| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 第一章 水稻糖分含量全基组关联分析 | 第11-48页 |
| 1 前言 | 第11-21页 |
| 1.1 水稻源库理论 | 第11-13页 |
| 1.1.1 水稻源库理论中“源”、“库”、“流”的概念 | 第11-12页 |
| 1.1.2 源库理论在水稻中的应用 | 第12-13页 |
| 1.2 水稻糖分积累的意义 | 第13页 |
| 1.3 水稻蔗糖和淀粉积累的相关酶 | 第13-17页 |
| 1.3.1 蔗糖磷酸合成酶 | 第14页 |
| 1.3.2 蔗糖合成酶 | 第14-15页 |
| 1.3.3 ADPG焦磷酸化酶 | 第15页 |
| 1.3.4 淀粉合成酶 | 第15-16页 |
| 1.3.5 淀粉分支酶 | 第16-17页 |
| 1.4 关联分析 | 第17-20页 |
| 1.4.1 关联分析的基础 | 第17-19页 |
| 1.4.2 全基因组关联在水稻中的应用 | 第19-20页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-22页 |
| 2.1 试验材料 | 第21页 |
| 2.2 试验方法 | 第21-22页 |
| 2.2.1 材料种植 | 第21页 |
| 2.2.2 糖分抽提与含量测定 | 第21页 |
| 2.2.3 产量性状考察 | 第21-22页 |
| 2.2.4 GWAS分析 | 第22页 |
| 3 结果与分析 | 第22-45页 |
| 3.1 亚群间抽穗期与成熟期糖分含量差异分析 | 第22-26页 |
| 3.2 核心种质糖分含量及产量性状相关性分析 | 第26-30页 |
| 3.2.1 核心种质不同时期不同组织糖分含量数据相关性分析 | 第26-29页 |
| 3.2.2 核心种质糖分与产量的相关性分析 | 第29-30页 |
| 3.3 GWAS检测糖分及蔗糖转运相关性状显著性位点 | 第30-31页 |
| 3.4 GWAS检测到的显著性位点与已克隆基因SSSII-2 间的关系 | 第31-43页 |
| 3.5 淀粉合成酶基因SSSII-2 多样性分析 | 第43-45页 |
| 4 讨论 | 第45-48页 |
| 4.1 核心种质糖分含量在群体中的遗传变异 | 第45页 |
| 4.2 水稻核心种质各种糖分含量及变化对产量的影响 | 第45-46页 |
| 4.3 SSSII-2基因单倍型与亚群结构的关系 | 第46页 |
| 4.4 SSSII-2与抽穗期和成熟期不同组织淀粉含量的关系 | 第46-47页 |
| 4.5 GWAS检测到的显著性位点与其它基因 | 第47-48页 |
| 第二章 同化物合成相关性状QTLs验证 | 第48-58页 |
| 1 前言 | 第48-51页 |
| 1.1 水稻同化物合成相关性状研究现状 | 第48-49页 |
| 1.1.1 水稻叶绿素含量的研究 | 第48-49页 |
| 1.1.2 水稻剑叶长宽的研究 | 第49页 |
| 1.2 QTL的定位分析 | 第49-50页 |
| 1.2.1 QTL分析原理和步骤 | 第49-50页 |
| 1.2.2 QIL定位方法 | 第50页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第50-51页 |
| 2 材料与方法 | 第51-53页 |
| 2.1 实验材料 | 第51页 |
| 2.2 实验材料种植 | 第51页 |
| 2.3 性状考察 | 第51-52页 |
| 2.4 分子标记QTL分析 | 第52-53页 |
| 2.4.1 DNA提取和PCR扩增 | 第52页 |
| 2.4.2 电泳检测 | 第52页 |
| 2.4.3 数据处理与分析 | 第52-53页 |
| 3 结果与分析 | 第53-55页 |
| 3.1 SPAD、SPAD-FL和剑叶长宽在群体中分布 | 第53页 |
| 3.2 SPAD、SPAD-FL和剑叶长宽QTL验证 | 第53-55页 |
| 4 讨论 | 第55-58页 |
| 4.1 SPAD与SPAD-FL的比较 | 第55-56页 |
| 4.2 全基因组关联分析与分子标记连锁的QTL定位 | 第56-57页 |
| 4.3 水稻剑叶长宽及SPAD值与产量关系 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-67页 |
| 附录 | 第67-71页 |
| 附A 水稻可溶性糖与淀粉抽提与含量测定 | 第67-69页 |
| 附B 聚丙烯酰胺（PAGE）制作流程 | 第69-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
