| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 1 绪论 | 第11-46页 |
| ·问题的提出 | 第11-14页 |
| ·研究现状 | 第14-26页 |
| ·核心概念的界定 | 第26-40页 |
| ·研究意义 | 第40-42页 |
| ·研究方法和思路 | 第42-46页 |
| 2 历史之镜：大学院系设置的历史变迁与现状审视 | 第46-78页 |
| ·现代大学院系设置的变迁历程 | 第46-61页 |
| ·我国大学院系设置的现状审视 | 第61-78页 |
| 3 逻辑与理论：大学院系设置改革的依据 | 第78-109页 |
| ·学科逻辑：知识的分化与融合 | 第78-92页 |
| ·管理逻辑：知识管理与科层管理 | 第92-104页 |
| ·理论基石：院系设置改革的工具 | 第104-109页 |
| 4 取向与原则：研究型大学院系设置改革的基本策略 | 第109-124页 |
| ·研究型大学的特征探析 | 第110-113页 |
| ·院系设置改革的取向 | 第113-117页 |
| ·院系设置改革的基本原则 | 第117-124页 |
| 5 理想与现实：院系设置的模式构建与实践探索 | 第124-164页 |
| ·研究型大学院系设置的理想模式 | 第125-145页 |
| ·中国研究型大学院系设置的实践探索：多个案例的分析 | 第145-158页 |
| ·对现阶段中国研究型大学院系设置的反思 | 第158-164页 |
| 6 结语 | 第164-172页 |
| ·全文小结 | 第164-166页 |
| ·中国研究型大学院系设置的未来走向 | 第166-170页 |
| ·本研究的创新与不足 | 第170-172页 |
| 致谢 | 第172-175页 |
| 参考文献 | 第175-187页 |
| 附录1：访谈提纲 | 第187-189页 |
| 附录2：浙江大学院系设置图 | 第189-191页 |
| 附录3：华中科技大学院系设置图 | 第191-192页 |
| 附录4：北京师范大学院系设置图 | 第192-193页 |
| 附录5：华中科技大学学术机构设置细则(2012年) | 第193-196页 |
| 附录6：攻读博士学位期间发表的论文和参与的课题 | 第196页 |