| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-13页 |
| 缩略词表 | 第13-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-25页 |
| ·唾液乳杆菌及其益生功效 | 第15页 |
| ·L.salrvarius Ren简介 | 第15页 |
| ·肠道内的胆盐及胆盐胁迫 | 第15-17页 |
| ·人体内胆盐的组成与代谢 | 第16-17页 |
| ·胆盐对细菌的毒害作用 | 第17页 |
| ·乳杆菌的胆盐胁迫抗性机制 | 第17-19页 |
| ·胆盐水解酶 | 第17-18页 |
| ·细胞膜结构的改变 | 第18页 |
| ·胆盐转运系统 | 第18-19页 |
| ·乳杆菌胆盐胁迫应激机制的组学研究 | 第19-20页 |
| ·胆盐胁迫应激中的转录调控机制研究 | 第20-22页 |
| ·转录因子与乳杆菌胆盐胁迫应激 | 第20-21页 |
| ·细菌单杂交 | 第21-22页 |
| ·本研究的目的及意义 | 第22-25页 |
| ·研究目的意义 | 第22-23页 |
| ·研究内容 | 第23-24页 |
| ·技术路线 | 第24-25页 |
| 第二章 L.salivarius Ren胆盐胁迫条件下转录组和蛋白组图谱的建立 | 第25-46页 |
| ·材料与试剂 | 第25-27页 |
| ·菌株 | 第25页 |
| ·试剂 | 第25页 |
| ·试剂的配制 | 第25-26页 |
| ·仪器设备 | 第26-27页 |
| ·实验方法 | 第27-31页 |
| ·L.salivarius Ren胆盐胁迫处理条件的确定 | 第27页 |
| ·L.salivarius Ren胆盐胁迫条件下转录组的测定 | 第27-28页 |
| ·转录组测序数据的处理 | 第28页 |
| ·L.salivarius Ren胆盐胁迫条件下蛋白组的测定 | 第28-30页 |
| ·蛋白组数据的处理 | 第30-31页 |
| ·数据统计分析 | 第31页 |
| ·结果与分析 | 第31-45页 |
| ·L.salivarius Ren胆盐胁迫条件的确定 | 第31-32页 |
| ·L.salivarius Ren胆盐胁迫条件下转录谱的建立 | 第32-39页 |
| ·L.salivarius Ren胆盐胁迫条件下蛋白质图谱的建立 | 第39-41页 |
| ·差异表达蛋白的质谱鉴定 | 第41-45页 |
| ·讨论 | 第45-46页 |
| 第三章 生物信息学预测L.salivarius Ren的胆盐胁迫应激机制 | 第46-54页 |
| ·生物信息学分析工具 | 第46页 |
| ·生物信息学分析方法 | 第46页 |
| ·结果与讨论 | 第46-54页 |
| ·中心代谢途径的调整 | 第46-49页 |
| ·胆盐胁迫抗性机制 | 第49-51页 |
| ·普遍胁迫响应机制 | 第51页 |
| ·基因转录、翻译及菌体增殖减缓 | 第51-52页 |
| ·转录调控因子的变化 | 第52-53页 |
| ·未知功能基因 | 第53-54页 |
| 第四章 转录因子TF0225在L.salivarius Ren胆盐胁迫应激中的功能分析 | 第54-80页 |
| ·材料与试剂 | 第54-60页 |
| ·菌株和质粒 | 第54-55页 |
| ·试剂 | 第55页 |
| ·试剂的配制 | 第55-60页 |
| ·仪器设备 | 第60页 |
| ·实验方法 | 第60-70页 |
| ·转录因子TF0225同源超量表达重组菌株的构建 | 第60-63页 |
| ·TF0225超量表达菌株胆盐耐受能力分析 | 第63-64页 |
| ·细菌单杂交诱饵载体pB 1H2w2-25的构建 | 第64页 |
| ·Western blot检测Omega-0225融合蛋白的表达 | 第64-66页 |
| ·细菌单杂交预测TF0225的DNA结合序列 | 第66-67页 |
| ·生物信息学分析预测TF0225的靶基因 | 第67-68页 |
| ·RT-qPCR检测TF0225对靶基因oppA的转录调控 | 第68-70页 |
| ·结果与分析 | 第70-79页 |
| ·转录因子TF0225同源超量表达载体的构建 | 第70-72页 |
| ·重组菌株胆盐胁迫耐受能力分析 | 第72-73页 |
| ·转录因子TF0225在细菌单杂交宿主E.coli USO中的表达 | 第73-74页 |
| ·细菌单杂交预测TF0225的DNA识别序列 | 第74-75页 |
| ·Target Explorer预测TF0225调控的靶基因 | 第75-77页 |
| ·RT-qPCR验证TF0225对靶基因oppA的调控 | 第77-79页 |
| ·讨论 | 第79-80页 |
| 第五章 靶基因oppA在L.salivarius Ren胆盐胁迫抗性中的功能分析 | 第80-92页 |
| ·材料与试剂 | 第80-82页 |
| ·菌株和质粒 | 第80页 |
| ·试剂 | 第80-81页 |
| ·试剂的配制 | 第81页 |
| ·仪器设备 | 第81-82页 |
| ·实验方法 | 第82-85页 |
| ·oppA基因的PCR扩增 | 第82页 |
| ·重组质粒p11-oppA的构建 | 第82-83页 |
| ·oppA超量表达菌株的构建 | 第83页 |
| ·OppA蛋白物理化学性质预测 | 第83页 |
| ·SDS-PAGE检测OppA蛋白的超量表达 | 第83-84页 |
| ·重组菌株LSRoppA胆盐胁迫抗性能力分析 | 第84页 |
| ·重组菌株LSRoppA对单组分胆盐的耐受偏好性分析 | 第84页 |
| ·重组菌株LSRoppA对于其他胁迫的耐受能力分析 | 第84-85页 |
| ·结果与分析 | 第85-90页 |
| ·oppA基因的扩增 | 第85页 |
| ·OppA超量表达重组质粒的构建 | 第85-86页 |
| ·OppA超量表达菌株的构建 | 第86页 |
| ·OppA蛋白序列分析 | 第86-87页 |
| ·SDS-PAGE检测OppA蛋白的超量表达 | 第87-88页 |
| ·重组菌株LSRoppA胆盐胁迫抗性能力分析 | 第88-89页 |
| ·重组菌株LSRoppA对单组分胆盐的耐受偏好性分析 | 第89页 |
| ·重组菌株LSRoppA对于其他胁迫的耐受能力分析 | 第89-90页 |
| ·讨论 | 第90-92页 |
| 第六章 全文总结与展望 | 第92-95页 |
| ·全文总结 | 第92页 |
| ·创新点 | 第92-93页 |
| ·展望 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-102页 |
| 致谢 | 第102-103页 |
| 附录 | 第103-105页 |
| 个人简介 | 第105页 |
