| 摘要 | 第5-7页 |
| ABASTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-31页 |
| 1.1 趋磁细菌简介 | 第13页 |
| 1.2 趋磁细菌的生态分布 | 第13-14页 |
| 1.3 趋磁细菌的磁小体 | 第14-17页 |
| 1.3.1 磁小体的特征 | 第14-15页 |
| 1.3.2 磁小体的合成调控 | 第15-17页 |
| 1.4 趋磁细菌的鞭毛及运动特征 | 第17-22页 |
| 1.4.1 趋磁细菌的鞭毛特征 | 第17-18页 |
| 1.4.2 趋磁细菌的运动 | 第18-22页 |
| 1.5 趋磁细菌的系统发育多样性 | 第22-24页 |
| 1.5.1 α-变形菌纲 | 第22页 |
| 1.5.2 δ-变形菌纲 | 第22-23页 |
| 1.5.3 γ-变形菌纲 | 第23页 |
| 1.5.4 硝化螺菌门 | 第23-24页 |
| 1.5.5 其他类群 | 第24页 |
| 1.6 趋磁细菌的形态 | 第24-28页 |
| 1.6.1 趋磁杆菌 | 第25-27页 |
| 1.6.2 多细胞趋磁原核生物 | 第27-28页 |
| 1.7 趋磁细菌的研究意义与应用 | 第28-29页 |
| 1.7.1 趋磁细菌菌体的研究意义与应用 | 第28页 |
| 1.7.2 磁小体的研究意义与应用 | 第28-29页 |
| 1.8 目前存在的科学问题及本研究的内容及意义 | 第29-31页 |
| 第二章 趋磁细菌研究材料与方法 | 第31-44页 |
| 2.1 趋磁细菌收集 | 第31-32页 |
| 2.2 光学显微镜观察菌体形态及运动特征 | 第32-33页 |
| 2.3 荧光显微镜观察菌体自发荧光和内含物 | 第33页 |
| 2.4 扫描电镜观察菌体表面结构 | 第33-34页 |
| 2.5 透射电镜观察菌体超微结构 | 第34页 |
| 2.6 磁小体和内含物成分分析 | 第34-35页 |
| 2.7 显微操作技术 | 第35-37页 |
| 2.7.1 显微操作技术原理与应用 | 第35页 |
| 2.7.2 显微操作系统的使用方法 | 第35-37页 |
| 2.8 趋磁细菌系统发育分析 | 第37-41页 |
| 2.8.1 单细胞全基因组扩增 | 第37-38页 |
| 2.8.2 趋磁细菌系统发育地位分析 | 第38-41页 |
| 2.9 荧光原位杂交检测序列可靠性 | 第41-44页 |
| 2.9.1 设计特异性寡核苷酸探针 | 第41-42页 |
| 2.9.2 荧光原位杂交流程 | 第42-44页 |
| 第三章 青岛汇泉湾潮间带沉积物趋磁杆菌QR-1特性研究 | 第44-62页 |
| 3.1 采样点及样品描述 | 第44-45页 |
| 3.2 趋磁杆菌QR-1光学显微镜形态特征 | 第45-47页 |
| 3.3 趋磁杆菌QR-1光学显微镜运动特征 | 第47-51页 |
| 3.3.1 轴向运动特征 | 第47-48页 |
| 3.3.2 群体运动特征 | 第48-49页 |
| 3.3.3 其他运动特征 | 第49-51页 |
| 3.4 趋磁杆菌QR-1电子显微镜特征 | 第51-56页 |
| 3.4.1 趋磁杆菌QR-1电子显微镜形态特征 | 第51-52页 |
| 3.4.2 趋磁杆菌QR-1电子显微镜磁小体及内含物特征 | 第52-54页 |
| 3.4.3 趋磁杆菌QR-1电子显微镜鞭毛特征 | 第54-56页 |
| 3.5 趋磁杆菌QR-1的系统发育地位 | 第56-58页 |
| 3.5.1 16S rRNA扩增与分析 | 第56页 |
| 3.5.2 FISH检测序列的准确性 | 第56-57页 |
| 3.5.3 趋磁杆菌QR-1的系统发育分析 | 第57-58页 |
| 3.6 讨论 | 第58-60页 |
| 3.7 小结 | 第60-62页 |
| 第四章 潮间带海洋趋磁杆菌特性研究 | 第62-72页 |
| 4.1 采样点描述及样品处理 | 第62-63页 |
| 4.1.1 法国马赛Six-Fours-les-Plages | 第62页 |
| 4.1.2 荣成月湖潮间带 | 第62-63页 |
| 4.2 海洋趋磁杆菌的特征 | 第63-66页 |
| 4.3 海洋趋磁杆菌的系统发育多样性分析 | 第66-68页 |
| 4.4 讨论 | 第68-71页 |
| 4.5 小结 | 第71-72页 |
| 第五章 西沙群岛珊瑚礁生境趋磁细菌多样性研究 | 第72-93页 |
| 5.1 采样点描述 | 第72-73页 |
| 5.1.1 西沙群岛珊瑚礁生态系统采样区 | 第72-73页 |
| 5.1.2 样品采集 | 第73页 |
| 5.2 趋磁细菌站位分布特征 | 第73-75页 |
| 5.3 透射电镜下趋磁细菌形态及结构 | 第75-84页 |
| 5.3.1 趋磁细菌形态多样性 | 第75-81页 |
| 5.3.2 磁小体的形态多样性 | 第81-82页 |
| 5.3.3 多细胞趋磁原核生物的分裂 | 第82-84页 |
| 5.4 扫描电镜下趋磁细菌多样性及表面结构 | 第84-85页 |
| 5.5 趋磁细菌的系统发育多样性分析 | 第85-88页 |
| 5.6 采样点沉积物粒度分析 | 第88-90页 |
| 5.7 讨论 | 第90-92页 |
| 5.8 小结 | 第92-93页 |
| 第六章 Magnetospira sp.QH-2 MamK蛋白的结构和系统进化分析 | 第93-102页 |
| 6.1 分析方法 | 第93-94页 |
| 6.1.1 MamK蛋白的理化性质分析 | 第93页 |
| 6.1.2 MamK蛋白的高级结构分析及同源建模 | 第93页 |
| 6.1.3 QH-2 MamK蛋白系统进化分析 | 第93-94页 |
| 6.2 结果分析 | 第94-100页 |
| 6.2.1 MamK蛋白理化性质分析 | 第94-95页 |
| 6.2.2 QH-2 MamK蛋白高级结构分析 | 第95-96页 |
| 6.2.3 QH-2 MamK蛋白系统进化分析 | 第96-100页 |
| 6.3 讨论 | 第100-101页 |
| 6.4 小结 | 第101-102页 |
| 第七章 结论与展望 | 第102-105页 |
| 7.1 结论 | 第102-104页 |
| 7.2 展望 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-119页 |
| 致谢 | 第119-122页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第122-123页 |
