| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 本文缩略词 | 第11-15页 |
| 1 引言 | 第15-27页 |
| 1.1 光合作用改良途径 | 第15-17页 |
| 1.1.1 光合作用主要载体——叶绿体 | 第16页 |
| 1.1.2 核基因对叶绿体的调控作用 | 第16-17页 |
| 1.2 林木光合作用研究 | 第17-18页 |
| 1.2.1 林木的光合动态变化 | 第17-18页 |
| 1.2.2 环境因子对光合效率的影响 | 第18页 |
| 1.3 林木研究的模式植物——杨树 | 第18-23页 |
| 1.3.1 基因芯片技术在杨树研究中的应用 | 第19页 |
| 1.3.2 分子标记技术在杨树研究中的应用 | 第19-23页 |
| 1.3.2.1 常见分子标记 | 第19-20页 |
| 1.3.2.2 分子标记在林木育种上的应用 | 第20-23页 |
| 1.4 立题依据及意义 | 第23-24页 |
| 1.5 主要内容及技术路线 | 第24-27页 |
| 2 毛白杨核基因组光合作用相关基因的发掘 | 第27-63页 |
| 2.1 引言 | 第27页 |
| 2.2 材料与方法 | 第27-31页 |
| 2.2.1 植物材料 | 第27-28页 |
| 2.2.2 实验试剂 | 第28页 |
| 2.2.3 实验仪器 | 第28页 |
| 2.2.4 光合性状的测量 | 第28页 |
| 2.2.5 基因池构建方法 | 第28页 |
| 2.2.6 DNA的提取 | 第28-29页 |
| 2.2.7 RNA的提取 | 第29页 |
| 2.2.8 CDNA的合成 | 第29页 |
| 2.2.9 基因芯片杂交和数据读取 | 第29页 |
| 2.2.10 生物信息学分析 | 第29页 |
| 2.2.11 差异表达基因的REALTIME-PCR检验 | 第29-31页 |
| 2.3 结果与分析 | 第31-38页 |
| 2.3.1 差异表达基因的GO分析和共表达模式分析 | 第31-35页 |
| 2.3.2 差异表达基因的功能分类 | 第35-37页 |
| 2.3.3 REALTIME-PCR验证 | 第37-38页 |
| 2.3.4 核基因组光合调控网络的构建 | 第38页 |
| 2.4 讨论 | 第38-57页 |
| 2.4.1 与细胞器互作的差异表达基因 | 第39-46页 |
| 2.4.2 光合作用与细胞壁合成 | 第46-51页 |
| 2.4.3 光合作用与植物激素 | 第51页 |
| 2.4.4 光合作用与植物应激反应 | 第51-56页 |
| 2.4.5 光合作用与代谢 | 第56页 |
| 2.4.6 光合作用与运输 | 第56-57页 |
| 2.5 小结 | 第57-63页 |
| 3 光合作用候选基因内SNP在白杨家系中的连锁分析 | 第63-77页 |
| 3.1 引言 | 第63页 |
| 3.2 材料与方法 | 第63-66页 |
| 3.2.1 植物材料 | 第63-64页 |
| 3.2.2 光合、生长与木材性状的测定 | 第64页 |
| 3.2.3 实验试剂 | 第64页 |
| 3.2.4 实验仪器 | 第64页 |
| 3.2.5 总DNA和RNA的提取 | 第64-65页 |
| 3.2.6 候选基因的克隆及转化 | 第65页 |
| 3.2.7 SNP位点的发现与基因分型 | 第65-66页 |
| 3.2.8 SNP单标记连锁分析 | 第66页 |
| 3.3 结果与分析 | 第66-72页 |
| 3.3.1 连锁群体表型性状分析 | 第66-69页 |
| 3.3.2 SNP多态性分析 | 第69-70页 |
| 3.3.3 SNP单标记连锁分析 | 第70-72页 |
| 3.4 讨论 | 第72-74页 |
| 3.4.1 基于候选基因的连锁分析 | 第72-74页 |
| 3.4.2 候选基因的功能推测 | 第74页 |
| 3.5 小结 | 第74-77页 |
| 4 CLUSTER 3中光合作用相关基因的分析及SNP关联分析 | 第77-89页 |
| 4.1 引言 | 第77页 |
| 4.2 材料与方法 | 第77-78页 |
| 4.2.1 CLUSTER 3中差异基因的获得 | 第77页 |
| 4.2.2 植物材料 | 第77页 |
| 4.2.3 关联群体表型性状测量 | 第77-78页 |
| 4.2.4 生物信息学分析 | 第78页 |
| 4.2.5 SNP位点的发现与基因分型 | 第78页 |
| 4.2.6 自然群体结构的分析 | 第78页 |
| 4.3 结果与分析 | 第78-85页 |
| 4.3.1 CLUSTER 3中基因的生物信息学分析 | 第78-81页 |
| 4.3.1.1 基于GO的生物信息学分析 | 第78-79页 |
| 4.3.1.2 基于代谢通路的分析 | 第79-81页 |
| 4.3.2 关联群体表型性状分析 | 第81-83页 |
| 4.3.3 CLUSTER 3中基因内SNP标记与表型性状的关联分析 | 第83-84页 |
| 4.3.4 CLUSTER 3中基因内SNP互作分析 | 第84-85页 |
| 4.3.5 CLUSTER 3中基因顺式作用元件分析 | 第85页 |
| 4.4 讨论 | 第85-87页 |
| 4.4.1 与光合作用及细胞壁过程相关联的基因 | 第85-86页 |
| 4.4.2 自然条件下光合作用的调控机制 | 第86-87页 |
| 4.5 小结 | 第87-89页 |
| 5 光合通路相关基因的互作分析 | 第89-101页 |
| 5.1 引言 | 第89页 |
| 5.2 材料与方法 | 第89-90页 |
| 5.2.1 光合通路相关基因的获得 | 第89-90页 |
| 5.2.2 植物材料 | 第90页 |
| 5.2.3 关联群体表型性状的测量 | 第90页 |
| 5.2.4 生物信息学分析 | 第90页 |
| 5.2.5 SNP位点的发现与基因分型 | 第90页 |
| 5.2.6 自然群体结构的分析 | 第90页 |
| 5.2.7 SNP与杨树光合、生长与木材性状的关联分析 | 第90页 |
| 5.2.8 光合通路相关基因互作网络的构建 | 第90页 |
| 5.3 结果与分析 | 第90-97页 |
| 5.3.1 光合通路相关基因及SNP多态性分析 | 第90-93页 |
| 5.3.2 基因内SNP标记与光合、生长及木材性状的关联分析 | 第93-96页 |
| 5.3.3 光通路基因的加性效应与显性效应 | 第96页 |
| 5.3.4 基于基因效应的光合通路基因互作 | 第96-97页 |
| 5.4 讨论 | 第97-99页 |
| 5.4.1 光通路基因的关联分析 | 第97页 |
| 5.4.2 光通路基因的基因互作 | 第97-99页 |
| 5.5 小结 | 第99-101页 |
| 6 结论与展望 | 第101-105页 |
| 6.1 结论 | 第101-104页 |
| 6.2 展望 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-115页 |
| 附录 | 第115-145页 |
| 个人简介 | 第145-146页 |
| 导师简介 | 第146-147页 |
| 获得成果目录清单 | 第147-149页 |
| 致谢 | 第149页 |
