2 病毒滴度检测第61页
        3.5.3 细胞系筛选第61-62页
        3.5.4 DKK2基因过表达的验证及对β-catenin的影响第62页
        3.5.5 细胞增殖第62-63页
        3.5.6 克隆形成第63页
        3.5.7 细胞凋亡第63-64页
        3.5.8 迁移实验第64-65页
        3.5.9 侵袭实验第65页
    3.6 讨论第65-67页
第四章 Wnt信号通路在胃癌的整合分析第67-84页
    4.1 引言第67-68页
    4.2 实验方法第68页
        4.2.1 获取Wnt信号通路基因第68页
        4.2.2 TCGA数据的处理第68页
        4.2.3 甲基化数据的获取第68页
    4.3 统计分析第68页
    4.4 实验结果第68-82页
        4.4.1 Wnt信号通路基因突变第69-73页
        4.4.2 Wnt信号通路mRNA表达异常第73-75页
        4.4.3 Wnt信号通路甲基化分析第75-80页
        4.4.4 Wnt信号通路甲基化异常基因筛选第80-82页
    4.5 讨论第82-84页
全文总结第84-85页
参考文献第85-101页
附录第101-118页
攻读博士学位期间取得的科研成果第118-119页
致谢第119-120页
作者简介第120页

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