基于多序列比对的NGS基因纠错--云计算平台下的设计实现
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-14页 |
| 1.1 研究背景 | 第8-9页 |
| 1.2 研究意义 | 第9-11页 |
| 1.3 研究现状 | 第11-13页 |
| 1.4 课题主要研究内容 | 第13-14页 |
| 第二章 序列比对以及相关知识的介绍 | 第14-22页 |
| 2.1 基因测序技术 | 第14-15页 |
| 2.2 序列比对 | 第15-16页 |
| 2.3 序列比对算法 | 第16-21页 |
| 2.3.1 双序列比对算法 | 第16-17页 |
| 2.3.2 多序列比对算法 | 第17-20页 |
| 2.3.3 现有算法的局限性 | 第20-21页 |
| 2.4 本章小结 | 第21-22页 |
| 第三章 基于多序列比对NGS基因纠错的改进与实现 | 第22-42页 |
| 3.1 数据预处理 | 第22-29页 |
| 3.2 常用算法 | 第29-32页 |
| 3.2.1 Coral | 第29-30页 |
| 3.2.2 ECHO | 第30-32页 |
| 3.3 MSAC算法设计 | 第32-38页 |
| 3.3.1 MSAC算法改进思路 | 第32-33页 |
| 3.3.2 MSAC算法描述 | 第33-34页 |
| 3.3.3 MSAC算法过程 | 第34-38页 |
| 3.4 MSAC算法在云计算平台上的实现 | 第38-40页 |
| 3.4.1 云计算平台介绍 | 第38-39页 |
| 3.4.2 MSAC算法在SPARK平台上的实现 | 第39-40页 |
| 3.5 本章小结 | 第40-42页 |
| 第四章 实验目的、结果比较与分析 | 第42-56页 |
| 4.1 实验平台 | 第42页 |
| 4.2 实验目的 | 第42页 |
| 4.3 实验过程 | 第42-49页 |
| 4.3.1 纠错软件及原理简介 | 第42-43页 |
| 4.3.2 程序运行方法 | 第43-47页 |
| 4.3.3 数据映射及评分 | 第47-49页 |
| 4.4 实验结果 | 第49-51页 |
| 4.5 纠错性能分析 | 第51-55页 |
| 4.6 本章小结 | 第55-56页 |
| 第五章 总结与未来工作的展望 | 第56-58页 |
| 5.1 总结 | 第56页 |
| 5.2 未来工作展望 | 第56-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-61页 |
