| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 引言 | 第12-14页 |
| 第一章 草鱼分子标记研究进展 | 第14-23页 |
| 1 草鱼遗传标记研究现状 | 第14-19页 |
| 1.1 形态遗传标记 | 第14-15页 |
| 1.2 细胞遗传标记 | 第15-16页 |
| 1.3 生化遗传标记 | 第16页 |
| 1.4 分子遗传标记 | 第16-19页 |
| 1.4.1 RFLP在草鱼中的应用 | 第17页 |
| 1.4.2 RAPD在草鱼中的应用 | 第17-18页 |
| 1.4.3 SSR在草鱼中的应用 | 第18-19页 |
| 2. SNP分子遗传标记的研究进展 | 第19-23页 |
| 2.1 SNP的定义及特征 | 第19页 |
| 2.2 SNP的开发途径 | 第19-20页 |
| 2.2.1 直接测序 | 第19页 |
| 2.2.2 核酸数据库中筛选 | 第19-20页 |
| 2.3 SNP的检测方法 | 第20-22页 |
| 2.3.1 测序峰图法 | 第20页 |
| 2.3.2 PCR-SSCP法 | 第20页 |
| 2.3.3 AS-PCR法 | 第20-21页 |
| 2.3.4 HRM法 | 第21页 |
| 2.3.5 DHPLC法 | 第21页 |
| 2.3.6 SNaPshot法 | 第21-22页 |
| 2.4 SNP分子遗传标记在草鱼中的研究及应用 | 第22-23页 |
| 第二章 基于草鱼转录组的SNP开发及其特征分析 | 第23-34页 |
| 1．材料与方法 | 第24-29页 |
| 1.1 实验材料 | 第24-25页 |
| 1.1.1 实验样品采集 | 第24页 |
| 1.1.2 主要仪器设备 | 第24页 |
| 1.1.3 主要实验试剂 | 第24页 |
| 1.1.4 主要试剂配制 | 第24-25页 |
| 1.2 实验方法 | 第25-29页 |
| 1.2.1 基因组DNA的提取、检测及稀释 | 第25-26页 |
| 1.2.2 转录组中SNP位点筛选及引物设计 | 第26-29页 |
| 1.2.3 草鱼39个SNP分型 | 第29页 |
| 1.2.4 分型结果分析 | 第29页 |
| 2．结果 | 第29-31页 |
| 2.1 基因组DNA检测结果 | 第29-30页 |
| 2.2 草鱼转录组中SNP分析 | 第30-31页 |
| 2.3 SNP分型结果及特征分析 | 第31页 |
| 3．讨论 | 第31-34页 |
| 第三章 草鱼MSTN-1 基因SNP筛选及与早期生长性状关联分析 | 第34-43页 |
| 1 材料与方法 | 第35-37页 |
| 1.1 实验样品 | 第35页 |
| 1.2 基因组DNA提取及肌肉成分分析 | 第35页 |
| 1.3 草鱼MSTN-1 基因SNPs筛选 | 第35-36页 |
| 1.4 序列分析及数据处理 | 第36-37页 |
| 2. 结果与分析 | 第37-41页 |
| 2.1 草鱼MSTN-1 基因全长及SNPs位点筛选 | 第37-38页 |
| 2.2 草鱼MSTN-1 基因多态性分析 | 第38-39页 |
| 2.3 草鱼MSTN-1 基因SNPs与生长性状及肌肉成分相关分析 | 第39-41页 |
| 3 讨论 | 第41-43页 |
| 第四章 草鱼IGF1基因SNPS筛选及与生长性状关联分析 | 第43-57页 |
| 1. 材料与方法 | 第44-49页 |
| 1.1 实验样品 | 第44页 |
| 1.2 基因组DNA提取及检测 | 第44页 |
| 1.3 草鱼IGF1基因SNP预筛选 | 第44-45页 |
| 1.4 基于等位基因特异性SNP分型引物的设计 | 第45-47页 |
| 1.5 分型结果验证 | 第47页 |
| 1.6 草鱼IGF1基因SNP位点特征及与生长性状相关分析 | 第47-49页 |
| 2. 结果 | 第49-54页 |
| 2.1 草鱼IGF1基因SNP预筛选 | 第49-52页 |
| 2.2 分型结果 | 第52-53页 |
| 2.3 草鱼IGF1基因SNP特征分析 | 第53-54页 |
| 2.4 草鱼IGF1基因SNP与生长性状关联分析 | 第54页 |
| 3. 讨论 | 第54-57页 |
| 论文小结 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-66页 |
| 附录 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
