| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 前言 | 第9-19页 |
| 1.1 硝化作用及其对氮循环和生态系统研究意义 | 第9-15页 |
| 1.1.1 硝化菌群及其研究进展 | 第9-11页 |
| 1.1.2 硝化作用过程的影响因素 | 第11-13页 |
| 1.1.3 硝化菌群的分布及多样性 | 第13-14页 |
| 1.1.4 硝化作用的研究方法 | 第14-15页 |
| 1.2 沙生环境硝化作用的研究进展 | 第15-16页 |
| 1.3 植物根际土硝化菌群的研究现状 | 第16-17页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第17-19页 |
| 第二章 研究材料与方法 | 第19-25页 |
| 2.1 研究区概况及样品采集 | 第19-21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-25页 |
| 2.2.1 土壤理化性质的测定 | 第21页 |
| 2.2.2 土壤宏基因组DNA的提取 | 第21页 |
| 2.2.3 硝化菌群的PCR扩增 | 第21-22页 |
| 2.2.4 实时定量PCR | 第22页 |
| 2.2.5 硝化菌群AOA、AOB和Fungi的HiSeq高通量测序 | 第22页 |
| 2.2.6 硝化速率潜势的测定 | 第22-23页 |
| 2.2.7 氨氧化古菌的富集培养 | 第23-24页 |
| 2.2.8 数据处理及分析方法 | 第24-25页 |
| 第三章 结果 | 第25-54页 |
| 3.1 土壤理化性质 | 第25页 |
| 3.2 硝化菌群的丰度及其与土壤理化因子的相关性 | 第25-30页 |
| 3.2.1 基因定量标准曲线 | 第25-28页 |
| 3.2.2 硝化菌群的丰度 | 第28-30页 |
| 3.2.3 不同硝化菌群的丰度与土壤理化性质之间的相关性分析 | 第30页 |
| 3.3 硝化速率潜势及其与土壤理化因子、硝化菌群丰度之间的相关性 | 第30-33页 |
| 3.3.1 硝化速率潜势 | 第30-31页 |
| 3.3.2 硝化速率潜势与土壤理化性质、硝化菌群的丰度之间的相关性 | 第31-33页 |
| 3.4 Hi-seq高通量测序所得菌群组成及结构分析 | 第33-51页 |
| 3.4.1 硝化菌群PCR结果 | 第33-34页 |
| 3.4.2 高通量测序原始数据质量评估 | 第34-36页 |
| 3.4.3 硝化菌群的稀缺性曲线 | 第36页 |
| 3.4.4 硝化菌群的系统发育树 | 第36-50页 |
| 3.4.5 硝化菌群的结构组成与环境因子之间的关系 | 第50-51页 |
| 3.5 氨氧化古菌的富集培养及富集培养物的生理特性分析 | 第51-54页 |
| 第四章 讨论 | 第54-59页 |
| 4.1 硝化菌群的丰度与土壤理化性质之间的相关性 | 第54-55页 |
| 4.2 硝化速率潜势与土壤理化性质之间的相关性 | 第55-56页 |
| 4.3 硝化菌群的多样性及其分布特征 | 第56-57页 |
| 4.4 氨氧化古菌的富集培养 | 第57-59页 |
| 第五章 结论与展望 | 第59-61页 |
| 结论 | 第59页 |
| 不足与展望 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-74页 |
| 资金资助情况 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
