| 中文摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略词表 | 第12-14页 |
| 1 前言 | 第14-17页 |
| 2 材料和方法 | 第17-30页 |
| 2.1 材料 | 第17-19页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第17页 |
| 2.1.2 主要试剂和试剂盒及其生产商 | 第17-18页 |
| 2.1.3 主要实验仪器 | 第18页 |
| 2.1.4 主要试剂的配制 | 第18-19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-30页 |
| 2.2.1 体外尘肺模型构建 | 第19-20页 |
| 2.2.2 DNA提取 | 第20-21页 |
| 2.2.3 MeDIP-seq文库构建 | 第21-23页 |
| 2.2.4 MeDIP-Seq信息分析流程 | 第23-26页 |
| 2.2.5 重亚硫酸盐PCR测序 | 第26-30页 |
| 3 结果 | 第30-39页 |
| 3.1 DNA提取结果 | 第30页 |
| 3.2 MeDIP-seq Reads数据分析 | 第30-31页 |
| 3.3 唯一比对位置的Reads在基因元件上的分布 | 第31-32页 |
| 3.4 MeDIP-Seq数据富集区域(Peak)扫描 | 第32页 |
| 3.5 统计Peak在不同基因功能元件上的分布 | 第32-33页 |
| 3.6 差异Peak区域（DMRS）分析 | 第33-34页 |
| 3.7 差异基因分析 | 第34-35页 |
| 3.8 GO功能注释 | 第35页 |
| 3.9 差异甲基化基因的Pathway分析 | 第35-38页 |
| 3.10 MeDIP-seq数据的亚硫酸氢盐测序（BSP）验证 | 第38-39页 |
| 4 讨论 | 第39-46页 |
| 4.1 游离SiO_2所致肺成纤维细胞转分化过程中的DNA甲基化模式 | 第39-40页 |
| 4.2 DNA差异基因的GO（Gene Ontology）分析 | 第40-41页 |
| 4.3 DNA差异基因的KEGG pathway分析 | 第41-46页 |
| 4.3.1 新陈代谢 | 第41-42页 |
| 4.3.2 环境信息加工 | 第42-43页 |
| 4.3.3 细胞过程 | 第43-44页 |
| 4.3.4 生物体系统 | 第44页 |
| 4.3.5 人类疾病 | 第44-46页 |
| 5 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-53页 |
| 综述 | 第53-64页 |
| 参考文献 | 第61-64页 |
| 个人简历 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
