| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 缩略词表 | 第14-17页 |
| 第一部分 文献综述 | 第17-63页 |
| 第一章 大豆分子遗传的研究进展及研究方法 | 第17-62页 |
| 1.1 大豆产量相关性状分子遗传研究进展 | 第17-30页 |
| 1.1.1 大豆分子遗传图谱 | 第17-18页 |
| 1.1.2 大豆产量及产量相关性状的标记和定位 | 第18-30页 |
| 1.1.3 关联分析方法在大豆产量及产量相关QTL位点的挖掘 | 第30页 |
| 1.2 植物数量遗传QTL定位的方法 | 第30-40页 |
| 1.2.1 分子遗传学中的遗传标记 | 第30-32页 |
| 1.2.2 遗传图谱的构建 | 第32-37页 |
| 1.2.3 QTL定位的方法 | 第37-40页 |
| 1.3 关联分析方法在植物数量遗传上的应用 | 第40-61页 |
| 1.3.1 LD的可视化 | 第40-44页 |
| 1.3.2 影响连锁不平衡生物因素 | 第44-47页 |
| 1.3.3 影响连锁不平衡进化因素 | 第47-50页 |
| 1.3.4 关联分析的方法 | 第50-52页 |
| 1.3.5 关联分析的统计检测力 | 第52-53页 |
| 1.3.6 如何开展关联分析 | 第53-57页 |
| 1.3.7 关联分析可用的计算机软件 | 第57-61页 |
| 1.4 关联分析和连锁分析的结合及分子育种策略 | 第61-62页 |
| 本研究的目的意义及内容 | 第62-63页 |
| 第二部分 研究报告 | 第63-149页 |
| 第二章 大豆产量相关农艺性状QTL的检测 | 第63-91页 |
| 2.1 材料与方法 | 第63-65页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第63-64页 |
| 2.1.2 分子遗传连锁图谱 | 第64页 |
| 2.1.3 田间试验设计 | 第64页 |
| 2.1.4 性状测定 | 第64页 |
| 2.1.5 表型数据分析 | 第64-65页 |
| 2.1.6 QTL分析 | 第65页 |
| 2.2 结果与分析 | 第65-87页 |
| 2.2.1 基本统计量描述性分析,方差分析及遗传力 | 第65-72页 |
| 2.2.2 16个产量相关性状的相关分析 | 第72-75页 |
| 2.2.3 采用复合区间作图法检测大豆产量性状QTL | 第75-79页 |
| 2.2.4 采用混合线性模型(MLM)对16个产量相关性状联合分析 | 第79-82页 |
| 2.2.5 16个大豆产量相关性状的上位性QTL定位 | 第82-87页 |
| 2.3 讨论 | 第87-91页 |
| 2.3.1 产量相关农艺性状QTL定位及多环境下检测的稳定性 | 第87-89页 |
| 2.3.2 联合数据分析对结果的影响 | 第89-91页 |
| 第三章 栽培大豆产量相关农艺性状的全基因组关联分析及优异等位变异的挖掘 | 第91-129页 |
| 3.1 材料与方法 | 第92-96页 |
| 3.1.1 试验材料及试点 | 第92-93页 |
| 3.1.2 试验设计及性状测定 | 第93页 |
| 3.1.3 SNP分型及过滤控制 | 第93-94页 |
| 3.1.4 数据分析 | 第94-96页 |
| 3.2 结果与分析 | 第96-123页 |
| 3.2.1 大豆产量相关农艺性状的表型变异 | 第96-103页 |
| 3.2.2 产量农艺性状之间的相关分析,聚类分析和主成分分析 | 第103-107页 |
| 3.2.3 群体结构,遗传亲缘关系及遗传多样性 | 第107-112页 |
| 3.2.4 LD衰减 | 第112页 |
| 3.2.5 产量相关农艺性状的全基因组关联分析 | 第112-121页 |
| 3.2.6 产量相关农艺性状的优异等位变异的挖掘 | 第121-123页 |
| 3.3 讨论 | 第123-129页 |
| 3.3.1 大豆产量性状的表型变异及相关 | 第123-124页 |
| 3.3.2 群体结构及连锁不平衡对关联分析的影响 | 第124-125页 |
| 3.3.3 大豆产量相关性状的关联位点及优异等位的挖掘 | 第125-129页 |
| 第四章 野生大豆产量相关农艺性状的关联分析及优异等位变异挖掘 | 第129-149页 |
| 4.1 材料与方法 | 第131-133页 |
| 4.1.1 试验材料及性状调查 | 第131页 |
| 4.1.2 DNA提取,PCR和SSR标记分型 | 第131-132页 |
| 4.1.3 表型分析,群体结构控制及关联分析 | 第132-133页 |
| 4.2 结果与分析 | 第133-145页 |
| 4.2.1 野生大豆产量相关性状的表型变异 | 第133-137页 |
| 4.2.2 产量农艺性状之间的相关关系 | 第137-138页 |
| 4.2.3 野生大豆群体11个农艺性状与SSR标记多环境下的关联分析 | 第138-140页 |
| 4.2.4 相关性状关联位点优异等位变异的挖掘 | 第140-145页 |
| 4.3 讨论 | 第145-149页 |
| 4.3.1 群体结构对关联分析的影响 | 第145页 |
| 4.3.2 野生大豆产量相关性状的QTL的鉴定及稳定性 | 第145-146页 |
| 4.3.3 野生大豆作为重要的作物改良资源应用价值 | 第146-149页 |
| 全文结论 | 第149-151页 |
| 本研究主要创新之处 | 第151-153页 |
| 参考文献 | 第153-171页 |
| 附录 | 第171-177页 |
| 攻读博士期间发表的论文 | 第177-179页 |
| 致谢 | 第179-180页 |
