| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 引言 | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-35页 |
| 1 植物花芽分化研究进展 | 第15-19页 |
| 1.1 高等植物花芽分化 | 第15-16页 |
| 1.2 影响花芽分化的主要因素 | 第16-18页 |
| 1.3 植物花芽分化的形态学研究 | 第18页 |
| 1.4 菊花花芽分化的研究进展 | 第18-19页 |
| 2 植物开花研究进展 | 第19-26页 |
| 2.1 植物开花的分子机制研究进展 | 第19-25页 |
| 2.2 菊花开花分子机制的研究进展 | 第25-26页 |
| 3 RNA-seq技术在转录组学研究中的应用 | 第26-27页 |
| 4 BBX转录因子家族 | 第27-35页 |
| 4.1 BBX转录因子家族的结构特点、分类、起源及进化 | 第28-32页 |
| 4.2 BBX转录因子家族的生物学功能 | 第32-35页 |
| 第二章 基于RNA-seq的夏菊'优香'不同光周期 花芽分化的转录组分析 | 第35-77页 |
| 1 材料与方法 | 第36-40页 |
| 1.1 供试材料 | 第37页 |
| 1.2 试验方法 | 第37-40页 |
| 2 结果与分析 | 第40-68页 |
| 2.1 测序产量统计 | 第40-41页 |
| 2.2 de novo组装结果 | 第41页 |
| 2.3 基因功能注释结果 | 第41-50页 |
| 2.4 不同光周期花芽分化转录组比较分析 | 第50-66页 |
| 2.5 差异显著表达基因的qPCR验证 | 第66-68页 |
| 3 讨论 | 第68-77页 |
| 3.1 高通量测序技术在研究菊花花芽分化中的优势 | 第68页 |
| 3.2 菊花'优香'花芽分化转录组数据的特点 | 第68-69页 |
| 3.3 菊花'优香'中的开花调控途径 | 第69-70页 |
| 3.4 菊花'优香'响应不同光周期开花的分子机制 | 第70-73页 |
| 3.5 参与菊花'优香'花芽分化的转录因子家族 | 第73-77页 |
| 第三章 菊花脑响应低温的转录组分析 | 第77-107页 |
| 1 材料与方法 | 第78-81页 |
| 1.1 供试材料 | 第78-79页 |
| 1.2 试验方法 | 第79-81页 |
| 2 结果与分析 | 第81-102页 |
| 2.1 RNA-seq数据库概要分析和clean reads的比对分析 | 第81-83页 |
| 2.2 转录本量化和差异显著基因 | 第83-85页 |
| 2.3 差异表达基因的GO分类 | 第85-87页 |
| 2.4 差异表达基因的KEGG分类 | 第87页 |
| 2.5 差异显著表达基因概述 | 第87-88页 |
| 2.6 差异显著表达基因的qPCR验证 | 第88-102页 |
| 3 讨论 | 第102-107页 |
| 3.1 菊花莉花脑低温响应的整体转录模式 | 第102页 |
| 3.2 低温感知及信号转导相关基因 | 第102-103页 |
| 3.3 转录因子与低温响应 | 第103-104页 |
| 3.4 转录后调控基因与低温响应 | 第104-105页 |
| 3.5 功能基因与低温响应 | 第105-107页 |
| 第四章 菊花BBX转录因子家族的克隆及表达分析 | 第107-129页 |
| 1 材料与方法 | 第108-113页 |
| 1.1 植物材料,表达载体与菌株 | 第108-109页 |
| 1.2 菊花BBX转录因子的克隆 | 第109页 |
| 1.3 序列分析及系统进化树构建 | 第109页 |
| 1.4 CmBBXs的表达特性分析 | 第109-110页 |
| 1.5 CmBBXs的亚细胞定位分析 | 第110-112页 |
| 1.6 CmBBXs的转录激活活性分析 | 第112-113页 |
| 2 结果与分析 | 第113-126页 |
| 2.1 菊花BBX转录因子的克隆 | 第113-114页 |
| 2.2 多序列比对和系统进化分析 | 第114-116页 |
| 2.3 CmBBXs在不同组织的表达模式 | 第116-118页 |
| 2.4 CmBBXs在花芽分化过程中的表达模式 | 第118页 |
| 2.5 CmBBXs在低温和盐胁迫的响应模式 | 第118页 |
| 2.6 CmBBXs对植物激素ABA的响应模式 | 第118-124页 |
| 2.7 CmBBXs亚细胞定位分析 | 第124-125页 |
| 2.8 CmBBXs转录激活性分析 | 第125-126页 |
| 3 讨论 | 第126-129页 |
| 全文结论 | 第129-131页 |
| 创新点 | 第131-133页 |
| 不足之处 | 第133-135页 |
| 参考文献 | 第135-157页 |
| 附录 | 第157-183页 |
| 攻读学位期间发表论文、申请专利及参与的科研项目 | 第183-185页 |
| 致谢 | 第185-186页 |
