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芍药灰霉病抗性差异的转录组测序分析研究

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
缩略词表第9-13页
第一章 文献综述第13-21页
    1 植物抗病机制研究进展第13-16页
        1.1 植物抗病类型第13-15页
        1.2 植物抗病相关基因第15-16页
    2 高通量测序技术在植物抗病研究中的应用第16-18页
        2.1 转录组测序第17页
        2.2 数字基因表达谱测序第17-18页
        2.3 小RNA测序第18页
    3 芍药病害研究进展第18-20页
        3.1 露地芍药病害第18-19页
        3.2 设施芍药病害第19页
        3.3 芍药病害研究中存在的问题第19-20页
    4 研究的目的和意义第20-21页
第二章 芍药灰霉病病原鉴定第21-31页
    1 材料与方法第21-25页
        1.1 材料第21-22页
        1.2 方法第22-25页
    2 结果与分析第25-30页
        2.1 芍药灰霉病田间症状第25-26页
        2.2 病原菌形态特征第26-27页
        2.3 病原菌致病性第27-28页
        2.4 病原菌寄主范围第28页
        2.5 病原菌rDNA-ITS序列第28-30页
        2.6 芍药灰霉病病原鉴定结果第30页
    3 讨论第30-31页
第三章 芍药灰霉病抗性差异的数字基因表达谱分析第31-58页
    1 材料与方法第31-36页
        1.1 材料第31-32页
        1.2 方法第32-36页
    2 结果与分析第36-55页
        2.1 测序数据比对及质量评估第36-39页
        2.2 差异表达基因的筛选与分析第39-42页
        2.3 差异表达基因的功能富集分析第42-48页
        2.4 候选抗病相关基因的表达模式分析第48-53页
        2.5 候选基因表达水平的qRT-PCR验证第53-55页
    3 讨论第55-58页
第四章 芍药灰霉病抗性差异的小RNA测序分析第58-72页
    1 材料与方法第58-61页
        1.1 材料第58-59页
        1.2 方法第59-61页
    2 结果与分析第61-70页
        2.1 小RNA测序质量分析第61-63页
        2.2 保守miRNA的鉴定第63-64页
        2.3 新miRNA的鉴定第64-65页
        2.4 miRNA及其靶基因的差异表达分析第65-66页
        2.5 候选B.cinerea响应miRNA及其靶基因的分析第66-69页
        2.6 靶基因表达水平的qRT-PCR验证第69-70页
    3 讨论第70-72页
参考文献第72-85页
致谢第85-86页
攻读学位期间发表的学术论文第86-87页

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