连续模型上的蛋白质分子场建模及拓扑分析
| 详细摘要 | 第5-9页 |
| 摘要 | 第9-10页 |
| Abstract | 第10页 |
| 第一章 绪论 | 第13-17页 |
| 1.1 蛋白质可视化的研究背景与意义 | 第13-14页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第14-15页 |
| 1.3 本文研究内容 | 第15-16页 |
| 1.3.1 拓扑分析方面的研究目标 | 第15页 |
| 1.3.2 数据建模方面的研究目标 | 第15-16页 |
| 1.4 本文组织结构 | 第16-17页 |
| 第二章 相关理论基础 | 第17-27页 |
| 2.1 蛋白质的分子结构 | 第17-19页 |
| 2.1.1 蛋白质的一级结构 | 第17-18页 |
| 2.1.2 蛋白质的二级结构 | 第18页 |
| 2.1.3 蛋白质的三级结构 | 第18-19页 |
| 2.1.4 蛋白质的四级结构 | 第19页 |
| 2.2 提取蛋白质分子结构的方法 | 第19-21页 |
| 2.2.1 质谱分析 | 第20页 |
| 2.2.2 X-射线晶体衍射 | 第20页 |
| 2.2.3 核磁共振技术 | 第20-21页 |
| 2.3 蛋白质分子模型 | 第21页 |
| 2.4 蛋白质数据库 | 第21-22页 |
| 2.5 体数据的概念 | 第22-23页 |
| 2.6 三维标量数据建模分析和可视化的流程 | 第23-24页 |
| 2.7 三维连续标量场传输函数的设计 | 第24-26页 |
| 2.8 本章小结 | 第26-27页 |
| 第三章 连续框架下的数据重建 | 第27-33页 |
| 3.1 基于BOX样条的连续框架 | 第27-29页 |
| 3.1.1 Box样条定义 | 第27-28页 |
| 3.1.2 7方向Box样条定义 | 第28-29页 |
| 3.2 连续数据场的快速计算方法 | 第29-31页 |
| 3.3 7方向box样条的重建结果 | 第31-32页 |
| 3.4 本章小结 | 第32-33页 |
| 第四章 蛋白质分子场拓扑骨架的提取 | 第33-50页 |
| 4.1 莫尔斯理论的基本概念 | 第33-35页 |
| 4.2 离散莫尔斯理论 | 第35-36页 |
| 4.3 离散框架与连续框架的拓扑分析 | 第36-38页 |
| 4.4 提取特征点 | 第38-42页 |
| 4.4.1 数据预处理 | 第38-39页 |
| 4.4.2 特征点的计算公式 | 第39页 |
| 4.4.3 牛顿迭代法 | 第39-42页 |
| 4.5 蛋白质拓扑骨架的提取 | 第42-44页 |
| 4.6 蛋白质拓扑骨架的提取结果 | 第44-46页 |
| 4.7 蛋白质结构的探究 | 第46-49页 |
| 4.7.1 活性位点的探究 | 第47页 |
| 4.7.2 α-螺旋的探究 | 第47-49页 |
| 4.8 本章小结 | 第49-50页 |
| 第五章 总结与展望 | 第50-52页 |
| 5.1 本文工作总结 | 第50-51页 |
| 5.2 未来展望 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| 附录 | 第58页 |
