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大豆异黄酮相关基因的表达分析及GmbHLH3a基因的功能鉴定

中文摘要第5-7页
Abstract第7-8页
目录第9-13页
中英文缩略语表第13-15页
第一章 绪论第15-24页
    1.1 大豆异黄酮的研究第15-19页
        1.1.1 异黄酮的生物功能第15-16页
        1.1.2 大豆异黄酮的种类及分布第16-17页
        1.1.3 异黄酮生物合成相关酶基因第17-18页
        1.1.4 影响异黄酮合成的环境因素第18页
        1.1.5 大豆异黄酮积累 QTL 位点相关研究进展第18-19页
    1.2 bHLH 转录因子的研究进展第19-21页
        1.2.1 bHLH 转录因子的结构与分类第19-20页
        1.2.2 bHLH 的生物学功能第20-21页
    1.3 分子生物学研究方法第21-22页
        1.3.1 基因表达谱第21页
        1.3.2 酵母双杂文库第21-22页
        1.3.3 豆科模式转化系统第22页
    1.4 本研究的目的和意义第22-24页
第二章 大豆籽粒不同发育时期基因数字表达谱的生物信息学分析第24-30页
    2.1 材料第24页
    2.2 实验方法第24-25页
        2.2.1 基因表达谱测序第24页
        2.2.2 数字表达谱生物信息学分析第24-25页
    2.3 结果与分析第25-29页
        2.3.1 reads 各个位置核苷酸的检测质量第25-26页
        2.3.2 测序饱和度的分析第26-27页
        2.3.3 序列拷贝数的分析第27-28页
        2.3.4 差异基因表达量的统计第28-29页
    2.4 讨论第29-30页
第三章 大豆籽粒不同发育时期异黄酮合成相关基因的表达分析第30-51页
    3.1 材料第30-33页
        3.1.1 植物材料第30页
        3.1.2 主要试剂第30页
        3.1.3 主要仪器设备第30页
        3.1.4 试剂配制第30页
        3.1.5 qRT- PCR 引物第30-33页
    3.2 方法第33-36页
        3.2.2 大豆籽粒不同发育时期异黄酮含量测定第33-34页
        3.2.3 异黄酮相关基因表达模式聚类分析第34页
        3.2.4 bHLH 转录因子家族进化分析及表达模式聚类分析第34页
        3.2.5 异黄酮相关基因 qRT-PCR 表达模式分析第34-36页
        3.2.6 大豆异黄酮合成相关基因的遗传图谱绘制第36页
    3.3 结果与分析第36-49页
        3.3.1 大豆籽粒不同发育时期异黄酮含量的测定第36-38页
        3.3.2 异黄酮相关基因表达模式聚类分析结果第38-41页
        3.3.3 bHLH 转录因子家族进化分析及表达模式聚类分析结果第41-42页
        3.3.4 异黄酮相关基因 qRT-PCR 表达模式分析结果第42-45页
        3.3.5 大豆异黄酮合成相关基因的遗传图谱第45-49页
    3.4 讨论第49-50页
    3.5 小结第50-51页
第四章 大豆 GmbHLH3a 和 GmMYC2a 基因的克隆及序列分析第51-64页
    4.1 材料第51-53页
        4.1.1 植物材料第51页
        4.1.2 载体和菌株第51页
        4.1.3 主要试剂第51页
        4.1.4 主要仪器设备第51-52页
        4.1.5 试剂配制第52页
        4.1.6 PCR 引物第52-53页
    4.2 方法第53-58页
        4.2.1 大豆总 RNA 的提取第53页
        4.2.2 第一链 cDNA 的合成第53-54页
        4.2.3 大豆 GmbHLH3a 和 GmMYC2a 基因 cDNA 全长 PCR 扩增第54-55页
        4.2.4 PCR 产物回收第55页
        4.2.5 PCR 产物的克隆第55-56页
        4.2.6 大肠杆菌感受态 DH5α细胞的制备和转化第56-57页
        4.2.7 转化子的鉴定第57-58页
        4.2.8 生物信息学分析第58页
    4.3 结果与分析第58-62页
        4.3.1 大豆 GmbHLH3a 和 GmMYC2a 基因 cDNA 的全序列的获得第58-59页
        4.3.2 核苷酸序列特征分析及蛋白质的结构和功能预测第59-61页
        4.3.3 GmbHLH3a 和 GmMYC2a 相互作用蛋白质预测第61-62页
    4.4 讨论第62-63页
    4.5 小结第63-64页
第五章 GmbHLH3a 基因功能的初步分析第64-78页
    5.1 材料第64-66页
        5.1.1 植物材料第64页
        5.1.2 质粒及菌株第64页
        5.1.3 工具酶及生化试剂第64页
        5.1.4 主要仪器设备第64页
        5.1.5 试剂配制第64-66页
    5.2 方法第66-73页
        5.2.1 引物设计第66-67页
        5.2.2 原核表达第67-69页
        5.2.3 亚细胞定位第69-72页
        5.2.4 GmbHLH3a 和 GmMYC2a 基因激活结构域的真核检测第72-73页
    5.3 结果与分析第73-76页
        5.3.1 原核表达第73-74页
        5.3.2 GmbHLH3a 和 GmMYC2a 融合蛋白的亚细胞定位第74-75页
        5.3.3 GmbHLH3a 和 GmMYC2a 蛋白转录激活活性鉴定第75-76页
    5.4 讨论第76-77页
    5.5 小结第77-78页
第六章 大豆胚发育期酵母双杂文库的构建及与大豆 GmbHLH3a 互作蛋白的筛选第78-85页
    6.1 材料第78页
        6.1.1 植物材料第78页
        6.1.2 质粒及菌株第78页
        6.1.3 工具酶及生化试剂第78页
        6.1.4 主要仪器设备第78页
        6.1.5 试剂配制第78页
    6.2 方法第78-81页
        6.2.1 引物设计第78-79页
        6.2.2 大豆籽粒生长期均一化酵母双杂交 cDNA 文库构建第79-80页
        6.2.3 酵母双杂交体系筛选与 GmbHLH3a 互作蛋白第80-81页
        6.2.4 筛选到的互作蛋白的生物信息学分析第81页
    6.3 结果与分析第81-83页
        6.3.1 酵母文库重组率和插入片段长度鉴定第81页
        6.3.2 与 GmbHLH3a 互作蛋白的筛选第81-83页
        6.3.3 筛选到的互做蛋白生物信息学分析第83页
    6.4 讨论第83-85页
第七章 GmbHLH3a 基因在大豆发根中的表达及调控异黄酮合成的功能分析第85-91页
    7.1 材料第85-86页
    7.2 方法第86-87页
        7.2.1 GmbHLH3a 基因的发根农杆菌的遗传转化第86-87页
        7.2.2 阳性发根的筛选及鉴定第87页
        7.2.3 HPLC 测定转基因发根异黄酮含量第87页
    7.3 结果与分析第87-90页
        7.3.1 侵染大豆发状根及诱导发根的筛选及鉴定第87-89页
        7.3.2 HPLC 测定转基因发根异黄酮含量结果第89-90页
    7.4 讨论第90-91页
讨论第91-94页
参考文献第94-105页
作者简介及科研成果第105页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第105-106页
致谢第106页

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